MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020973	AGAGT	2	10	181268	181277	40 %	20 %	40 %	0 %	478462319
4002	NC_020973	GAA	2	6	181323	181328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462319
4003	NC_020973	AGG	2	6	181345	181350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462319
4004	NC_020973	AAG	3	9	181351	181359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462319
4005	NC_020973	TGA	2	6	181472	181477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020973	TTCC	2	8	181602	181609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_020973	ACA	2	6	181629	181634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_020973	TCTA	2	8	181670	181677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_020973	GAA	2	6	181749	181754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020973	ATT	2	6	181785	181790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020973	AATT	2	8	181804	181811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020973	TGT	2	6	181828	181833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020973	T	6	6	181932	181937	0 %	100 %	0 %	0 %	478462320
4014	NC_020973	TTGAA	2	10	181958	181967	40 %	40 %	20 %	0 %	478462320
4015	NC_020973	TTTG	2	8	181972	181979	0 %	75 %	25 %	0 %	478462320
4016	NC_020973	ATC	2	6	182069	182074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462320
4017	NC_020973	TGCA	2	8	182090	182097	25 %	25 %	25 %	25 %	478462320
4018	NC_020973	TGT	2	6	182108	182113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462320
4019	NC_020973	AGT	2	6	182127	182132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462320
4020	NC_020973	CT	3	6	182172	182177	0 %	50 %	0 %	50 %	478462320
4021	NC_020973	T	6	6	182177	182182	0 %	100 %	0 %	0 %	478462320
4022	NC_020973	CTC	2	6	182206	182211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462320
4023	NC_020973	GA	3	6	182251	182256	50 %	0 %	50 %	0 %	478462320
4024	NC_020973	GAT	2	6	182306	182311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462320
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4026	NC_020973	CGA	2	6	182640	182645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462320
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4028	NC_020973	ATT	2	6	182706	182711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462320
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4030	NC_020973	TGAGT	2	10	182772	182781	20 %	40 %	40 %	0 %	478462320
4031	NC_020973	CTT	2	6	182850	182855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462320
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4034	NC_020973	AGGGG	2	10	182969	182978	20 %	0 %	80 %	0 %	478462320
4035	NC_020973	GA	3	6	183010	183015	50 %	0 %	50 %	0 %	478462320
4036	NC_020973	GAA	2	6	183051	183056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462320
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4038	NC_020973	AGAAA	2	10	183137	183146	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020973	AAGA	2	8	183158	183165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020973	T	8	8	183182	183189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020973	AGAAAA	2	12	183200	183211	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020973	A	6	6	183208	183213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020973	TCG	2	6	183248	183253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462321
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4046	NC_020973	T	7	7	183285	183291	0 %	100 %	0 %	0 %	478462321
4047	NC_020973	AAG	2	6	183338	183343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462321
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4049	NC_020973	TCT	2	6	183386	183391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462321
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4052	NC_020973	TTGAG	2	10	183519	183528	20 %	40 %	40 %	0 %	478462321
4053	NC_020973	ATAGA	2	10	183541	183550	60 %	20 %	20 %	0 %	478462321
4054	NC_020973	CT	3	6	183594	183599	0 %	50 %	0 %	50 %	478462321
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4062	NC_020973	TTG	2	6	183775	183780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462321
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4064	NC_020973	GAT	2	6	183814	183819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462321
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4072	NC_020973	GCA	2	6	184040	184045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_020973	A	7	7	184813	184819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_020973	TAT	2	6	184891	184896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_020973	GA	3	6	184931	184936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_020973	GA	3	6	184963	184968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_020973	AGA	2	6	184973	184978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4106	NC_020973	CTG	2	6	185221	185226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462323
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4109	NC_020973	AGT	2	6	185403	185408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462323
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4111	NC_020973	TCA	2	6	185515	185520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462324
4112	NC_020973	GGA	2	6	185530	185535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462324
4113	NC_020973	AGAGA	2	10	185623	185632	60 %	0 %	40 %	0 %	478462324
4114	NC_020973	GCA	2	6	185719	185724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462324
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4117	NC_020973	ATA	2	6	186145	186150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462324
4118	NC_020973	TCTA	2	8	186186	186193	25 %	50 %	0 %	25 %	478462324
4119	NC_020973	GTT	2	6	186246	186251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020973	TGC	2	6	186379	186384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462325
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4122	NC_020973	AC	3	6	186418	186423	50 %	0 %	0 %	50 %	478462325
4123	NC_020973	AGA	2	6	186517	186522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462325
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4125	NC_020973	T	6	6	186660	186665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020973	T	7	7	186668	186674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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