MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3005	NC_020973	GTTT	2	8	135444	135451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_020973	T	7	7	135459	135465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_020973	T	7	7	139405	139411	0 %	100 %	0 %	0 %	478462284
3110	NC_020973	GAAA	2	8	139432	139439	75 %	0 %	25 %	0 %	478462284
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3123	NC_020973	AG	3	6	140252	140257	50 %	0 %	50 %	0 %	478462286
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3125	NC_020973	TTA	2	6	140359	140364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462286
3126	NC_020973	GTT	2	6	140394	140399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462286
3127	NC_020973	AGA	2	6	140459	140464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462286
3128	NC_020973	TCCAG	2	10	140486	140495	20 %	20 %	20 %	40 %	478462286
3129	NC_020973	GAA	2	6	140537	140542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462287
3130	NC_020973	ATTG	2	8	140546	140553	25 %	50 %	25 %	0 %	478462287
3131	NC_020973	ATT	2	6	140580	140585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462287
3132	NC_020973	AAG	2	6	140641	140646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462287
3133	NC_020973	CTT	2	6	140658	140663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462287
3134	NC_020973	GCA	2	6	140697	140702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462287
3135	NC_020973	CCTA	2	8	140707	140714	25 %	25 %	0 %	50 %	478462287
3136	NC_020973	GCT	2	6	140733	140738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462287
3137	NC_020973	GTG	2	6	140940	140945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478462287
3138	NC_020973	TCA	2	6	140998	141003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462287
3139	NC_020973	TAA	2	6	141107	141112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462287
3140	NC_020973	GTACA	2	10	141217	141226	40 %	20 %	20 %	20 %	478462287
3141	NC_020973	AGA	2	6	141248	141253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462287
3142	NC_020973	GAA	2	6	141432	141437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462287
3143	NC_020973	TAA	2	6	141566	141571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462287
3144	NC_020973	TAGAT	2	10	141590	141599	40 %	40 %	20 %	0 %	478462287
3145	NC_020973	TAT	2	6	141600	141605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462287
3146	NC_020973	CTCC	2	8	141606	141613	0 %	25 %	0 %	75 %	478462287
3147	NC_020973	CTG	2	6	141622	141627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462287
3148	NC_020973	CCT	2	6	141666	141671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462287
3149	NC_020973	TAT	2	6	141672	141677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462287
3150	NC_020973	TGG	2	6	141767	141772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478462287
3151	NC_020973	TCA	2	6	141794	141799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462287
3152	NC_020973	TCT	2	6	141824	141829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462287
3153	NC_020973	ATTA	2	8	141843	141850	50 %	50 %	0 %	0 %	478462287
3154	NC_020973	T	8	8	141912	141919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_020973	T	6	6	141957	141962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_020973	AAG	2	6	141966	141971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_020973	AAAAG	2	10	142002	142011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_020973	T	6	6	142026	142031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_020973	GCT	2	6	142062	142067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3160	NC_020973	A	6	6	142078	142083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_020973	ATC	2	6	142086	142091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3162	NC_020973	A	6	6	142135	142140	100 %	0 %	0 %	0 %	478462288
3163	NC_020973	CTC	2	6	142285	142290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462288
3164	NC_020973	AAAAC	2	10	142482	142491	80 %	0 %	0 %	20 %	478462288
3165	NC_020973	AGA	2	6	142636	142641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462289
3166	NC_020973	TGGAAA	2	12	142674	142685	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478462289
3167	NC_020973	GGA	2	6	142810	142815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462289
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3169	NC_020973	CTT	2	6	142911	142916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462289
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3171	NC_020973	A	6	6	142945	142950	100 %	0 %	0 %	0 %	478462289
3172	NC_020973	AT	3	6	143013	143018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_020973	CTT	2	6	143040	143045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3174	NC_020973	AAG	2	6	143050	143055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462290
3175	NC_020973	AAAG	2	8	143130	143137	75 %	0 %	25 %	0 %	478462290
3176	NC_020973	T	6	6	143174	143179	0 %	100 %	0 %	0 %	478462290
3177	NC_020973	GCA	2	6	143182	143187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462290
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3185	NC_020973	GAAA	2	8	143463	143470	75 %	0 %	25 %	0 %	478462290
3186	NC_020973	AG	3	6	143482	143487	50 %	0 %	50 %	0 %	478462290
3187	NC_020973	GAA	2	6	143491	143496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462290
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3192	NC_020973	GGAGC	2	10	143615	143624	20 %	0 %	60 %	20 %	478462290
3193	NC_020973	A	6	6	143656	143661	100 %	0 %	0 %	0 %	478462290
3194	NC_020973	CTT	2	6	143663	143668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462290
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3198	NC_020973	AGA	2	6	143757	143762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462290
3199	NC_020973	ATGGTT	2	12	143793	143804	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478462290
3200	NC_020973	ATA	2	6	143876	143881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462290
3201	NC_020973	TTG	2	6	143952	143957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3202	NC_020973	TCA	2	6	144000	144005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462291
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3204	NC_020973	TTG	2	6	144083	144088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462291
3205	NC_020973	TGA	2	6	144112	144117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462291
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3212	NC_020973	GTC	2	6	144466	144471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462291
3213	NC_020973	TAA	2	6	144473	144478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462291
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3215	NC_020973	ATA	3	9	144699	144707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462291
3216	NC_020973	GATC	2	8	144720	144727	25 %	25 %	25 %	25 %	478462291
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3218	NC_020973	TAA	2	6	144738	144743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3219	NC_020973	T	7	7	144802	144808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_020973	T	7	7	144831	144837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_020973	T	7	7	144864	144870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_020973	CTT	2	6	144967	144972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462292
3223	NC_020973	GT	3	6	145015	145020	0 %	50 %	50 %	0 %	478462292
3224	NC_020973	CTGGG	2	10	145030	145039	0 %	20 %	60 %	20 %	478462292
3225	NC_020973	TTCA	2	8	145132	145139	25 %	50 %	0 %	25 %	478462292
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3228	NC_020973	CTG	2	6	145229	145234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462292
3229	NC_020973	CTTA	2	8	145235	145242	25 %	50 %	0 %	25 %	478462292
3230	NC_020973	TGCG	2	8	145253	145260	0 %	25 %	50 %	25 %	478462292
3231	NC_020973	CAA	2	6	145282	145287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462292
3232	NC_020973	GCA	2	6	145294	145299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462292
3233	NC_020973	TCT	2	6	145328	145333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462292
3234	NC_020973	TTC	2	6	145367	145372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462292
3235	NC_020973	GTTT	2	8	145389	145396	0 %	75 %	25 %	0 %	478462292
3236	NC_020973	AG	3	6	145407	145412	50 %	0 %	50 %	0 %	478462292
3237	NC_020973	GTA	2	6	145426	145431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462292
3238	NC_020973	ACA	2	6	145701	145706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462293
3239	NC_020973	GTA	2	6	145747	145752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462293
3240	NC_020973	TCC	2	6	145769	145774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462293
3241	NC_020973	GTTTT	2	10	145777	145786	0 %	80 %	20 %	0 %	478462293
3242	NC_020973	CAA	2	6	145788	145793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462293
3243	NC_020973	GAT	2	6	145844	145849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462293
3244	NC_020973	A	6	6	145854	145859	100 %	0 %	0 %	0 %	478462293
3245	NC_020973	GA	4	8	145866	145873	50 %	0 %	50 %	0 %	478462293
3246	NC_020973	TCT	2	6	145895	145900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462293
3247	NC_020973	TCA	2	6	145940	145945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462293
3248	NC_020973	TGCTCT	2	12	145985	145996	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478462293
3249	NC_020973	TGA	2	6	146018	146023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462293
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3251	NC_020973	ACG	2	6	146203	146208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462293
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3356	NC_020973	TAA	2	6	150983	150988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3359	NC_020973	T	6	6	151140	151145	0 %	100 %	0 %	0 %	478462296
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3362	NC_020973	GTC	2	6	151237	151242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462296
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3373	NC_020973	TGA	2	6	151534	151539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462296
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3377	NC_020973	AAG	2	6	151986	151991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3378	NC_020973	GTT	2	6	151994	151999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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