MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/CV204 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_020976	CTT	2	6	631270	631275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464527
14003	NC_020976	CTC	2	6	631294	631299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464527
14004	NC_020976	A	6	6	631324	631329	100 %	0 %	0 %	0 %	478464527
14005	NC_020976	CCT	2	6	631389	631394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464527
14006	NC_020976	AAG	2	6	631396	631401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464527
14007	NC_020976	TCC	2	6	631407	631412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464527
14008	NC_020976	CCT	2	6	631504	631509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464527
14009	NC_020976	ATT	2	6	631521	631526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464527
14010	NC_020976	TTC	2	6	631534	631539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464527
14011	NC_020976	ACA	2	6	631559	631564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464527
14012	NC_020976	CCT	2	6	631569	631574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464527
14013	NC_020976	A	6	6	631656	631661	100 %	0 %	0 %	0 %	478464527
14014	NC_020976	TCGAG	2	10	631666	631675	20 %	20 %	40 %	20 %	478464527
14015	NC_020976	T	6	6	631693	631698	0 %	100 %	0 %	0 %	478464527
14016	NC_020976	TTG	2	6	631723	631728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464527
14017	NC_020976	TCCT	2	8	631758	631765	0 %	50 %	0 %	50 %	478464527
14018	NC_020976	CAA	2	6	631842	631847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464527
14019	NC_020976	ATC	2	6	631869	631874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464527
14020	NC_020976	TCA	2	6	631885	631890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464527
14021	NC_020976	CTTT	2	8	631939	631946	0 %	75 %	0 %	25 %	478464527
14022	NC_020976	ATG	3	9	631989	631997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464527
14023	NC_020976	TC	4	8	632014	632021	0 %	50 %	0 %	50 %	478464527
14024	NC_020976	CTA	2	6	632067	632072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464527
14025	NC_020976	TGA	2	6	632080	632085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478464527
14026	NC_020976	CAA	2	6	632124	632129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464528
14027	NC_020976	TTTG	2	8	632143	632150	0 %	75 %	25 %	0 %	478464528
14028	NC_020976	TTA	2	6	632171	632176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464528
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14030	NC_020976	TAT	2	6	632200	632205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464528
14031	NC_020976	TGG	2	6	632229	632234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478464528
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14034	NC_020976	TGC	2	6	632356	632361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464528
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14036	NC_020976	TA	3	6	632453	632458	50 %	50 %	0 %	0 %	478464529
14037	NC_020976	AGCC	2	8	632466	632473	25 %	0 %	25 %	50 %	478464529
14038	NC_020976	TCTT	2	8	632490	632497	0 %	75 %	0 %	25 %	478464529
14039	NC_020976	ATC	2	6	632531	632536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464529
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14041	NC_020976	TGC	2	6	632604	632609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464529
14042	NC_020976	CTT	2	6	632672	632677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464529
14043	NC_020976	TGC	2	6	632734	632739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464529
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14045	NC_020976	CT	3	6	632800	632805	0 %	50 %	0 %	50 %	478464529
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14052	NC_020976	CTC	2	6	633099	633104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464529
14053	NC_020976	CTAC	2	8	633118	633125	25 %	25 %	0 %	50 %	478464529
14054	NC_020976	TGG	2	6	633173	633178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478464529
14055	NC_020976	ATT	2	6	633198	633203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478464529
14056	NC_020976	CTA	2	6	633231	633236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464529
14057	NC_020976	TCC	2	6	633253	633258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464529
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14059	NC_020976	CTCC	2	8	633287	633294	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14060	NC_020976	A	6	6	633295	633300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_020976	TTC	2	6	633308	633313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_020976	TTG	2	6	633334	633339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_020976	TGC	2	6	633378	633383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464530
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14065	NC_020976	CAA	2	6	633577	633582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464530
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14069	NC_020976	GAG	2	6	633762	633767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478464530
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14071	NC_020976	T	6	6	633807	633812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_020976	A	6	6	633873	633878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_020976	TCT	2	6	633895	633900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464531
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14092	NC_020976	TCGTT	2	10	634699	634708	0 %	60 %	20 %	20 %	478464531
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14100	NC_020976	TCCAT	2	10	635000	635009	20 %	40 %	0 %	40 %	478464532
14101	NC_020976	AGAA	2	8	635010	635017	75 %	0 %	25 %	0 %	478464532
14102	NC_020976	CCT	2	6	635051	635056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478464532
14103	NC_020976	CT	3	6	635055	635060	0 %	50 %	0 %	50 %	478464532
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14106	NC_020976	A	6	6	635168	635173	100 %	0 %	0 %	0 %	478464532
14107	NC_020976	CTCTTT	2	12	635271	635282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464532
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14111	NC_020976	TAAACA	2	12	635399	635410	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478464532
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14117	NC_020976	ATGC	2	8	635664	635671	25 %	25 %	25 %	25 %	478464533
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14119	NC_020976	GA	4	8	635763	635770	50 %	0 %	50 %	0 %	478464533
14120	NC_020976	AAG	2	6	635771	635776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464533
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14122	NC_020976	A	6	6	635790	635795	100 %	0 %	0 %	0 %	478464533
14123	NC_020976	ACA	2	6	635866	635871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464534
14124	NC_020976	TCAT	2	8	635887	635894	25 %	50 %	0 %	25 %	478464534
14125	NC_020976	AAG	2	6	635901	635906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464534
14126	NC_020976	TCT	2	6	635908	635913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464534
14127	NC_020976	AAG	2	6	635928	635933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478464534
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14129	NC_020976	CAC	2	6	635950	635955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478464534
14130	NC_020976	TCT	2	6	635962	635967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464534
14131	NC_020976	CAT	2	6	636027	636032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464534
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14134	NC_020976	CAT	2	6	636153	636158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464534
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14163	NC_020976	CGT	2	6	637346	637351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464535
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14165	NC_020976	CCT	2	6	637400	637405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14166	NC_020976	CGGAA	2	10	637616	637625	40 %	0 %	40 %	20 %	478464536
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14175	NC_020976	GTC	2	6	638113	638118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478464536
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14182	NC_020976	GCTC	2	8	638512	638519	0 %	25 %	25 %	50 %	478464536
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14231	NC_020976	C	9	9	640842	640850	0 %	0 %	0 %	100 %	478464537
14232	NC_020976	GTT	2	6	640896	640901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478464537
14233	NC_020976	TC	3	6	640950	640955	0 %	50 %	0 %	50 %	478464537
14234	NC_020976	GA	3	6	640966	640971	50 %	0 %	50 %	0 %	478464537
14235	NC_020976	CTT	2	6	640977	640982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464537
14236	NC_020976	CAT	2	6	641001	641006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464537
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14239	NC_020976	CAA	2	6	641283	641288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478464538
14240	NC_020976	TCT	2	6	641396	641401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478464538
14241	NC_020976	ATC	2	6	641455	641460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478464538
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