MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020977	CCA	2	6	249625	249630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478465079
5503	NC_020977	CAA	2	6	249673	249678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465079
5504	NC_020977	CCCA	2	8	249798	249805	25 %	0 %	0 %	75 %	478465080
5505	NC_020977	CTT	2	6	249927	249932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465080
5506	NC_020977	AAT	2	6	250006	250011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465080
5507	NC_020977	CTC	2	6	250017	250022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465080
5508	NC_020977	ACT	2	6	250025	250030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465080
5509	NC_020977	GAA	2	6	250043	250048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465080
5510	NC_020977	CTC	2	6	250074	250079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465080
5511	NC_020977	GCAA	2	8	250088	250095	50 %	0 %	25 %	25 %	478465080
5512	NC_020977	AAC	2	6	250105	250110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465080
5513	NC_020977	GTT	2	6	250150	250155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465080
5514	NC_020977	AAC	2	6	250189	250194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_020977	A	6	6	250203	250208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_020977	TAA	2	6	250254	250259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_020977	TTC	2	6	250272	250277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465081
5518	NC_020977	GCT	2	6	250304	250309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465081
5519	NC_020977	T	7	7	250313	250319	0 %	100 %	0 %	0 %	478465081
5520	NC_020977	AGCA	2	8	250350	250357	50 %	0 %	25 %	25 %	478465081
5521	NC_020977	CTT	2	6	250367	250372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465081
5522	NC_020977	TCT	3	9	250378	250386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465081
5523	NC_020977	GATAA	2	10	250406	250415	60 %	20 %	20 %	0 %	478465081
5524	NC_020977	TCG	2	6	250472	250477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465081
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5526	NC_020977	TCC	2	6	250512	250517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465081
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5535	NC_020977	A	6	6	250774	250779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_020977	TA	3	6	250821	250826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_020977	CCAA	2	8	250856	250863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_020977	A	7	7	250880	250886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_020977	TAT	2	6	250899	250904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465082
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5541	NC_020977	AGA	3	9	250967	250975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465082
5542	NC_020977	TGTT	2	8	251005	251012	0 %	75 %	25 %	0 %	478465082
5543	NC_020977	CGA	2	6	251126	251131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465082
5544	NC_020977	GCAAA	2	10	251138	251147	60 %	0 %	20 %	20 %	478465082
5545	NC_020977	AATA	2	8	251224	251231	75 %	25 %	0 %	0 %	478465082
5546	NC_020977	A	6	6	251290	251295	100 %	0 %	0 %	0 %	478465082
5547	NC_020977	A	7	7	251321	251327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020977	ATA	2	6	251335	251340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020977	CCT	2	6	251390	251395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_020977	AAAC	2	8	251464	251471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_020977	AAG	2	6	251588	251593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465083
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5554	NC_020977	TTA	2	6	251800	251805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465083
5555	NC_020977	CTTCT	2	10	251832	251841	0 %	60 %	0 %	40 %	478465083
5556	NC_020977	T	6	6	251875	251880	0 %	100 %	0 %	0 %	478465083
5557	NC_020977	CA	3	6	251934	251939	50 %	0 %	0 %	50 %	478465083
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5559	NC_020977	ACA	2	6	252025	252030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465083
5560	NC_020977	TTG	2	6	252089	252094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465083
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5564	NC_020977	GAG	2	6	252313	252318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_020977	ATT	2	6	252325	252330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465084
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5572	NC_020977	TCC	2	6	252489	252494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465084
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5575	NC_020977	TACT	2	8	252564	252571	25 %	50 %	0 %	25 %	478465084
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5589	NC_020977	AG	3	6	253112	253117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5593	NC_020977	A	6	6	253233	253238	100 %	0 %	0 %	0 %	478465085
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5609	NC_020977	TC	3	6	253935	253940	0 %	50 %	0 %	50 %	478465085
5610	NC_020977	TCT	2	6	253997	254002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465085
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5624	NC_020977	TTG	2	6	254576	254581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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