MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021050	TGCAG	2	10	232124	232133	20 %	20 %	40 %	20 %	482545280
5002	NC_021050	GAA	3	9	232135	232143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5003	NC_021050	ATT	2	6	232149	232154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545280
5004	NC_021050	GTT	2	6	232157	232162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545280
5005	NC_021050	GGA	2	6	232165	232170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5006	NC_021050	GGAT	2	8	232184	232191	25 %	25 %	50 %	0 %	482545280
5007	NC_021050	TTG	2	6	232202	232207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545280
5008	NC_021050	TAA	2	6	232230	232235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545280
5009	NC_021050	AGG	2	6	232260	232265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5010	NC_021050	GAG	3	9	232340	232348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5011	NC_021050	GAGG	2	8	232415	232422	25 %	0 %	75 %	0 %	482545280
5012	NC_021050	ACA	2	6	232499	232504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545280
5013	NC_021050	GAA	2	6	232525	232530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5014	NC_021050	AAT	2	6	232579	232584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545280
5015	NC_021050	CTTT	2	8	232588	232595	0 %	75 %	0 %	25 %	482545280
5016	NC_021050	TTA	2	6	232619	232624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545280
5017	NC_021050	TCT	2	6	232687	232692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545280
5018	NC_021050	GAA	2	6	232693	232698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5019	NC_021050	AGA	2	6	232708	232713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5020	NC_021050	GGA	2	6	232723	232728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5021	NC_021050	GGC	2	6	232807	232812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545280
5022	NC_021050	TGT	2	6	232896	232901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545280
5023	NC_021050	T	6	6	232901	232906	0 %	100 %	0 %	0 %	482545280
5024	NC_021050	TGA	2	6	232926	232931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545280
5025	NC_021050	AAC	2	6	233014	233019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545280
5026	NC_021050	GAG	2	6	233033	233038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5027	NC_021050	GGA	2	6	233083	233088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5028	NC_021050	TTC	2	6	233109	233114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545280
5029	NC_021050	CTAT	2	8	233138	233145	25 %	50 %	0 %	25 %	482545280
5030	NC_021050	ACG	2	6	233210	233215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545280
5031	NC_021050	AAAG	2	8	233236	233243	75 %	0 %	25 %	0 %	482545280
5032	NC_021050	CTG	2	6	233249	233254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545280
5033	NC_021050	AAAGT	2	10	233321	233330	60 %	20 %	20 %	0 %	482545280
5034	NC_021050	ACA	2	6	233349	233354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545280
5035	NC_021050	GCT	2	6	233434	233439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545280
5036	NC_021050	TCT	2	6	233521	233526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545280
5037	NC_021050	GAA	2	6	233559	233564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5038	NC_021050	ACA	2	6	233572	233577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545280
5039	NC_021050	CCT	2	6	233618	233623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545280
5040	NC_021050	TCT	2	6	233626	233631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545280
5041	NC_021050	AGG	2	6	233639	233644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5042	NC_021050	CTC	2	6	233657	233662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545280
5043	NC_021050	GGA	2	6	233677	233682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5044	NC_021050	AGTT	2	8	233714	233721	25 %	50 %	25 %	0 %	482545280
5045	NC_021050	ACA	2	6	233725	233730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545280
5046	NC_021050	GAA	2	6	233760	233765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5047	NC_021050	TGA	2	6	233805	233810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545280
5048	NC_021050	GAA	2	6	233878	233883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5049	NC_021050	GAA	2	6	234016	234021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545280
5050	NC_021050	TGTCT	2	10	234027	234036	0 %	60 %	20 %	20 %	482545280
5051	NC_021050	ATT	2	6	234092	234097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545280
5052	NC_021050	TG	3	6	234105	234110	0 %	50 %	50 %	0 %	482545280
5053	NC_021050	TGG	2	6	234123	234128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545280
5054	NC_021050	TGG	2	6	234186	234191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545280
5055	NC_021050	CTG	2	6	234197	234202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545280
5056	NC_021050	GCT	2	6	234250	234255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545280
5057	NC_021050	GTT	2	6	234310	234315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545280
5058	NC_021050	TA	3	6	234323	234328	50 %	50 %	0 %	0 %	482545280
5059	NC_021050	TTC	2	6	234352	234357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545280
5060	NC_021050	CTT	2	6	234431	234436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545280
5061	NC_021050	GAG	2	6	234446	234451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5062	NC_021050	AGG	2	6	234735	234740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5063	NC_021050	GGGA	2	8	234773	234780	25 %	0 %	75 %	0 %	482545280
5064	NC_021050	ATA	2	6	234827	234832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545280
5065	NC_021050	GGA	2	6	234883	234888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545280
5066	NC_021050	T	8	8	235011	235018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021050	GAG	2	6	235038	235043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545281
5068	NC_021050	TCTT	2	8	235053	235060	0 %	75 %	0 %	25 %	482545281
5069	NC_021050	T	9	9	235059	235067	0 %	100 %	0 %	0 %	482545281
5070	NC_021050	T	7	7	235109	235115	0 %	100 %	0 %	0 %	482545281
5071	NC_021050	ACT	2	6	235155	235160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545282
5072	NC_021050	TGT	2	6	235292	235297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545283
5073	NC_021050	CTT	2	6	235314	235319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545283
5074	NC_021050	AGG	2	6	235331	235336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545283
5075	NC_021050	GGATTA	2	12	235353	235364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545283
5076	NC_021050	TGC	2	6	235379	235384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545283
5077	NC_021050	GTC	2	6	235386	235391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545283
5078	NC_021050	TGC	2	6	235407	235412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545283
5079	NC_021050	TGG	2	6	235452	235457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545283
5080	NC_021050	TGC	2	6	235580	235585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545283
5081	NC_021050	GTT	2	6	235623	235628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545283
5082	NC_021050	TA	3	6	235657	235662	50 %	50 %	0 %	0 %	482545283
5083	NC_021050	A	7	7	235710	235716	100 %	0 %	0 %	0 %	482545283
5084	NC_021050	AAC	2	6	235754	235759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545283
5085	NC_021050	GCA	2	6	235776	235781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545283
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5087	NC_021050	AGA	2	6	235793	235798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545283
5088	NC_021050	GAA	2	6	235839	235844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545283
5089	NC_021050	TGA	2	6	235868	235873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545283
5090	NC_021050	GAAAAA	2	12	235899	235910	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	482545283
5091	NC_021050	AGA	3	9	235945	235953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545283
5092	NC_021050	GTT	2	6	235968	235973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021050	T	7	7	235972	235978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021050	GCCTG	2	10	235986	235995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5095	NC_021050	TAA	2	6	235999	236004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021050	T	8	8	236015	236022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021050	CGA	2	6	236037	236042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545284
5098	NC_021050	TCA	2	6	236046	236051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545284
5099	NC_021050	CAG	2	6	236099	236104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545284
5100	NC_021050	GT	3	6	236128	236133	0 %	50 %	50 %	0 %	482545284
5101	NC_021050	TTC	2	6	236166	236171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545284
5102	NC_021050	T	6	6	236199	236204	0 %	100 %	0 %	0 %	482545284
5103	NC_021050	GGA	2	6	236227	236232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545284
5104	NC_021050	AGTA	2	8	236240	236247	50 %	25 %	25 %	0 %	482545284
5105	NC_021050	ATTT	2	8	236296	236303	25 %	75 %	0 %	0 %	482545284
5106	NC_021050	T	8	8	236301	236308	0 %	100 %	0 %	0 %	482545284
5107	NC_021050	T	7	7	236356	236362	0 %	100 %	0 %	0 %	482545285
5108	NC_021050	GGC	2	6	236418	236423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545285
5109	NC_021050	TGC	2	6	236424	236429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545285
5110	NC_021050	CTT	2	6	236497	236502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545285
5111	NC_021050	T	6	6	236524	236529	0 %	100 %	0 %	0 %	482545285
5112	NC_021050	CAAT	2	8	236532	236539	50 %	25 %	0 %	25 %	482545285
5113	NC_021050	AGA	2	6	236575	236580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545285
5114	NC_021050	AAAG	2	8	236660	236667	75 %	0 %	25 %	0 %	482545285
5115	NC_021050	A	7	7	236719	236725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021050	ATT	2	6	236747	236752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021050	CTT	2	6	236759	236764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_021050	TTTG	2	8	236793	236800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021050	AAG	2	6	236853	236858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021050	AGTT	2	8	236917	236924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021050	TTA	2	6	237071	237076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545286
5122	NC_021050	GTT	2	6	237104	237109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545286
5123	NC_021050	CT	3	6	237125	237130	0 %	50 %	0 %	50 %	482545286
5124	NC_021050	AT	3	6	237133	237138	50 %	50 %	0 %	0 %	482545286
5125	NC_021050	TTA	2	6	237225	237230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545286
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5127	NC_021050	TGA	2	6	237394	237399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545286
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5129	NC_021050	GAA	2	6	237557	237562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545286
5130	NC_021050	TGA	2	6	237724	237729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545286
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5233	NC_021050	TGG	2	6	243037	243042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545291
5234	NC_021050	CTG	2	6	243110	243115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545291
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5239	NC_021050	GTT	2	6	243378	243383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545291
5240	NC_021050	AGT	2	6	243432	243437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545291
5241	NC_021050	TCG	2	6	243453	243458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545291
5242	NC_021050	CGTAG	2	10	243466	243475	20 %	20 %	40 %	20 %	482545291
5243	NC_021050	CTTT	2	8	243502	243509	0 %	75 %	0 %	25 %	482545291
5244	NC_021050	TTG	2	6	243559	243564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545291
5245	NC_021050	TCGA	2	8	243601	243608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5246	NC_021050	A	8	8	243625	243632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_021050	T	6	6	243660	243665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021050	GAA	2	6	243672	243677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_021050	AG	4	8	243811	243818	50 %	0 %	50 %	0 %	482545292
5250	NC_021050	CCT	2	6	243819	243824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545292
5251	NC_021050	ATCG	2	8	243923	243930	25 %	25 %	25 %	25 %	482545292
5252	NC_021050	TCA	2	6	243931	243936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545292
5253	NC_021050	TTG	2	6	243966	243971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545292
5254	NC_021050	AAG	2	6	244001	244006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545292
5255	NC_021050	GT	6	12	244011	244022	0 %	50 %	50 %	0 %	482545292
5256	NC_021050	CTG	2	6	244069	244074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545292
5257	NC_021050	GCA	3	9	244098	244106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545292
5258	NC_021050	TCC	2	6	244109	244114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545292
5259	NC_021050	CAA	2	6	244155	244160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545292
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5264	NC_021050	AAGA	2	8	244356	244363	75 %	0 %	25 %	0 %	482545292
5265	NC_021050	TCA	2	6	244389	244394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545292
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5270	NC_021050	GTTT	2	8	244525	244532	0 %	75 %	25 %	0 %	482545292
5271	NC_021050	TTGA	2	8	244563	244570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_021050	AAT	2	6	244580	244585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_021050	AGG	2	6	244594	244599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5274	NC_021050	TTAT	2	8	244613	244620	25 %	75 %	0 %	0 %	482545293
5275	NC_021050	C	6	6	244676	244681	0 %	0 %	0 %	100 %	482545293
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5281	NC_021050	GCA	2	6	244829	244834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545293
5282	NC_021050	CAG	2	6	244875	244880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545293
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5303	NC_021050	ATT	2	6	245802	245807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545294
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5320	NC_021050	ATC	2	6	246686	246691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5323	NC_021050	TGC	2	6	246729	246734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5335	NC_021050	T	6	6	247126	247131	0 %	100 %	0 %	0 %	482545295
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5356	NC_021050	GA	3	6	248231	248236	50 %	0 %	50 %	0 %	482545295
5357	NC_021050	AGT	2	6	248297	248302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545295
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5359	NC_021050	T	10	10	248356	248365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_021050	AGAA	2	8	248382	248389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_021050	TG	3	6	248394	248399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_021050	TCTT	2	8	248428	248435	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5364	NC_021050	TAT	2	6	248479	248484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5369	NC_021050	T	6	6	248750	248755	0 %	100 %	0 %	0 %	482545296
5370	NC_021050	AGA	2	6	248843	248848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545296
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5472	NC_021050	AG	3	6	253806	253811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5475	NC_021050	A	6	6	253845	253850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5476	NC_021050	CAT	2	6	253871	253876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5478	NC_021050	ATA	2	6	254026	254031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5481	NC_021050	AAT	2	6	254120	254125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_021050	GCG	2	6	254963	254968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482545299
5500	NC_021050	AGT	2	6	255022	255027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545299

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