MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020975	TCTA	2	8	181866	181873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_020975	GAA	2	6	181945	181950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020975	ATT	2	6	181981	181986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020975	AATT	2	8	182000	182007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020975	TGT	2	6	182024	182029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020975	T	6	6	182128	182133	0 %	100 %	0 %	0 %	478471316
4007	NC_020975	TTGAA	2	10	182154	182163	40 %	40 %	20 %	0 %	478471316
4008	NC_020975	TTTG	2	8	182168	182175	0 %	75 %	25 %	0 %	478471316
4009	NC_020975	ATC	2	6	182265	182270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471316
4010	NC_020975	TGCA	2	8	182286	182293	25 %	25 %	25 %	25 %	478471316
4011	NC_020975	TGT	2	6	182304	182309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471316
4012	NC_020975	AGT	2	6	182323	182328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471316
4013	NC_020975	CT	3	6	182368	182373	0 %	50 %	0 %	50 %	478471316
4014	NC_020975	T	6	6	182373	182378	0 %	100 %	0 %	0 %	478471316
4015	NC_020975	CTC	2	6	182402	182407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478471316
4016	NC_020975	GA	3	6	182447	182452	50 %	0 %	50 %	0 %	478471316
4017	NC_020975	GAT	2	6	182502	182507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471316
4018	NC_020975	AAAG	2	8	182655	182662	75 %	0 %	25 %	0 %	478471316
4019	NC_020975	CGA	2	6	182836	182841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471316
4020	NC_020975	AAT	2	6	182862	182867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471316
4021	NC_020975	ATT	2	6	182902	182907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478471316
4022	NC_020975	GTTT	2	8	182958	182965	0 %	75 %	25 %	0 %	478471316
4023	NC_020975	TGAGT	2	10	182968	182977	20 %	40 %	40 %	0 %	478471316
4024	NC_020975	CTT	2	6	183046	183051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471316
4025	NC_020975	AGA	2	6	183126	183131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471316
4026	NC_020975	TG	3	6	183159	183164	0 %	50 %	50 %	0 %	478471316
4027	NC_020975	AGGGG	2	10	183165	183174	20 %	0 %	80 %	0 %	478471316
4028	NC_020975	GA	3	6	183206	183211	50 %	0 %	50 %	0 %	478471316
4029	NC_020975	GAA	2	6	183247	183252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471316
4030	NC_020975	AGA	3	9	183291	183299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471316
4031	NC_020975	AGAAA	2	10	183333	183342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020975	AAGA	2	8	183354	183361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020975	T	8	8	183378	183385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020975	AGAAAA	2	12	183396	183407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020975	A	6	6	183404	183409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020975	TCG	2	6	183444	183449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471317
4037	NC_020975	TGT	2	6	183456	183461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471317
4038	NC_020975	T	6	6	183474	183479	0 %	100 %	0 %	0 %	478471317
4039	NC_020975	T	7	7	183481	183487	0 %	100 %	0 %	0 %	478471317
4040	NC_020975	AAG	2	6	183534	183539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471317
4041	NC_020975	GATG	2	8	183565	183572	25 %	25 %	50 %	0 %	478471317
4042	NC_020975	TCT	2	6	183582	183587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471317
4043	NC_020975	AGG	2	6	183636	183641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478471317
4044	NC_020975	GGA	2	6	183670	183675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478471317
4045	NC_020975	TTGAG	2	10	183715	183724	20 %	40 %	40 %	0 %	478471317
4046	NC_020975	ATAGA	2	10	183737	183746	60 %	20 %	20 %	0 %	478471317
4047	NC_020975	CT	3	6	183790	183795	0 %	50 %	0 %	50 %	478471317
4048	NC_020975	TGA	2	6	183804	183809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471317
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4050	NC_020975	AAC	2	6	183887	183892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478471317
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4052	NC_020975	TGA	2	6	183906	183911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471317
4053	NC_020975	TGC	2	6	183942	183947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471317
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4055	NC_020975	TTG	2	6	183971	183976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471317
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4057	NC_020975	GAT	2	6	184010	184015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471317
4058	NC_020975	GA	3	6	184036	184041	50 %	0 %	50 %	0 %	478471317
4059	NC_020975	GCG	2	6	184044	184049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478471317
4060	NC_020975	ACT	2	6	184092	184097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_020975	TAG	2	6	184126	184131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020975	GCA	2	6	184173	184178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_020975	TCGC	2	8	184216	184223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_020975	AGA	2	6	184227	184232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020975	GCA	2	6	184236	184241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_020975	TA	3	6	184271	184276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020975	GAA	2	6	184306	184311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020975	AGA	2	6	184345	184350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_020975	GA	3	6	184384	184389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_020975	GTT	2	6	184401	184406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_020975	GTT	2	6	184436	184441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_020975	CTT	2	6	184444	184449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_020975	GA	3	6	184487	184492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020975	GTT	2	6	184498	184503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_020975	GAG	2	6	184519	184524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_020975	GAA	2	6	184539	184544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_020975	TTG	2	6	184550	184555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_020975	AGG	2	6	184589	184594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4084	NC_020975	GGA	3	9	184878	184886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478471318
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4090	NC_020975	A	8	8	185009	185016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_020975	TAT	2	6	185088	185093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_020975	GA	3	6	185128	185133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_020975	GA	3	6	185160	185165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_020975	AGA	2	6	185170	185175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_020975	CTG	2	6	185418	185423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471319
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4106	NC_020975	AGAGA	2	10	185820	185829	60 %	0 %	40 %	0 %	478471320
4107	NC_020975	GCA	2	6	185916	185921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471320
4108	NC_020975	TTA	2	6	186213	186218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478471320
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4110	NC_020975	ATA	2	6	186342	186347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478471320
4111	NC_020975	TCTA	2	8	186383	186390	25 %	50 %	0 %	25 %	478471320
4112	NC_020975	GTT	2	6	186443	186448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_020975	TGC	2	6	186576	186581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478471321
4114	NC_020975	CA	3	6	186597	186602	50 %	0 %	0 %	50 %	478471321
4115	NC_020975	AC	3	6	186615	186620	50 %	0 %	0 %	50 %	478471321
4116	NC_020975	AGA	2	6	186714	186719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471321
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4118	NC_020975	T	6	6	186857	186862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020975	T	7	7	186865	186871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020975	T	6	6	186877	186882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020975	T	8	8	186927	186934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020975	A	6	6	186950	186955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020975	T	6	6	186972	186977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020975	T	7	7	187067	187073	0 %	100 %	0 %	0 %	478471322
4125	NC_020975	TCT	2	6	187091	187096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478471322
4126	NC_020975	TG	3	6	187101	187106	0 %	50 %	50 %	0 %	478471322
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