MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 22959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020974	CTTC	2	8	226414	226421	0 %	50 %	0 %	50 %	478463261
5003	NC_020974	TTAT	2	8	226516	226523	25 %	75 %	0 %	0 %	478463261
5004	NC_020974	CTAT	2	8	226535	226542	25 %	50 %	0 %	25 %	478463261
5005	NC_020974	TCTT	2	8	226582	226589	0 %	75 %	0 %	25 %	478463261
5006	NC_020974	TGC	2	6	226625	226630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463261
5007	NC_020974	CTTAGC	2	12	226631	226642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478463261
5008	NC_020974	GGA	2	6	226662	226667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463261
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5010	NC_020974	TGG	2	6	226734	226739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463261
5011	NC_020974	TTGG	2	8	226778	226785	0 %	50 %	50 %	0 %	478463261
5012	NC_020974	TGG	3	9	226797	226805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463261
5013	NC_020974	GTC	2	6	226851	226856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463262
5014	NC_020974	CTT	2	6	226889	226894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463262
5015	NC_020974	AGA	2	6	226935	226940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463262
5016	NC_020974	CTT	2	6	226957	226962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463262
5017	NC_020974	CTA	2	6	227016	227021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463262
5018	NC_020974	ATTT	2	8	227025	227032	25 %	75 %	0 %	0 %	478463262
5019	NC_020974	TGG	2	6	227103	227108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463262
5020	NC_020974	AAT	3	9	227203	227211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463262
5021	NC_020974	GAA	2	6	227302	227307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463262
5022	NC_020974	GC	3	6	227314	227319	0 %	0 %	50 %	50 %	478463262
5023	NC_020974	ATT	2	6	227362	227367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463262
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5026	NC_020974	CATC	2	8	227531	227538	25 %	25 %	0 %	50 %	478463262
5027	NC_020974	TTA	2	6	227588	227593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463262
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5030	NC_020974	ATA	2	6	227728	227733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463262
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5032	NC_020974	TCT	2	6	227878	227883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463262
5033	NC_020974	T	6	6	228057	228062	0 %	100 %	0 %	0 %	478463262
5034	NC_020974	GC	3	6	228216	228221	0 %	0 %	50 %	50 %	478463262
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5039	NC_020974	GGA	2	6	228402	228407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463262
5040	NC_020974	TGA	2	6	228417	228422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463262
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5042	NC_020974	AATG	2	8	228454	228461	50 %	25 %	25 %	0 %	478463262
5043	NC_020974	ATT	2	6	228503	228508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463262
5044	NC_020974	ATG	2	6	228549	228554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463263
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5054	NC_020974	C	6	6	229052	229057	0 %	0 %	0 %	100 %	478463263
5055	NC_020974	A	6	6	229092	229097	100 %	0 %	0 %	0 %	478463263
5056	NC_020974	AAG	2	6	229153	229158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463263
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5063	NC_020974	GCTA	2	8	229486	229493	25 %	25 %	25 %	25 %	478463264
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5095	NC_020974	AGA	2	6	231026	231031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_020974	GCT	2	6	231095	231100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_020974	ACC	2	6	231104	231109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_020974	A	6	6	231135	231140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020974	ACT	2	6	231199	231204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5102	NC_020974	T	7	7	231350	231356	0 %	100 %	0 %	0 %	478463265
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5105	NC_020974	AATA	2	8	231456	231463	75 %	25 %	0 %	0 %	478463265
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5107	NC_020974	CCT	2	6	231518	231523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463265
5108	NC_020974	TCC	2	6	231541	231546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463265
5109	NC_020974	CTG	2	6	231561	231566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463265
5110	NC_020974	AAG	2	6	231627	231632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463265
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5114	NC_020974	GTT	2	6	231945	231950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463265
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5118	NC_020974	A	6	6	232100	232105	100 %	0 %	0 %	0 %	478463265
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5122	NC_020974	TC	3	6	232298	232303	0 %	50 %	0 %	50 %	478463265
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