MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 2383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020973	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478462165
2	NC_020973	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478462165
3	NC_020973	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020973	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020973	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478462168
6	NC_020973	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478462168
7	NC_020973	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478462168
8	NC_020973	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478462169
9	NC_020973	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478462170
10	NC_020973	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478462170
11	NC_020973	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478462170
12	NC_020973	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478462170
13	NC_020973	TA	3	6	6200	6205	50 %	50 %	0 %	0 %	478462170
14	NC_020973	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478462170
15	NC_020973	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020973	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478462172
17	NC_020973	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478462173
18	NC_020973	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478462173
19	NC_020973	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478462173
20	NC_020973	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020973	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478462175
22	NC_020973	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478462175
23	NC_020973	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020973	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478462176
25	NC_020973	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478462176
26	NC_020973	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478462177
27	NC_020973	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478462177
28	NC_020973	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478462177
29	NC_020973	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020973	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020973	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478462178
32	NC_020973	CT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	0 %	50 %	478462178
33	NC_020973	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478462179
34	NC_020973	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478462179
35	NC_020973	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478462180
36	NC_020973	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478462180
37	NC_020973	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478462180
38	NC_020973	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020973	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020973	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478462181
41	NC_020973	TC	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	478462181
42	NC_020973	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020973	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478462182
44	NC_020973	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478462182
45	NC_020973	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478462182
46	NC_020973	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478462182
47	NC_020973	AG	4	8	20116	20123	50 %	0 %	50 %	0 %	478462182
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50	NC_020973	TG	3	6	20720	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	478462183
51	NC_020973	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020973	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020973	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020973	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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60	NC_020973	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478462184
61	NC_020973	GA	3	6	26319	26324	50 %	0 %	50 %	0 %	478462185
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64	NC_020973	GA	3	6	26987	26992	50 %	0 %	50 %	0 %	478462185
65	NC_020973	GA	3	6	27111	27116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020973	CT	3	6	27118	27123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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70	NC_020973	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020973	TG	3	6	28992	28997	0 %	50 %	50 %	0 %	478462188
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91	NC_020973	GA	3	6	36983	36988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_020973	GA	3	6	41625	41630	50 %	0 %	50 %	0 %	478462200
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111	NC_020973	GA	3	6	42601	42606	50 %	0 %	50 %	0 %	478462201
112	NC_020973	GA	4	8	42611	42618	50 %	0 %	50 %	0 %	478462201
113	NC_020973	AG	3	6	42847	42852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020973	CT	3	6	42913	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020973	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020973	TG	3	6	43606	43611	0 %	50 %	50 %	0 %	478462202
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118	NC_020973	TC	3	6	44170	44175	0 %	50 %	0 %	50 %	478462203
119	NC_020973	TC	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020973	TA	3	6	44487	44492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020973	TC	3	6	45399	45404	0 %	50 %	0 %	50 %	478462204
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124	NC_020973	AG	3	6	46111	46116	50 %	0 %	50 %	0 %	478462205
125	NC_020973	AG	4	8	46552	46559	50 %	0 %	50 %	0 %	478462206
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128	NC_020973	AG	3	6	46997	47002	50 %	0 %	50 %	0 %	478462206
129	NC_020973	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_020973	GA	3	6	53964	53969	50 %	0 %	50 %	0 %	478462212
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139	NC_020973	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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