MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020973	GAC	2	6	22629	22634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462184
502	NC_020973	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478462184
503	NC_020973	TCT	2	6	22679	22684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462184
504	NC_020973	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	478462184
505	NC_020973	TTG	2	6	22873	22878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462184
506	NC_020973	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462184
507	NC_020973	T	6	6	23019	23024	0 %	100 %	0 %	0 %	478462184
508	NC_020973	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478462184
509	NC_020973	CTG	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462184
510	NC_020973	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462184
511	NC_020973	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
512	NC_020973	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462184
513	NC_020973	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478462184
514	NC_020973	AGA	2	6	23482	23487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
515	NC_020973	TGA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462184
516	NC_020973	GAA	2	6	23551	23556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
517	NC_020973	TTG	2	6	23573	23578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462184
518	NC_020973	AGA	2	6	23633	23638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
519	NC_020973	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478462184
520	NC_020973	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478462184
521	NC_020973	TGC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462184
522	NC_020973	ATT	2	6	23772	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462184
523	NC_020973	AAT	2	6	23814	23819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462184
524	NC_020973	TTG	2	6	23877	23882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462184
525	NC_020973	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478462184
526	NC_020973	TGC	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462184
527	NC_020973	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478462184
528	NC_020973	GCA	2	6	24234	24239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462184
529	NC_020973	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478462184
530	NC_020973	AGA	2	6	24308	24313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
531	NC_020973	GAG	2	6	24331	24336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462184
532	NC_020973	TTC	2	6	24394	24399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462184
533	NC_020973	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478462184
534	NC_020973	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478462184
535	NC_020973	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478462184
536	NC_020973	GAA	2	6	24653	24658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
537	NC_020973	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478462184
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540	NC_020973	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478462184
541	NC_020973	TAA	2	6	24914	24919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462184
542	NC_020973	GAA	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
543	NC_020973	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462184
544	NC_020973	A	7	7	25160	25166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020973	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020973	T	8	8	25188	25195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020973	T	6	6	25219	25224	0 %	100 %	0 %	0 %	478462185
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550	NC_020973	GGA	3	9	25510	25518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462185
551	NC_020973	GAT	2	6	25555	25560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462185
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553	NC_020973	TAGG	2	8	25877	25884	25 %	25 %	50 %	0 %	478462185
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555	NC_020973	TTA	2	6	25978	25983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462185
556	NC_020973	TTCC	2	8	26001	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	478462185
557	NC_020973	TAG	2	6	26039	26044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462185
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559	NC_020973	TAGG	2	8	26115	26122	25 %	25 %	50 %	0 %	478462185
560	NC_020973	AGAGG	2	10	26131	26140	40 %	0 %	60 %	0 %	478462185
561	NC_020973	AGC	2	6	26157	26162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462185
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563	NC_020973	T	6	6	26197	26202	0 %	100 %	0 %	0 %	478462185
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567	NC_020973	TA	3	6	26541	26546	50 %	50 %	0 %	0 %	478462185
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582	NC_020973	CT	3	6	27118	27123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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594	NC_020973	GA	3	6	27618	27623	50 %	0 %	50 %	0 %	478462186
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601	NC_020973	T	6	6	27889	27894	0 %	100 %	0 %	0 %	478462186
602	NC_020973	TGA	2	6	27902	27907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462186
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604	NC_020973	GGATA	2	10	27936	27945	40 %	20 %	40 %	0 %	478462186
605	NC_020973	A	7	7	27960	27966	100 %	0 %	0 %	0 %	478462186
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617	NC_020973	A	6	6	28409	28414	100 %	0 %	0 %	0 %	478462187
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619	NC_020973	TAA	2	6	28479	28484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_020973	ATTG	2	8	28537	28544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020973	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020973	AGA	2	6	28591	28596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020973	GAA	2	6	28641	28646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462188
625	NC_020973	ATCCG	2	10	28661	28670	20 %	20 %	20 %	40 %	478462188
626	NC_020973	TTC	2	6	28774	28779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462188
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632	NC_020973	GCA	2	6	29016	29021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462188
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755	NC_020973	AGA	2	6	35265	35270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462196
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