MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 22959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020974	TC	3	6	630945	630950	0 %	50 %	0 %	50 %	478463629
14002	NC_020974	AAG	2	6	631004	631009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463629
14003	NC_020974	AGGA	2	8	631085	631092	50 %	0 %	50 %	0 %	478463629
14004	NC_020974	TTA	2	6	631124	631129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463629
14005	NC_020974	CCTC	2	8	631163	631170	0 %	25 %	0 %	75 %	478463629
14006	NC_020974	ATC	2	6	631201	631206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463629
14007	NC_020974	AAC	2	6	631328	631333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463629
14008	NC_020974	A	7	7	631347	631353	100 %	0 %	0 %	0 %	478463629
14009	NC_020974	CT	3	6	631381	631386	0 %	50 %	0 %	50 %	478463629
14010	NC_020974	A	6	6	631507	631512	100 %	0 %	0 %	0 %	478463629
14011	NC_020974	ACA	2	6	631528	631533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463629
14012	NC_020974	AAGA	2	8	631549	631556	75 %	0 %	25 %	0 %	478463629
14013	NC_020974	GATT	2	8	631577	631584	25 %	50 %	25 %	0 %	478463630
14014	NC_020974	TCT	2	6	631595	631600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463630
14015	NC_020974	GCA	2	6	631648	631653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463630
14016	NC_020974	CTT	2	6	631664	631669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463630
14017	NC_020974	CTC	2	6	631688	631693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463630
14018	NC_020974	A	6	6	631718	631723	100 %	0 %	0 %	0 %	478463630
14019	NC_020974	CCT	2	6	631783	631788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463630
14020	NC_020974	AAG	2	6	631790	631795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463630
14021	NC_020974	TCC	2	6	631801	631806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463630
14022	NC_020974	CCT	2	6	631898	631903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463630
14023	NC_020974	ATT	2	6	631915	631920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463630
14024	NC_020974	TTC	2	6	631928	631933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463630
14025	NC_020974	ACA	2	6	631953	631958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463630
14026	NC_020974	CCT	2	6	631963	631968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463630
14027	NC_020974	A	6	6	632050	632055	100 %	0 %	0 %	0 %	478463630
14028	NC_020974	TCGAG	2	10	632060	632069	20 %	20 %	40 %	20 %	478463630
14029	NC_020974	T	6	6	632087	632092	0 %	100 %	0 %	0 %	478463630
14030	NC_020974	TTG	2	6	632117	632122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463630
14031	NC_020974	TCCT	2	8	632152	632159	0 %	50 %	0 %	50 %	478463630
14032	NC_020974	CAA	2	6	632236	632241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463630
14033	NC_020974	ATC	2	6	632263	632268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463630
14034	NC_020974	TCA	2	6	632279	632284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463630
14035	NC_020974	CTTT	2	8	632333	632340	0 %	75 %	0 %	25 %	478463630
14036	NC_020974	ATG	3	9	632383	632391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463630
14037	NC_020974	TC	4	8	632408	632415	0 %	50 %	0 %	50 %	478463630
14038	NC_020974	CTA	2	6	632461	632466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463630
14039	NC_020974	TGA	2	6	632474	632479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463630
14040	NC_020974	CAA	2	6	632518	632523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463631
14041	NC_020974	TTTG	2	8	632537	632544	0 %	75 %	25 %	0 %	478463631
14042	NC_020974	TTA	2	6	632565	632570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463631
14043	NC_020974	CTC	2	6	632587	632592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463631
14044	NC_020974	TAT	2	6	632594	632599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463631
14045	NC_020974	TGG	2	6	632623	632628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463631
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14048	NC_020974	TGC	2	6	632750	632755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463631
14049	NC_020974	GGCTC	2	10	632824	632833	0 %	20 %	40 %	40 %	478463632
14050	NC_020974	TA	3	6	632847	632852	50 %	50 %	0 %	0 %	478463632
14051	NC_020974	AGCC	2	8	632860	632867	25 %	0 %	25 %	50 %	478463632
14052	NC_020974	TCTT	2	8	632884	632891	0 %	75 %	0 %	25 %	478463632
14053	NC_020974	ATC	2	6	632925	632930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463632
14054	NC_020974	CT	3	6	632982	632987	0 %	50 %	0 %	50 %	478463632
14055	NC_020974	TGC	2	6	632998	633003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463632
14056	NC_020974	CTT	2	6	633066	633071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463632
14057	NC_020974	TGC	2	6	633128	633133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463632
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14059	NC_020974	CT	3	6	633194	633199	0 %	50 %	0 %	50 %	478463632
14060	NC_020974	ATT	2	6	633241	633246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463632
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14062	NC_020974	ATC	2	6	633318	633323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463632
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14065	NC_020974	ATC	2	6	633477	633482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463632
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14068	NC_020974	TGG	2	6	633567	633572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463632
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14072	NC_020974	A	9	9	633669	633677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_020974	CTCC	2	8	633681	633688	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14074	NC_020974	A	6	6	633689	633694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14076	NC_020974	TTG	2	6	633728	633733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_020974	TGC	2	6	633772	633777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463633
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14082	NC_020974	TG	3	6	634095	634100	0 %	50 %	50 %	0 %	478463633
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14085	NC_020974	T	6	6	634201	634206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_020974	A	6	6	634267	634272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14093	NC_020974	CG	3	6	634530	634535	0 %	0 %	50 %	50 %	478463634
14094	NC_020974	ATT	2	6	634586	634591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463634
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14101	NC_020974	GAA	2	6	634911	634916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463634
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14105	NC_020974	GCTCT	2	10	635065	635074	0 %	40 %	20 %	40 %	478463634
14106	NC_020974	TCGTT	2	10	635093	635102	0 %	60 %	20 %	20 %	478463634
14107	NC_020974	TTG	2	6	635135	635140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463634
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14111	NC_020974	AAAAT	2	10	635256	635265	80 %	20 %	0 %	0 %	478463634
14112	NC_020974	TGG	2	6	635311	635316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463635
14113	NC_020974	CCTT	2	8	635328	635335	0 %	50 %	0 %	50 %	478463635
14114	NC_020974	TCCAT	2	10	635394	635403	20 %	40 %	0 %	40 %	478463635
14115	NC_020974	AGAA	2	8	635404	635411	75 %	0 %	25 %	0 %	478463635
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14118	NC_020974	CTA	2	6	635463	635468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463635
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14120	NC_020974	A	6	6	635562	635567	100 %	0 %	0 %	0 %	478463635
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14122	NC_020974	ATATCC	2	12	635682	635693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463635
14123	NC_020974	AGC	2	6	635720	635725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463635
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14125	NC_020974	TAAACA	2	12	635793	635804	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478463635
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14179	NC_020974	CCT	2	6	637794	637799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14244	NC_020974	GAT	2	6	641206	641211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463640
14245	NC_020974	C	9	9	641236	641244	0 %	0 %	0 %	100 %	478463640
14246	NC_020974	GTT	2	6	641290	641295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463640
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14248	NC_020974	GA	3	6	641360	641365	50 %	0 %	50 %	0 %	478463640
14249	NC_020974	CTT	2	6	641371	641376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463640
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14351	NC_020974	TTA	2	6	645936	645941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14352	NC_020974	TAG	2	6	645981	645986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14359	NC_020974	A	6	6	646073	646078	100 %	0 %	0 %	0 %	478463644
14360	NC_020974	TGC	2	6	646102	646107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463644
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14362	NC_020974	TC	3	6	646237	646242	0 %	50 %	0 %	50 %	478463644
14363	NC_020974	TCC	2	6	646248	646253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463644
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