MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium cf. saccharolyticum K10

Total Repeats: 2640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021047	AGGGA	2	10	2234	2243	40 %	0 %	60 %	0 %	479336700
2	NC_021047	TTTTC	2	10	3557	3566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021047	GGTAA	2	10	3970	3979	40 %	20 %	40 %	0 %	479336703
4	NC_021047	GTCCG	2	10	4618	4627	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021047	CTTTA	2	10	4662	4671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021047	GACAG	2	10	4717	4726	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021047	ACAGG	2	10	6198	6207	40 %	0 %	40 %	20 %	479336705
8	NC_021047	CGAGC	2	10	6910	6919	20 %	0 %	40 %	40 %	479336705
9	NC_021047	AGGAG	2	10	9072	9081	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021047	AGGAA	2	10	10600	10609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021047	AATTT	2	10	10696	10705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021047	ACAGC	2	10	12651	12660	40 %	0 %	20 %	40 %	479336711
13	NC_021047	GGCAG	2	10	13112	13121	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021047	AAAGG	2	10	13593	13602	60 %	0 %	40 %	0 %	479336712
15	NC_021047	GCATT	2	10	13969	13978	20 %	40 %	20 %	20 %	479336712
16	NC_021047	ACGGC	2	10	15572	15581	20 %	0 %	40 %	40 %	479336713
17	NC_021047	ACAGA	2	10	16590	16599	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021047	GGCAC	2	10	17336	17345	20 %	0 %	40 %	40 %	479336715
19	NC_021047	AGCGA	2	10	17474	17483	40 %	0 %	40 %	20 %	479336715
20	NC_021047	GAAGG	2	10	17816	17825	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021047	AGGAG	2	10	20055	20064	40 %	0 %	60 %	0 %	479336717
22	NC_021047	AGAGG	2	10	20796	20805	40 %	0 %	60 %	0 %	479336718
23	NC_021047	GAAAG	2	10	23087	23096	60 %	0 %	40 %	0 %	479336719
24	NC_021047	GAAGA	2	10	23613	23622	60 %	0 %	40 %	0 %	479336719
25	NC_021047	TTTTG	2	10	25179	25188	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021047	AAGAG	2	10	25935	25944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021047	GATAT	2	10	26038	26047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021047	GGACG	2	10	26231	26240	20 %	0 %	60 %	20 %	479336724
29	NC_021047	CAGAA	2	10	27549	27558	60 %	0 %	20 %	20 %	479336725
30	NC_021047	GGGGC	2	10	27692	27701	0 %	0 %	80 %	20 %	479336725
31	NC_021047	GAAGC	2	10	27966	27975	40 %	0 %	40 %	20 %	479336725
32	NC_021047	TCTCA	2	10	28192	28201	20 %	40 %	0 %	40 %	479336725
33	NC_021047	CTGAC	2	10	30284	30293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021047	GAAGC	2	10	31619	31628	40 %	0 %	40 %	20 %	479336727
35	NC_021047	TTCCT	2	10	32139	32148	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021047	GAAAA	2	10	32940	32949	80 %	0 %	20 %	0 %	479336728
37	NC_021047	GGGAT	2	10	34033	34042	20 %	20 %	60 %	0 %	479336729
38	NC_021047	TGCTG	2	10	36258	36267	0 %	40 %	40 %	20 %	479336730
39	NC_021047	GACGG	2	10	36543	36552	20 %	0 %	60 %	20 %	479336730
40	NC_021047	AAATA	2	10	38283	38292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021047	AGGGG	2	10	45405	45414	20 %	0 %	80 %	0 %	479336735
42	NC_021047	AGGGC	2	10	46048	46057	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021047	AGGAA	2	10	47585	47594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021047	GATGA	2	10	50552	50561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021047	CTGTT	2	10	53064	53073	0 %	60 %	20 %	20 %	479336739
46	NC_021047	TCCTC	2	10	53567	53576	0 %	40 %	0 %	60 %	479336739
47	NC_021047	GAAAA	2	10	54052	54061	80 %	0 %	20 %	0 %	479336740
48	NC_021047	GCCCT	2	10	56589	56598	0 %	20 %	20 %	60 %	479336742
49	NC_021047	CGGAT	2	10	58207	58216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021047	GCAGA	2	10	58842	58851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021047	TTCAG	2	10	59198	59207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021047	ATATT	2	10	59459	59468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021047	AAAAC	2	10	61096	61105	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021047	TTAAA	2	10	61807	61816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021047	GGAAA	2	10	61905	61914	60 %	0 %	40 %	0 %	479336748
56	NC_021047	GCAGA	2	10	62144	62153	40 %	0 %	40 %	20 %	479336749
57	NC_021047	GCGCC	2	10	63863	63872	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_021047	AAAGG	2	10	65633	65642	60 %	0 %	40 %	0 %	479336750
59	NC_021047	GCCGT	2	10	66839	66848	0 %	20 %	40 %	40 %	479336751
60	NC_021047	CTGGC	2	10	68372	68381	0 %	20 %	40 %	40 %	479336752
61	NC_021047	TTCTC	2	10	69720	69729	0 %	60 %	0 %	40 %	479336753
62	NC_021047	CGAGG	2	10	69845	69854	20 %	0 %	60 %	20 %	479336753
63	NC_021047	CTCCG	2	10	71431	71440	0 %	20 %	20 %	60 %	479336754
64	NC_021047	CAGAA	2	10	75143	75152	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021047	GGGCA	2	10	75555	75564	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021047	GCGCT	2	10	77401	77410	0 %	20 %	40 %	40 %	479336756
67	NC_021047	CCTTC	2	10	78386	78395	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_021047	AGGAG	2	10	79022	79031	40 %	0 %	60 %	0 %	479336758
69	NC_021047	GCCTG	2	10	79713	79722	0 %	20 %	40 %	40 %	479336758
70	NC_021047	CCTTT	2	10	79846	79855	0 %	60 %	0 %	40 %	479336758
71	NC_021047	TTCTG	2	10	80178	80187	0 %	60 %	20 %	20 %	479336758
72	NC_021047	AGAGG	2	10	81158	81167	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021047	GACAG	2	10	83660	83669	40 %	0 %	40 %	20 %	479336765
74	NC_021047	ATAAA	2	10	86084	86093	80 %	20 %	0 %	0 %	479336766
75	NC_021047	ATTAC	2	10	86129	86138	40 %	40 %	0 %	20 %	479336766
76	NC_021047	GGACT	2	10	86804	86813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021047	TGACA	2	10	89949	89958	40 %	20 %	20 %	20 %	479336768
78	NC_021047	GAGAC	2	10	90827	90836	40 %	0 %	40 %	20 %	479336768
79	NC_021047	ATTTT	2	10	91457	91466	20 %	80 %	0 %	0 %	479336769
80	NC_021047	TGAGA	2	10	92182	92191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021047	GCTTT	2	10	92192	92201	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021047	AAGAA	2	10	93246	93255	80 %	0 %	20 %	0 %	479336770
83	NC_021047	AGGAT	2	10	95002	95011	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021047	AGGAT	2	10	95111	95120	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021047	AGAGA	2	10	97293	97302	60 %	0 %	40 %	0 %	479336774
86	NC_021047	ATAAA	2	10	99397	99406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021047	TCAGC	2	10	99895	99904	20 %	20 %	20 %	40 %	479336776
88	NC_021047	AGCGC	2	10	101572	101581	20 %	0 %	40 %	40 %	479336777
89	NC_021047	CGTGC	2	10	103211	103220	0 %	20 %	40 %	40 %	479336778
90	NC_021047	GATAA	2	10	105448	105457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021047	GCTCT	2	10	107514	107523	0 %	40 %	20 %	40 %	479336783
92	NC_021047	CATCT	2	10	109543	109552	20 %	40 %	0 %	40 %	479336784
93	NC_021047	TTTCT	2	10	113588	113597	0 %	80 %	0 %	20 %	479336786
94	NC_021047	GTCCA	2	10	114004	114013	20 %	20 %	20 %	40 %	479336787
95	NC_021047	GCTTT	2	10	118610	118619	0 %	60 %	20 %	20 %	479336792
96	NC_021047	CAGCA	2	10	121874	121883	40 %	0 %	20 %	40 %	479336796
97	NC_021047	GCTGG	2	10	123490	123499	0 %	20 %	60 %	20 %	479336798
98	NC_021047	CCATA	2	10	127989	127998	40 %	20 %	0 %	40 %	479336802
99	NC_021047	GATGG	2	10	130388	130397	20 %	20 %	60 %	0 %	479336804
100	NC_021047	AACAA	2	10	134898	134907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021047	GGTCA	2	10	135931	135940	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021047	GGGCG	2	10	136291	136300	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021047	GTTCT	2	10	139538	139547	0 %	60 %	20 %	20 %	479336805
104	NC_021047	CAACA	2	10	139644	139653	60 %	0 %	0 %	40 %	479336805
105	NC_021047	GTTCT	2	10	140690	140699	0 %	60 %	20 %	20 %	479336807
106	NC_021047	AGCGT	2	10	141143	141152	20 %	20 %	40 %	20 %	479336808
107	NC_021047	CCATG	2	10	142710	142719	20 %	20 %	20 %	40 %	479336809
108	NC_021047	ACAGA	2	10	143684	143693	60 %	0 %	20 %	20 %	479336811
109	NC_021047	AGGGA	2	10	144756	144765	40 %	0 %	60 %	0 %	479336812
110	NC_021047	ATTTA	2	10	147195	147204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021047	AGATA	2	10	147477	147486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021047	TGGAA	2	10	148024	148033	40 %	20 %	40 %	0 %	479336814
113	NC_021047	CATGG	2	10	148344	148353	20 %	20 %	40 %	20 %	479336814
114	NC_021047	GAAAA	2	10	148997	149006	80 %	0 %	20 %	0 %	479336814
115	NC_021047	GGCAG	2	10	149024	149033	20 %	0 %	60 %	20 %	479336814
116	NC_021047	GCAAG	2	10	151883	151892	40 %	0 %	40 %	20 %	479336816
117	NC_021047	ACTAT	2	10	153158	153167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021047	CCTGC	2	10	154345	154354	0 %	20 %	20 %	60 %	479336819
119	NC_021047	ACAGG	2	10	156217	156226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021047	ATATA	2	10	156346	156355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021047	CTTGT	2	10	158149	158158	0 %	60 %	20 %	20 %	479336823
122	NC_021047	GAGCA	2	10	159205	159214	40 %	0 %	40 %	20 %	479336825
123	NC_021047	GGCCG	2	10	160244	160253	0 %	0 %	60 %	40 %	479336827
124	NC_021047	GCCGC	2	10	160309	160318	0 %	0 %	40 %	60 %	479336827
125	NC_021047	ACGGC	2	10	160471	160480	20 %	0 %	40 %	40 %	479336827
126	NC_021047	GGAGC	2	10	161070	161079	20 %	0 %	60 %	20 %	479336828
127	NC_021047	TGGCA	2	10	162726	162735	20 %	20 %	40 %	20 %	479336830
128	NC_021047	GCTGT	2	10	162781	162790	0 %	40 %	40 %	20 %	479336830
129	NC_021047	GCTGG	2	10	163431	163440	0 %	20 %	60 %	20 %	479336830
130	NC_021047	CTAAG	2	10	163536	163545	40 %	20 %	20 %	20 %	479336830
131	NC_021047	CTGGT	2	10	164922	164931	0 %	40 %	40 %	20 %	479336831
132	NC_021047	TAAAA	2	10	167132	167141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021047	GAGAG	2	10	167335	167344	40 %	0 %	60 %	0 %	479336834
134	NC_021047	GCCAG	2	10	167783	167792	20 %	0 %	40 %	40 %	479336834
135	NC_021047	GGAAG	2	10	168093	168102	40 %	0 %	60 %	0 %	479336834
136	NC_021047	AAATT	2	10	168305	168314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021047	CCAGG	2	10	169698	169707	20 %	0 %	40 %	40 %	479336837
138	NC_021047	GGAGT	2	10	172517	172526	20 %	20 %	60 %	0 %	479336839
139	NC_021047	CAGGT	2	10	175136	175145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021047	CTGGA	2	10	176979	176988	20 %	20 %	40 %	20 %	479336842
141	NC_021047	GCTGT	2	10	178864	178873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021047	CTTAT	2	10	180448	180457	20 %	60 %	0 %	20 %	479336844
143	NC_021047	TTTTG	2	10	181864	181873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021047	CCATC	2	10	183629	183638	20 %	20 %	0 %	60 %	479336849
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147	NC_021047	TTCTC	2	10	185310	185319	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_021047	CCGGG	2	10	202037	202046	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_021047	CCGTA	2	10	239904	239913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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264	NC_021047	GAGCT	2	10	325035	325044	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_021047	CTTGG	2	10	332629	332638	0 %	40 %	40 %	20 %	479336962
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