MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021050	GGT	2	6	21150	21155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545100
502	NC_021050	TTTC	2	8	21212	21219	0 %	75 %	0 %	25 %	482545100
503	NC_021050	CTT	2	6	21276	21281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545100
504	NC_021050	T	6	6	21298	21303	0 %	100 %	0 %	0 %	482545100
505	NC_021050	AAG	2	6	21324	21329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545100
506	NC_021050	GCA	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545100
507	NC_021050	GTA	2	6	21404	21409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545100
508	NC_021050	CT	3	6	21453	21458	0 %	50 %	0 %	50 %	482545100
509	NC_021050	GGA	2	6	21460	21465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545100
510	NC_021050	G	6	6	21469	21474	0 %	0 %	100 %	0 %	482545100
511	NC_021050	TCT	2	6	21532	21537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545100
512	NC_021050	T	6	6	21556	21561	0 %	100 %	0 %	0 %	482545100
513	NC_021050	TGA	2	6	21577	21582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545100
514	NC_021050	AAG	2	6	21603	21608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545100
515	NC_021050	TTA	2	6	21653	21658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545100
516	NC_021050	CTT	2	6	21672	21677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545100
517	NC_021050	AAG	2	6	21690	21695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545100
518	NC_021050	TATC	2	8	21731	21738	25 %	50 %	0 %	25 %	482545100
519	NC_021050	ATC	2	6	21785	21790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545100
520	NC_021050	CT	3	6	21809	21814	0 %	50 %	0 %	50 %	482545100
521	NC_021050	AAG	2	6	21822	21827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545100
522	NC_021050	TC	3	6	21906	21911	0 %	50 %	0 %	50 %	482545100
523	NC_021050	A	7	7	21935	21941	100 %	0 %	0 %	0 %	482545100
524	NC_021050	GC	3	6	21975	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	482545100
525	NC_021050	AG	3	6	22046	22051	50 %	0 %	50 %	0 %	482545100
526	NC_021050	TCGG	2	8	22084	22091	0 %	25 %	50 %	25 %	482545100
527	NC_021050	CAG	2	6	22094	22099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545100
528	NC_021050	AAG	2	6	22107	22112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545100
529	NC_021050	AAG	2	6	22170	22175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545100
530	NC_021050	ATT	2	6	22230	22235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545100
531	NC_021050	AGA	2	6	22246	22251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545100
532	NC_021050	TTCC	2	8	22254	22261	0 %	50 %	0 %	50 %	482545100
533	NC_021050	GAG	2	6	22262	22267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545100
534	NC_021050	ATG	2	6	22317	22322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545100
535	NC_021050	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	482545100
536	NC_021050	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	482545100
537	NC_021050	GCT	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545101
538	NC_021050	CAG	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545101
539	NC_021050	GA	3	6	22563	22568	50 %	0 %	50 %	0 %	482545101
540	NC_021050	TCT	2	6	22591	22596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545101
541	NC_021050	AGC	2	6	22626	22631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545101
542	NC_021050	GA	3	6	22670	22675	50 %	0 %	50 %	0 %	482545101
543	NC_021050	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545101
544	NC_021050	AGA	2	6	22776	22781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545101
545	NC_021050	GA	3	6	22814	22819	50 %	0 %	50 %	0 %	482545101
546	NC_021050	GTT	2	6	22827	22832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545101
547	NC_021050	TAT	2	6	22877	22882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545101
548	NC_021050	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	482545101
549	NC_021050	TCA	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545101
550	NC_021050	TG	3	6	23008	23013	0 %	50 %	50 %	0 %	482545101
551	NC_021050	TC	4	8	23183	23190	0 %	50 %	0 %	50 %	482545102
552	NC_021050	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	482545102
553	NC_021050	GCA	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545102
554	NC_021050	ACG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545102
555	NC_021050	AAT	2	6	23304	23309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545102
556	NC_021050	GTT	2	6	23417	23422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545102
557	NC_021050	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545102
558	NC_021050	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	482545102
559	NC_021050	GAA	2	6	23592	23597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
560	NC_021050	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	482545102
561	NC_021050	TTG	2	6	23679	23684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545102
562	NC_021050	AGA	3	9	23687	23695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
563	NC_021050	GAA	2	6	23748	23753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
564	NC_021050	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545102
565	NC_021050	GAA	2	6	23925	23930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545102
566	NC_021050	TTA	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545102
567	NC_021050	TCT	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545102
568	NC_021050	AGG	2	6	24227	24232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545102
569	NC_021050	AAAG	2	8	24239	24246	75 %	0 %	25 %	0 %	482545102
570	NC_021050	GTT	2	6	24309	24314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545103
571	NC_021050	CGA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
572	NC_021050	AGC	2	6	24342	24347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
573	NC_021050	AGC	2	6	24370	24375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
574	NC_021050	CTC	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545103
575	NC_021050	GGAT	2	8	24519	24526	25 %	25 %	50 %	0 %	482545103
576	NC_021050	AG	3	6	24559	24564	50 %	0 %	50 %	0 %	482545103
577	NC_021050	CTA	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545103
578	NC_021050	T	6	6	24703	24708	0 %	100 %	0 %	0 %	482545103
579	NC_021050	AGC	2	6	24753	24758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545103
580	NC_021050	ATG	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545103
581	NC_021050	CTCC	2	8	24844	24851	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
582	NC_021050	TCTGCA	2	12	24857	24868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021050	T	8	8	24872	24879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021050	A	6	6	24881	24886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021050	AG	3	6	24913	24918	50 %	0 %	50 %	0 %	482545104
586	NC_021050	A	7	7	24936	24942	100 %	0 %	0 %	0 %	482545104
587	NC_021050	T	7	7	24951	24957	0 %	100 %	0 %	0 %	482545104
588	NC_021050	TGT	2	6	24976	24981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545104
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590	NC_021050	CAA	2	6	25064	25069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545104
591	NC_021050	CCGA	2	8	25090	25097	25 %	0 %	25 %	50 %	482545105
592	NC_021050	TTC	2	6	25175	25180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545105
593	NC_021050	GAA	2	6	25258	25263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545105
594	NC_021050	AAC	2	6	25298	25303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545105
595	NC_021050	GGC	2	6	25349	25354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545105
596	NC_021050	TGC	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545105
597	NC_021050	TGTGAT	2	12	25499	25510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	482545105
598	NC_021050	AGC	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545105
599	NC_021050	ATG	2	6	25590	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545105
600	NC_021050	GGA	2	6	25713	25718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545105
601	NC_021050	TTC	2	6	25736	25741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545105
602	NC_021050	TCG	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545105
603	NC_021050	GAG	2	6	25780	25785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545105
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605	NC_021050	CTC	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545105
606	NC_021050	TTC	2	6	25889	25894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545105
607	NC_021050	A	7	7	25924	25930	100 %	0 %	0 %	0 %	482545105
608	NC_021050	TAT	2	6	25931	25936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545105
609	NC_021050	GTT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545105
610	NC_021050	AAG	2	6	26172	26177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545106
611	NC_021050	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545106
612	NC_021050	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	482545106
613	NC_021050	TGT	2	6	26220	26225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545106
614	NC_021050	T	6	6	26300	26305	0 %	100 %	0 %	0 %	482545106
615	NC_021050	CTT	2	6	26337	26342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021050	CGAG	2	8	26408	26415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_021050	T	7	7	26493	26499	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
618	NC_021050	GA	3	6	26504	26509	50 %	0 %	50 %	0 %	482545107
619	NC_021050	AG	3	6	26559	26564	50 %	0 %	50 %	0 %	482545107
620	NC_021050	TGT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545107
621	NC_021050	AAAG	2	8	26647	26654	75 %	0 %	25 %	0 %	482545107
622	NC_021050	T	6	6	26674	26679	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
623	NC_021050	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	482545107
624	NC_021050	GTT	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545107
625	NC_021050	T	6	6	26759	26764	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
626	NC_021050	T	6	6	26838	26843	0 %	100 %	0 %	0 %	482545107
627	NC_021050	GGT	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545107
628	NC_021050	AGA	2	6	26981	26986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545107
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