MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 22959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020974	CCA	2	6	249384	249389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478463281
5502	NC_020974	AAC	2	6	249437	249442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463281
5503	NC_020974	AATA	2	8	249491	249498	75 %	25 %	0 %	0 %	478463281
5504	NC_020974	GCT	2	6	249501	249506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463281
5505	NC_020974	ACA	2	6	249566	249571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463281
5506	NC_020974	CCA	2	6	249598	249603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478463281
5507	NC_020974	CAA	2	6	249646	249651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463281
5508	NC_020974	CCCA	2	8	249771	249778	25 %	0 %	0 %	75 %	478463282
5509	NC_020974	CTT	2	6	249900	249905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463282
5510	NC_020974	AAT	2	6	249979	249984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463282
5511	NC_020974	CTC	2	6	249990	249995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463282
5512	NC_020974	ACT	2	6	249998	250003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463282
5513	NC_020974	GAA	2	6	250016	250021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463282
5514	NC_020974	CTC	2	6	250047	250052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463282
5515	NC_020974	GCAA	2	8	250061	250068	50 %	0 %	25 %	25 %	478463282
5516	NC_020974	AAC	2	6	250078	250083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463282
5517	NC_020974	GTT	2	6	250123	250128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463282
5518	NC_020974	AAC	2	6	250162	250167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_020974	A	6	6	250176	250181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020974	TAA	2	6	250227	250232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020974	TTC	2	6	250245	250250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463283
5522	NC_020974	GCT	2	6	250277	250282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463283
5523	NC_020974	T	7	7	250286	250292	0 %	100 %	0 %	0 %	478463283
5524	NC_020974	AGCA	2	8	250323	250330	50 %	0 %	25 %	25 %	478463283
5525	NC_020974	CTT	2	6	250340	250345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463283
5526	NC_020974	TCT	3	9	250351	250359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463283
5527	NC_020974	GATAA	2	10	250379	250388	60 %	20 %	20 %	0 %	478463283
5528	NC_020974	TCG	2	6	250445	250450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463283
5529	NC_020974	CATA	2	8	250466	250473	50 %	25 %	0 %	25 %	478463283
5530	NC_020974	TCC	2	6	250485	250490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463283
5531	NC_020974	TAA	2	6	250518	250523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463283
5532	NC_020974	AG	4	8	250543	250550	50 %	0 %	50 %	0 %	478463283
5533	NC_020974	A	6	6	250562	250567	100 %	0 %	0 %	0 %	478463283
5534	NC_020974	AGA	2	6	250573	250578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463283
5535	NC_020974	CAC	2	6	250580	250585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478463283
5536	NC_020974	CAA	2	6	250626	250631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463283
5537	NC_020974	GTA	2	6	250648	250653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463283
5538	NC_020974	ACA	2	6	250707	250712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463283
5539	NC_020974	A	6	6	250747	250752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_020974	TA	3	6	250794	250799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_020974	CCAA	2	8	250829	250836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_020974	A	7	7	250853	250859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_020974	TAT	2	6	250872	250877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463284
5544	NC_020974	TTCA	2	8	250904	250911	25 %	50 %	0 %	25 %	478463284
5545	NC_020974	AGA	3	9	250940	250948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463284
5546	NC_020974	TGTT	2	8	250978	250985	0 %	75 %	25 %	0 %	478463284
5547	NC_020974	CGA	2	6	251099	251104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463284
5548	NC_020974	GCAAA	2	10	251111	251120	60 %	0 %	20 %	20 %	478463284
5549	NC_020974	AATA	2	8	251197	251204	75 %	25 %	0 %	0 %	478463284
5550	NC_020974	A	6	6	251263	251268	100 %	0 %	0 %	0 %	478463284
5551	NC_020974	A	7	7	251294	251300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020974	ATA	2	6	251308	251313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020974	CCT	2	6	251363	251368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_020974	AAAC	2	8	251437	251444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_020974	AAG	2	6	251561	251566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463285
5556	NC_020974	AGC	2	6	251595	251600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463285
5557	NC_020974	CAAT	2	8	251701	251708	50 %	25 %	0 %	25 %	478463285
5558	NC_020974	TTA	2	6	251773	251778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463285
5559	NC_020974	CTTCT	2	10	251805	251814	0 %	60 %	0 %	40 %	478463285
5560	NC_020974	T	6	6	251848	251853	0 %	100 %	0 %	0 %	478463285
5561	NC_020974	CA	3	6	251907	251912	50 %	0 %	0 %	50 %	478463285
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5566	NC_020974	TAG	2	6	252137	252142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463285
5567	NC_020974	TTTTTA	2	12	252159	252170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_020974	GAG	2	6	252286	252291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_020974	ATT	2	6	252298	252303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463286
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5571	NC_020974	ACG	2	6	252308	252313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463286
5572	NC_020974	CCTGCA	2	12	252319	252330	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478463286
5573	NC_020974	CTG	2	6	252376	252381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463286
5574	NC_020974	TTG	2	6	252407	252412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463286
5575	NC_020974	TCTG	2	8	252432	252439	0 %	50 %	25 %	25 %	478463286
5576	NC_020974	TCC	2	6	252462	252467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463286
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5579	NC_020974	TACT	2	8	252537	252544	25 %	50 %	0 %	25 %	478463286
5580	NC_020974	CGA	2	6	252552	252557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463286
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5583	NC_020974	ACG	2	6	252659	252664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463286
5584	NC_020974	AACC	2	8	252703	252710	50 %	0 %	0 %	50 %	478463286
5585	NC_020974	CAG	2	6	252727	252732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463286
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5589	NC_020974	GCT	2	6	252888	252893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463286
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5591	NC_020974	ATA	2	6	252999	253004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020974	AAT	2	6	253023	253028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020974	AG	3	6	253085	253090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_020974	A	8	8	253103	253110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_020974	TC	3	6	253111	253116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_020974	TC	3	6	253197	253202	0 %	50 %	0 %	50 %	478463287
5597	NC_020974	A	6	6	253206	253211	100 %	0 %	0 %	0 %	478463287
5598	NC_020974	ATG	2	6	253217	253222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463287
5599	NC_020974	ATCT	2	8	253266	253273	25 %	50 %	0 %	25 %	478463287
5600	NC_020974	T	7	7	253308	253314	0 %	100 %	0 %	0 %	478463287
5601	NC_020974	GCT	2	6	253318	253323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463287
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5603	NC_020974	T	6	6	253349	253354	0 %	100 %	0 %	0 %	478463287
5604	NC_020974	CT	4	8	253417	253424	0 %	50 %	0 %	50 %	478463287
5605	NC_020974	TTA	2	6	253482	253487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463287
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5608	NC_020974	CTT	2	6	253715	253720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463287
5609	NC_020974	TC	3	6	253770	253775	0 %	50 %	0 %	50 %	478463287
5610	NC_020974	TTC	2	6	253878	253883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463287
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5612	NC_020974	TC	3	6	253908	253913	0 %	50 %	0 %	50 %	478463287
5613	NC_020974	TCT	2	6	253970	253975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463287
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5615	NC_020974	GTTTT	2	10	254043	254052	0 %	80 %	20 %	0 %	478463287
5616	NC_020974	TTA	2	6	254067	254072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463287
5617	NC_020974	CATT	2	8	254091	254098	25 %	50 %	0 %	25 %	478463287
5618	NC_020974	CAC	2	6	254101	254106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478463287
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5622	NC_020974	TGC	2	6	254342	254347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463287
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5624	NC_020974	A	6	6	254366	254371	100 %	0 %	0 %	0 %	478463287
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6000	NC_020974	CT	3	6	272053	272058	0 %	50 %	0 %	50 %	478463303

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