MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020977	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478464862
2	NC_020977	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478464862
3	NC_020977	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478464862
4	NC_020977	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478464862
5	NC_020977	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478464862
6	NC_020977	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478464862
7	NC_020977	AAGG	2	8	1906	1913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020977	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478464863
9	NC_020977	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478464864
10	NC_020977	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478464864
11	NC_020977	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478464865
12	NC_020977	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478464865
13	NC_020977	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478464866
14	NC_020977	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478464866
15	NC_020977	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478464866
16	NC_020977	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478464866
17	NC_020977	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478464867
18	NC_020977	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478464867
19	NC_020977	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478464867
20	NC_020977	GGAG	2	8	6903	6910	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020977	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478464868
22	NC_020977	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478464868
23	NC_020977	TATG	2	8	7552	7559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020977	ATTT	2	8	7693	7700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020977	TTTG	2	8	7785	7792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020977	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478464869
27	NC_020977	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478464870
28	NC_020977	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478464870
29	NC_020977	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478464870
30	NC_020977	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478464870
31	NC_020977	TATT	2	8	9908	9915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020977	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478464871
33	NC_020977	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478464871
34	NC_020977	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478464871
35	NC_020977	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478464872
36	NC_020977	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478464872
37	NC_020977	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478464872
38	NC_020977	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478464872
39	NC_020977	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020977	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478464874
41	NC_020977	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478464874
42	NC_020977	AAGG	2	8	14038	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020977	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478464875
44	NC_020977	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478464875
45	NC_020977	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478464875
46	NC_020977	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478464876
47	NC_020977	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478464876
48	NC_020977	CAAA	2	8	16672	16679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020977	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478464877
50	NC_020977	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478464877
51	NC_020977	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478464877
52	NC_020977	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478464877
53	NC_020977	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478464877
54	NC_020977	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478464879
55	NC_020977	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478464879
56	NC_020977	GCCA	2	8	21620	21627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020977	CGCT	2	8	21868	21875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020977	TTAA	2	8	21889	21896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020977	GTTA	2	8	21926	21933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020977	GATC	2	8	21981	21988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020977	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478464881
62	NC_020977	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478464881
63	NC_020977	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478464881
64	NC_020977	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478464881
65	NC_020977	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478464881
66	NC_020977	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478464881
67	NC_020977	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478464881
68	NC_020977	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478464881
69	NC_020977	TTGA	2	8	25654	25661	25 %	50 %	25 %	0 %	478464882
70	NC_020977	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478464882
71	NC_020977	TTCC	2	8	26002	26009	0 %	50 %	0 %	50 %	478464882
72	NC_020977	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478464882
73	NC_020977	GCTT	2	8	26888	26895	0 %	50 %	25 %	25 %	478464882
74	NC_020977	GGAA	2	8	27471	27478	50 %	0 %	50 %	0 %	478464883
75	NC_020977	TTAA	2	8	27544	27551	50 %	50 %	0 %	0 %	478464883
76	NC_020977	AAAG	2	8	27594	27601	75 %	0 %	25 %	0 %	478464883
77	NC_020977	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478464884
78	NC_020977	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478464884
79	NC_020977	ATTG	2	8	28538	28545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020977	CTTT	2	8	30151	30158	0 %	75 %	0 %	25 %	478464886
81	NC_020977	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478464886
82	NC_020977	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478464886
83	NC_020977	TGGC	2	8	30364	30371	0 %	25 %	50 %	25 %	478464886
84	NC_020977	AAAG	2	8	30924	30931	75 %	0 %	25 %	0 %	478464887
85	NC_020977	AAAC	2	8	30994	31001	75 %	0 %	0 %	25 %	478464887
86	NC_020977	GATG	2	8	31137	31144	25 %	25 %	50 %	0 %	478464887
87	NC_020977	GATA	2	8	32246	32253	50 %	25 %	25 %	0 %	478464889
88	NC_020977	TGAT	2	8	34741	34748	25 %	50 %	25 %	0 %	478464892
89	NC_020977	AAGA	3	12	34869	34880	75 %	0 %	25 %	0 %	478464892
90	NC_020977	AAGC	2	8	35089	35096	50 %	0 %	25 %	25 %	478464893
91	NC_020977	GTTC	2	8	35122	35129	0 %	50 %	25 %	25 %	478464893
92	NC_020977	GGCA	2	8	35501	35508	25 %	0 %	50 %	25 %	478464894
93	NC_020977	TGCT	2	8	35911	35918	0 %	50 %	25 %	25 %	478464894
94	NC_020977	TTGG	2	8	36143	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	478464894
95	NC_020977	AGAT	2	8	36863	36870	50 %	25 %	25 %	0 %	478464894
96	NC_020977	CTTT	2	8	37235	37242	0 %	75 %	0 %	25 %	478464895
97	NC_020977	ATGA	2	8	37725	37732	50 %	25 %	25 %	0 %	478464895
98	NC_020977	TAGG	2	8	37884	37891	25 %	25 %	50 %	0 %	478464895
99	NC_020977	CAAT	2	8	38068	38075	50 %	25 %	0 %	25 %	478464895
100	NC_020977	AATG	2	8	38855	38862	50 %	25 %	25 %	0 %	478464895
101	NC_020977	AGAA	2	8	39692	39699	75 %	0 %	25 %	0 %	478464896
102	NC_020977	AAGA	2	8	39744	39751	75 %	0 %	25 %	0 %	478464896
103	NC_020977	ATCC	2	8	39752	39759	25 %	25 %	0 %	50 %	478464896
104	NC_020977	TAAT	2	8	39963	39970	50 %	50 %	0 %	0 %	478464896
105	NC_020977	GTGC	2	8	42051	42058	0 %	25 %	50 %	25 %	478464898
106	NC_020977	AGAA	2	8	42470	42477	75 %	0 %	25 %	0 %	478464898
107	NC_020977	GGAT	2	8	42622	42629	25 %	25 %	50 %	0 %	478464898
108	NC_020977	AAAC	2	8	43761	43768	75 %	0 %	0 %	25 %	478464900
109	NC_020977	CAAT	2	8	43965	43972	50 %	25 %	0 %	25 %	478464900
110	NC_020977	TGTT	2	8	44345	44352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020977	AATA	2	8	44583	44590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020977	ATTT	2	8	44721	44728	25 %	75 %	0 %	0 %	478464901
113	NC_020977	GCTC	2	8	45029	45036	0 %	25 %	25 %	50 %	478464901
114	NC_020977	TTCT	2	8	45171	45178	0 %	75 %	0 %	25 %	478464901
115	NC_020977	TTGA	2	8	45771	45778	25 %	50 %	25 %	0 %	478464902
116	NC_020977	TGTT	2	8	45943	45950	0 %	75 %	25 %	0 %	478464902
117	NC_020977	CTAT	2	8	45973	45980	25 %	50 %	0 %	25 %	478464902
118	NC_020977	TGTT	2	8	46002	46009	0 %	75 %	25 %	0 %	478464902
119	NC_020977	CTAT	2	8	46298	46305	25 %	50 %	0 %	25 %	478464902
120	NC_020977	AAGA	2	8	46793	46800	75 %	0 %	25 %	0 %	478464903
121	NC_020977	AAGA	2	8	46850	46857	75 %	0 %	25 %	0 %	478464903
122	NC_020977	AAAG	2	8	46890	46897	75 %	0 %	25 %	0 %	478464903
123	NC_020977	AAGA	2	8	47005	47012	75 %	0 %	25 %	0 %	478464903
124	NC_020977	ACTT	2	8	47266	47273	25 %	50 %	0 %	25 %	478464903
125	NC_020977	ATGG	2	8	47892	47899	25 %	25 %	50 %	0 %	478464903
126	NC_020977	AGGA	2	8	47923	47930	50 %	0 %	50 %	0 %	478464903
127	NC_020977	GAAC	2	8	48470	48477	50 %	0 %	25 %	25 %	478464903
128	NC_020977	AAGT	2	8	48505	48512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020977	AACA	2	8	48714	48721	75 %	0 %	0 %	25 %	478464904
130	NC_020977	CTTT	2	8	48910	48917	0 %	75 %	0 %	25 %	478464904
131	NC_020977	CTTT	2	8	49795	49802	0 %	75 %	0 %	25 %	478464905
132	NC_020977	GTAG	2	8	49813	49820	25 %	25 %	50 %	0 %	478464905
133	NC_020977	GAAG	2	8	51243	51250	50 %	0 %	50 %	0 %	478464906
134	NC_020977	TTCA	2	8	51665	51672	25 %	50 %	0 %	25 %	478464906
135	NC_020977	TCTA	2	8	51882	51889	25 %	50 %	0 %	25 %	478464906
136	NC_020977	TATT	2	8	52768	52775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020977	GGAA	2	8	52999	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	478464908
138	NC_020977	TTAA	2	8	53740	53747	50 %	50 %	0 %	0 %	478464908
139	NC_020977	CCTT	2	8	53947	53954	0 %	50 %	0 %	50 %	478464909
140	NC_020977	TTTA	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	478464909
141	NC_020977	AAAG	2	8	54338	54345	75 %	0 %	25 %	0 %	478464909
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