MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020973	AAG	2	6	69035	69040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462222
1503	NC_020973	ACA	2	6	69120	69125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_020973	GCA	2	6	69193	69198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462223
1505	NC_020973	CAAGC	2	10	69203	69212	40 %	0 %	20 %	40 %	478462223
1506	NC_020973	A	6	6	69239	69244	100 %	0 %	0 %	0 %	478462223
1507	NC_020973	TCT	2	6	69380	69385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462223
1508	NC_020973	CTG	2	6	69411	69416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462223
1509	NC_020973	ATG	2	6	69419	69424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462223
1510	NC_020973	AAAAG	2	10	69451	69460	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020973	A	6	6	69552	69557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020973	TA	3	6	69587	69592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020973	TTC	2	6	69627	69632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462224
1514	NC_020973	CTT	3	9	69636	69644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462224
1515	NC_020973	AT	3	6	69649	69654	50 %	50 %	0 %	0 %	478462224
1516	NC_020973	TTCG	2	8	69669	69676	0 %	50 %	25 %	25 %	478462224
1517	NC_020973	TGT	2	6	69694	69699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462224
1518	NC_020973	TGAT	2	8	69786	69793	25 %	50 %	25 %	0 %	478462224
1519	NC_020973	T	6	6	69834	69839	0 %	100 %	0 %	0 %	478462224
1520	NC_020973	TCT	2	6	69950	69955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462224
1521	NC_020973	GGAGC	2	10	70073	70082	20 %	0 %	60 %	20 %	478462224
1522	NC_020973	TGC	2	6	70156	70161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462224
1523	NC_020973	A	7	7	70193	70199	100 %	0 %	0 %	0 %	478462224
1524	NC_020973	CT	3	6	70201	70206	0 %	50 %	0 %	50 %	478462224
1525	NC_020973	AGA	2	6	70210	70215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462224
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1527	NC_020973	GCGAT	2	10	70263	70272	20 %	20 %	40 %	20 %	478462224
1528	NC_020973	GTT	2	6	70285	70290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462224
1529	NC_020973	GCT	2	6	70307	70312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462224
1530	NC_020973	GCA	3	9	70409	70417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462224
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1532	NC_020973	GCA	2	6	70456	70461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462224
1533	NC_020973	ATT	2	6	70470	70475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462224
1534	NC_020973	TAT	2	6	70578	70583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462224
1535	NC_020973	CTT	2	6	70602	70607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462224
1536	NC_020973	GA	3	6	70611	70616	50 %	0 %	50 %	0 %	478462224
1537	NC_020973	CTCTT	2	10	70617	70626	0 %	60 %	0 %	40 %	478462224
1538	NC_020973	AGAA	2	8	70629	70636	75 %	0 %	25 %	0 %	478462224
1539	NC_020973	TGA	2	6	70657	70662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462224
1540	NC_020973	TTG	2	6	70746	70751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462224
1541	NC_020973	TCT	2	6	70769	70774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462224
1542	NC_020973	GA	3	6	70810	70815	50 %	0 %	50 %	0 %	478462224
1543	NC_020973	AGCT	2	8	70851	70858	25 %	25 %	25 %	25 %	478462224
1544	NC_020973	TGA	2	6	70897	70902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462224
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1547	NC_020973	TCAA	2	8	71056	71063	50 %	25 %	0 %	25 %	478462224
1548	NC_020973	GT	3	6	71086	71091	0 %	50 %	50 %	0 %	478462224
1549	NC_020973	CT	3	6	71167	71172	0 %	50 %	0 %	50 %	478462224
1550	NC_020973	GA	3	6	71188	71193	50 %	0 %	50 %	0 %	478462224
1551	NC_020973	AGT	2	6	71230	71235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462224
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1553	NC_020973	AAGAA	2	10	71305	71314	80 %	0 %	20 %	0 %	478462224
1554	NC_020973	AGA	2	6	71377	71382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462224
1555	NC_020973	TGA	2	6	71413	71418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462224
1556	NC_020973	TAT	2	6	71424	71429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462224
1557	NC_020973	T	6	6	71513	71518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020973	T	8	8	71534	71541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020973	CAT	2	6	71599	71604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462225
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1561	NC_020973	GCTT	2	8	71658	71665	0 %	50 %	25 %	25 %	478462225
1562	NC_020973	A	6	6	71753	71758	100 %	0 %	0 %	0 %	478462225
1563	NC_020973	ATT	2	6	71803	71808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462225
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1565	NC_020973	TCC	2	6	71974	71979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462225
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1570	NC_020973	GAGC	2	8	72070	72077	25 %	0 %	50 %	25 %	478462225
1571	NC_020973	TCA	2	6	72095	72100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462225
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1573	NC_020973	CTATTT	2	12	72113	72124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478462225
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1585	NC_020973	T	6	6	72611	72616	0 %	100 %	0 %	0 %	478462226
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1599	NC_020973	GATT	2	8	73046	73053	25 %	50 %	25 %	0 %	478462226
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1611	NC_020973	ATCA	2	8	73581	73588	50 %	25 %	0 %	25 %	478462226
1612	NC_020973	TGT	2	6	73654	73659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462226
1613	NC_020973	GAAAA	2	10	73667	73676	80 %	0 %	20 %	0 %	478462226
1614	NC_020973	A	7	7	73673	73679	100 %	0 %	0 %	0 %	478462226
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1619	NC_020973	GA	3	6	73852	73857	50 %	0 %	50 %	0 %	478462227
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