MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020975	CTTG	2	8	158258	158265	0 %	50 %	25 %	25 %	478471299
3502	NC_020975	GA	3	6	158274	158279	50 %	0 %	50 %	0 %	478471299
3503	NC_020975	A	7	7	158301	158307	100 %	0 %	0 %	0 %	478471299
3504	NC_020975	GCA	2	6	158327	158332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471299
3505	NC_020975	CTTT	2	8	158335	158342	0 %	75 %	0 %	25 %	478471299
3506	NC_020975	CTCCAT	2	12	158359	158370	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478471299
3507	NC_020975	ATT	2	6	158437	158442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478471299
3508	NC_020975	GAT	2	6	158463	158468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471299
3509	NC_020975	TTG	2	6	158477	158482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471299
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3511	NC_020975	T	6	6	158585	158590	0 %	100 %	0 %	0 %	478471299
3512	NC_020975	ATG	2	6	158635	158640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471299
3513	NC_020975	TGT	2	6	158648	158653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471299
3514	NC_020975	TG	3	6	158686	158691	0 %	50 %	50 %	0 %	478471299
3515	NC_020975	T	6	6	158705	158710	0 %	100 %	0 %	0 %	478471299
3516	NC_020975	AGA	2	6	158727	158732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471299
3517	NC_020975	AAAG	2	8	158764	158771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020975	TTTA	2	8	158773	158780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020975	CTC	2	6	158825	158830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_020975	CTA	2	6	158834	158839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_020975	AAG	2	6	158876	158881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020975	TAAT	2	8	158890	158897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020975	TCCTTG	2	12	158955	158966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478471300
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3533	NC_020975	T	6	6	159519	159524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020975	G	7	7	159525	159531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020975	GTT	2	6	159639	159644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_020975	T	7	7	159669	159675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3538	NC_020975	TAAT	2	8	159726	159733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_020975	ATT	2	6	159793	159798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478471301
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3541	NC_020975	CAT	2	6	159945	159950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471301
3542	NC_020975	TCAA	2	8	160006	160013	50 %	25 %	0 %	25 %	478471301
3543	NC_020975	GAA	2	6	160231	160236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471301
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3549	NC_020975	TAG	2	6	160419	160424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478471301
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3561	NC_020975	GA	3	6	160957	160962	50 %	0 %	50 %	0 %	478471302
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3565	NC_020975	A	8	8	161142	161149	100 %	0 %	0 %	0 %	478471302
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3592	NC_020975	GAG	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3597	NC_020975	GAA	3	9	162855	162863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478471304
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3599	NC_020975	ATCT	2	8	162984	162991	25 %	50 %	0 %	25 %	478471304
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3609	NC_020975	TG	3	6	163450	163455	0 %	50 %	50 %	0 %	478471304
3610	NC_020975	AGC	2	6	163468	163473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478471304
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3612	NC_020975	TCGA	2	8	163500	163507	25 %	25 %	25 %	25 %	478471304
3613	NC_020975	AGAGA	2	10	163629	163638	60 %	0 %	40 %	0 %	478471304
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3616	NC_020975	TC	3	6	163690	163695	0 %	50 %	0 %	50 %	478471304
3617	NC_020975	TGT	2	6	163922	163927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478471304
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3623	NC_020975	AGCAA	2	10	164064	164073	60 %	0 %	20 %	20 %	478471304
3624	NC_020975	TAC	2	6	164090	164095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478471304
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