MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021050	TAT	2	6	255037	255042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545299
5502	NC_021050	GGC	2	6	255043	255048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545299
5503	NC_021050	TGC	2	6	255088	255093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545299
5504	NC_021050	TA	3	6	255114	255119	50 %	50 %	0 %	0 %	482545299
5505	NC_021050	CTGAA	2	10	255222	255231	40 %	20 %	20 %	20 %	482545299
5506	NC_021050	ATCT	2	8	255270	255277	25 %	50 %	0 %	25 %	482545299
5507	NC_021050	CAC	2	6	255335	255340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545299
5508	NC_021050	T	6	6	255369	255374	0 %	100 %	0 %	0 %	482545299
5509	NC_021050	CAAGA	2	10	255410	255419	60 %	0 %	20 %	20 %	482545299
5510	NC_021050	CTT	2	6	255420	255425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545299
5511	NC_021050	GAT	2	6	255545	255550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545299
5512	NC_021050	GCTAT	2	10	255584	255593	20 %	40 %	20 %	20 %	482545299
5513	NC_021050	AGG	2	6	255604	255609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545299
5514	NC_021050	TTAA	2	8	255650	255657	50 %	50 %	0 %	0 %	482545299
5515	NC_021050	GAA	2	6	255669	255674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545299
5516	NC_021050	TTA	2	6	255693	255698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545299
5517	NC_021050	CAG	2	6	255714	255719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545299
5518	NC_021050	GGT	2	6	255734	255739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545299
5519	NC_021050	ATG	2	6	255843	255848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545299
5520	NC_021050	AGCT	2	8	255856	255863	25 %	25 %	25 %	25 %	482545299
5521	NC_021050	TTC	2	6	255878	255883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545299
5522	NC_021050	GAT	2	6	255926	255931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545299
5523	NC_021050	GAA	2	6	255959	255964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545299
5524	NC_021050	GAA	2	6	255980	255985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545299
5525	NC_021050	GA	3	6	256008	256013	50 %	0 %	50 %	0 %	482545299
5526	NC_021050	AAG	2	6	256025	256030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545299
5527	NC_021050	ATCC	2	8	256107	256114	25 %	25 %	0 %	50 %	482545299
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5532	NC_021050	TGAT	2	8	256317	256324	25 %	50 %	25 %	0 %	482545299
5533	NC_021050	CAA	2	6	256338	256343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545299
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5541	NC_021050	GAA	2	6	256849	256854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545299
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5543	NC_021050	A	6	6	257066	257071	100 %	0 %	0 %	0 %	482545299
5544	NC_021050	A	6	6	257099	257104	100 %	0 %	0 %	0 %	482545299
5545	NC_021050	TAT	2	6	257120	257125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545299
5546	NC_021050	TCA	2	6	257135	257140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545299
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5552	NC_021050	GAA	2	6	257270	257275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545299
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5554	NC_021050	CAAC	2	8	257417	257424	50 %	0 %	0 %	50 %	482545300
5555	NC_021050	ATT	2	6	257458	257463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545300
5556	NC_021050	GCG	2	6	257555	257560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545300
5557	NC_021050	T	6	6	257582	257587	0 %	100 %	0 %	0 %	482545300
5558	NC_021050	AG	3	6	257597	257602	50 %	0 %	50 %	0 %	482545300
5559	NC_021050	TTGG	2	8	257604	257611	0 %	50 %	50 %	0 %	482545300
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5563	NC_021050	GAAA	2	8	257747	257754	75 %	0 %	25 %	0 %	482545300
5564	NC_021050	TGC	2	6	257777	257782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545300
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5570	NC_021050	TCCTT	2	10	257944	257953	0 %	60 %	0 %	40 %	482545300
5571	NC_021050	GAT	2	6	257969	257974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545300
5572	NC_021050	TTGAT	2	10	258037	258046	20 %	60 %	20 %	0 %	482545300
5573	NC_021050	AGA	2	6	258059	258064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545300
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5581	NC_021050	T	8	8	258494	258501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021050	ATA	2	6	258511	258516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021050	TTA	2	6	258530	258535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_021050	ACT	2	6	258566	258571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5591	NC_021050	T	7	7	258961	258967	0 %	100 %	0 %	0 %	482545301
5592	NC_021050	A	6	6	258995	259000	100 %	0 %	0 %	0 %	482545301
5593	NC_021050	ATG	2	6	259081	259086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545301
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5599	NC_021050	ATG	2	6	259395	259400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_021050	T	6	6	259408	259413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021050	ATG	2	6	259424	259429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545302
5602	NC_021050	GATA	2	8	259438	259445	50 %	25 %	25 %	0 %	482545302
5603	NC_021050	GGT	2	6	259492	259497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545302
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5618	NC_021050	T	6	6	260067	260072	0 %	100 %	0 %	0 %	482545303
5619	NC_021050	TAA	2	6	260124	260129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545303
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5621	NC_021050	GTT	2	6	260265	260270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545303
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5623	NC_021050	AGC	2	6	260308	260313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545303
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5625	NC_021050	T	8	8	260362	260369	0 %	100 %	0 %	0 %	482545303
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5644	NC_021050	ACAGGA	2	12	261164	261175	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482545305
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5656	NC_021050	TA	3	6	261620	261625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5657	NC_021050	ATT	2	6	261632	261637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5664	NC_021050	T	8	8	261903	261910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5874	NC_021050	GAAG	2	8	272416	272423	50 %	0 %	50 %	0 %	482545314
5875	NC_021050	AAG	2	6	272438	272443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545314
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5879	NC_021050	TTA	2	6	272557	272562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5880	NC_021050	CT	3	6	272566	272571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5881	NC_021050	T	8	8	272571	272578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5882	NC_021050	GT	3	6	272579	272584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5884	NC_021050	TAAG	2	8	272615	272622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5885	NC_021050	A	6	6	272680	272685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5886	NC_021050	AGA	2	6	272733	272738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5997	NC_021050	TTTA	2	8	277979	277986	25 %	75 %	0 %	0 %	482545322
5998	NC_021050	TGA	2	6	278023	278028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545322
5999	NC_021050	AGG	2	6	278029	278034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545322
6000	NC_021050	TGC	2	6	278052	278057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545322

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