MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 22959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020974	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478463083
502	NC_020974	TCT	2	6	22679	22684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463083
503	NC_020974	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	478463083
504	NC_020974	TTG	2	6	22873	22878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463083
505	NC_020974	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463083
506	NC_020974	T	6	6	23019	23024	0 %	100 %	0 %	0 %	478463083
507	NC_020974	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478463083
508	NC_020974	CTG	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463083
509	NC_020974	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463083
510	NC_020974	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
511	NC_020974	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463083
512	NC_020974	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478463083
513	NC_020974	AGA	2	6	23482	23487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
514	NC_020974	TGA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463083
515	NC_020974	GAA	2	6	23551	23556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
516	NC_020974	TTG	2	6	23573	23578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463083
517	NC_020974	AGA	2	6	23633	23638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
518	NC_020974	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478463083
519	NC_020974	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478463083
520	NC_020974	TGC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463083
521	NC_020974	ATT	2	6	23772	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463083
522	NC_020974	AAT	2	6	23814	23819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463083
523	NC_020974	TTG	2	6	23877	23882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463083
524	NC_020974	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478463083
525	NC_020974	TGC	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463083
526	NC_020974	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478463083
527	NC_020974	GCA	2	6	24234	24239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463083
528	NC_020974	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478463083
529	NC_020974	AGA	2	6	24308	24313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
530	NC_020974	GAG	2	6	24331	24336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463083
531	NC_020974	TTC	2	6	24394	24399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463083
532	NC_020974	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478463083
533	NC_020974	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478463083
534	NC_020974	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478463083
535	NC_020974	GAA	2	6	24653	24658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
536	NC_020974	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478463083
537	NC_020974	GTT	2	6	24747	24752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463083
538	NC_020974	CTT	2	6	24841	24846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463083
539	NC_020974	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478463083
540	NC_020974	TAA	2	6	24914	24919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463083
541	NC_020974	GAA	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
542	NC_020974	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463083
543	NC_020974	A	7	7	25160	25166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020974	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020974	T	9	9	25188	25196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020974	T	6	6	25220	25225	0 %	100 %	0 %	0 %	478463084
547	NC_020974	AGA	2	6	25347	25352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463084
548	NC_020974	TAA	2	6	25479	25484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463084
549	NC_020974	GGA	3	9	25511	25519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463084
550	NC_020974	GAT	2	6	25556	25561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463084
551	NC_020974	TTGA	2	8	25654	25661	25 %	50 %	25 %	0 %	478463084
552	NC_020974	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478463084
553	NC_020974	TGT	2	6	25969	25974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463084
554	NC_020974	TTA	2	6	25979	25984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463084
555	NC_020974	TTCC	2	8	26002	26009	0 %	50 %	0 %	50 %	478463084
556	NC_020974	TAG	2	6	26040	26045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463084
557	NC_020974	GTGAGG	2	12	26074	26085	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478463084
558	NC_020974	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478463084
559	NC_020974	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478463084
560	NC_020974	AGC	2	6	26158	26163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463084
561	NC_020974	T	6	6	26167	26172	0 %	100 %	0 %	0 %	478463084
562	NC_020974	T	6	6	26198	26203	0 %	100 %	0 %	0 %	478463084
563	NC_020974	AAG	2	6	26304	26309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463084
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565	NC_020974	GT	3	6	26340	26345	0 %	50 %	50 %	0 %	478463084
566	NC_020974	TA	3	6	26542	26547	50 %	50 %	0 %	0 %	478463084
567	NC_020974	T	6	6	26551	26556	0 %	100 %	0 %	0 %	478463084
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570	NC_020974	TAG	2	6	26736	26741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463084
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574	NC_020974	GCTT	2	8	26888	26895	0 %	50 %	25 %	25 %	478463084
575	NC_020974	CTT	2	6	26958	26963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463084
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578	NC_020974	GAA	2	6	27030	27035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463084
579	NC_020974	CGA	2	6	27038	27043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463084
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581	NC_020974	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_020974	ACT	2	6	27127	27132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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584	NC_020974	T	7	7	27155	27161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_020974	AAAG	2	8	27594	27601	75 %	0 %	25 %	0 %	478463085
593	NC_020974	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	478463085
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599	NC_020974	T	6	6	27890	27895	0 %	100 %	0 %	0 %	478463085
600	NC_020974	TGA	2	6	27903	27908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463085
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602	NC_020974	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478463085
603	NC_020974	A	7	7	27961	27967	100 %	0 %	0 %	0 %	478463085
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615	NC_020974	A	6	6	28410	28415	100 %	0 %	0 %	0 %	478463086
616	NC_020974	T	7	7	28469	28475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020974	TAA	2	6	28480	28485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020974	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_020974	ATTG	2	8	28538	28545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020974	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020974	AGA	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020974	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463087
623	NC_020974	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478463087
624	NC_020974	TTC	2	6	28775	28780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463087
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628	NC_020974	GAG	2	6	28961	28966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463087
629	NC_020974	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478463087
630	NC_020974	GCA	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463087
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