MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021050	CGAA	2	8	67964	67971	50 %	0 %	25 %	25 %	482545144
1502	NC_021050	GCT	2	6	68052	68057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545144
1503	NC_021050	CAT	2	6	68118	68123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545144
1504	NC_021050	GA	3	6	68131	68136	50 %	0 %	50 %	0 %	482545144
1505	NC_021050	GAGG	2	8	68190	68197	25 %	0 %	75 %	0 %	482545144
1506	NC_021050	TTA	2	6	68256	68261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545144
1507	NC_021050	A	6	6	68500	68505	100 %	0 %	0 %	0 %	482545145
1508	NC_021050	GT	3	6	68580	68585	0 %	50 %	50 %	0 %	482545145
1509	NC_021050	TTC	2	6	68613	68618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545145
1510	NC_021050	A	7	7	68889	68895	100 %	0 %	0 %	0 %	482545145
1511	NC_021050	GAT	2	6	68905	68910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545145
1512	NC_021050	TTC	2	6	69005	69010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545145
1513	NC_021050	A	6	6	69181	69186	100 %	0 %	0 %	0 %	482545145
1514	NC_021050	TCC	2	6	69204	69209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545145
1515	NC_021050	AGG	3	9	69216	69224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545145
1516	NC_021050	ATTAGG	2	12	69315	69326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545145
1517	NC_021050	GCG	2	6	69328	69333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545145
1518	NC_021050	ATT	2	6	69338	69343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545145
1519	NC_021050	AGC	2	6	69404	69409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545145
1520	NC_021050	GTA	2	6	69473	69478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545145
1521	NC_021050	T	6	6	69513	69518	0 %	100 %	0 %	0 %	482545145
1522	NC_021050	CAGC	2	8	69565	69572	25 %	0 %	25 %	50 %	482545145
1523	NC_021050	TTC	2	6	69641	69646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545145
1524	NC_021050	TCGT	2	8	69684	69691	0 %	50 %	25 %	25 %	482545145
1525	NC_021050	AG	3	6	69710	69715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021050	CTGT	2	8	69783	69790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_021050	TTCT	2	8	69941	69948	0 %	75 %	0 %	25 %	482545146
1528	NC_021050	TCC	2	6	69972	69977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545146
1529	NC_021050	TAT	2	6	70015	70020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545146
1530	NC_021050	CGT	2	6	70039	70044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545146
1531	NC_021050	GC	3	6	70047	70052	0 %	0 %	50 %	50 %	482545146
1532	NC_021050	TGT	2	6	70083	70088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545146
1533	NC_021050	TGA	2	6	70107	70112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545146
1534	NC_021050	GCA	2	6	70117	70122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545146
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1536	NC_021050	A	6	6	70234	70239	100 %	0 %	0 %	0 %	482545146
1537	NC_021050	GAA	2	6	70245	70250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545146
1538	NC_021050	TC	3	6	70283	70288	0 %	50 %	0 %	50 %	482545146
1539	NC_021050	A	6	6	70307	70312	100 %	0 %	0 %	0 %	482545146
1540	NC_021050	GA	3	6	70322	70327	50 %	0 %	50 %	0 %	482545146
1541	NC_021050	CTT	2	6	70469	70474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545146
1542	NC_021050	AGA	2	6	70479	70484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545146
1543	NC_021050	TTC	2	6	70488	70493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545146
1544	NC_021050	CTT	2	6	70499	70504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545146
1545	NC_021050	CAA	2	6	70535	70540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545146
1546	NC_021050	T	6	6	70594	70599	0 %	100 %	0 %	0 %	482545146
1547	NC_021050	AAC	2	6	70641	70646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545146
1548	NC_021050	TCT	3	9	70648	70656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545146
1549	NC_021050	CTTAA	2	10	70665	70674	40 %	40 %	0 %	20 %	482545146
1550	NC_021050	CGG	2	6	70691	70696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545147
1551	NC_021050	AGC	2	6	70727	70732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545147
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1553	NC_021050	TGC	2	6	70748	70753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545147
1554	NC_021050	TTC	2	6	70768	70773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545147
1555	NC_021050	GAC	2	6	70837	70842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545147
1556	NC_021050	AAAT	2	8	70857	70864	75 %	25 %	0 %	0 %	482545147
1557	NC_021050	TTG	2	6	70882	70887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545147
1558	NC_021050	ATAG	2	8	70925	70932	50 %	25 %	25 %	0 %	482545147
1559	NC_021050	TCA	2	6	70952	70957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545147
1560	NC_021050	AG	3	6	71059	71064	50 %	0 %	50 %	0 %	482545147
1561	NC_021050	CCA	2	6	71067	71072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545147
1562	NC_021050	TTC	2	6	71104	71109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545147
1563	NC_021050	GAT	2	6	71124	71129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545147
1564	NC_021050	CCTT	2	8	71230	71237	0 %	50 %	0 %	50 %	482545147
1565	NC_021050	T	6	6	71236	71241	0 %	100 %	0 %	0 %	482545147
1566	NC_021050	AGT	2	6	71323	71328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545147
1567	NC_021050	GTA	2	6	71405	71410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545147
1568	NC_021050	T	6	6	71416	71421	0 %	100 %	0 %	0 %	482545147
1569	NC_021050	TAA	2	6	71447	71452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545147
1570	NC_021050	GCTT	2	8	71467	71474	0 %	50 %	25 %	25 %	482545147
1571	NC_021050	GGA	2	6	71475	71480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545147
1572	NC_021050	ATT	2	6	71488	71493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545147
1573	NC_021050	GAT	3	9	71515	71523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545148
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1584	NC_021050	TTG	2	6	72113	72118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545148
1585	NC_021050	GAG	2	6	72218	72223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545148
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1588	NC_021050	CCCTGA	2	12	72311	72322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482545148
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1592	NC_021050	A	7	7	72507	72513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021050	A	6	6	72515	72520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021050	AT	5	10	72551	72560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021050	AGG	2	6	72563	72568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021050	A	6	6	72602	72607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_021050	TTC	2	6	72770	72775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545149
1600	NC_021050	AAG	2	6	72812	72817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545149
1601	NC_021050	TTC	2	6	72838	72843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545149
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1603	NC_021050	TTG	2	6	72921	72926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545149
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1606	NC_021050	GA	3	6	73027	73032	50 %	0 %	50 %	0 %	482545149
1607	NC_021050	TCT	2	6	73050	73055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545149
1608	NC_021050	AGTG	2	8	73091	73098	25 %	25 %	50 %	0 %	482545149
1609	NC_021050	TTC	2	6	73155	73160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545149
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1611	NC_021050	TAA	2	6	73235	73240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545149
1612	NC_021050	GAGT	2	8	73261	73268	25 %	25 %	50 %	0 %	482545149
1613	NC_021050	AGA	2	6	73277	73282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545149
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1624	NC_021050	TA	3	6	73785	73790	50 %	50 %	0 %	0 %	482545150
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1628	NC_021050	T	6	6	73948	73953	0 %	100 %	0 %	0 %	482545150
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1650	NC_021050	TTC	2	6	74628	74633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1752	NC_021050	AAGA	2	8	79671	79678	75 %	0 %	25 %	0 %	482545155
1753	NC_021050	AC	3	6	79688	79693	50 %	0 %	0 %	50 %	482545155
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