MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020973	T	7	7	248697	248703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020973	A	6	6	248713	248718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_020973	GCAG	2	8	248726	248733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_020973	AG	3	6	248801	248806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020973	TAT	2	6	248824	248829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020973	ACA	2	6	248865	248870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_020973	A	6	6	248914	248919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_020973	TTG	2	6	249094	249099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462382
5509	NC_020973	TCT	2	6	249116	249121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462382
5510	NC_020973	TC	3	6	249163	249168	0 %	50 %	0 %	50 %	478462382
5511	NC_020973	T	7	7	249199	249205	0 %	100 %	0 %	0 %	478462382
5512	NC_020973	CCA	2	6	249212	249217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478462382
5513	NC_020973	AAC	2	6	249265	249270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462382
5514	NC_020973	AATA	2	8	249319	249326	75 %	25 %	0 %	0 %	478462382
5515	NC_020973	GCT	2	6	249329	249334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462382
5516	NC_020973	ACA	2	6	249394	249399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462382
5517	NC_020973	CCA	2	6	249426	249431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478462382
5518	NC_020973	CAA	2	6	249474	249479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462382
5519	NC_020973	CCCA	2	8	249599	249606	25 %	0 %	0 %	75 %	478462383
5520	NC_020973	CTT	2	6	249728	249733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462383
5521	NC_020973	AAT	2	6	249807	249812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462383
5522	NC_020973	CTC	2	6	249818	249823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462383
5523	NC_020973	ACT	2	6	249826	249831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462383
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5525	NC_020973	CTC	2	6	249875	249880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462383
5526	NC_020973	GCAA	2	8	249889	249896	50 %	0 %	25 %	25 %	478462383
5527	NC_020973	AAC	2	6	249906	249911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462383
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5529	NC_020973	AAC	2	6	249990	249995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_020973	A	6	6	250004	250009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_020973	TAA	2	6	250055	250060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_020973	TTC	2	6	250073	250078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462384
5533	NC_020973	GCT	2	6	250105	250110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462384
5534	NC_020973	T	7	7	250114	250120	0 %	100 %	0 %	0 %	478462384
5535	NC_020973	AGCA	2	8	250151	250158	50 %	0 %	25 %	25 %	478462384
5536	NC_020973	CTT	2	6	250168	250173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462384
5537	NC_020973	TCT	3	9	250179	250187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462384
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5539	NC_020973	TCG	2	6	250273	250278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462384
5540	NC_020973	CATA	2	8	250294	250301	50 %	25 %	0 %	25 %	478462384
5541	NC_020973	TCC	2	6	250313	250318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462384
5542	NC_020973	TAA	2	6	250346	250351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462384
5543	NC_020973	AG	4	8	250371	250378	50 %	0 %	50 %	0 %	478462384
5544	NC_020973	A	6	6	250390	250395	100 %	0 %	0 %	0 %	478462384
5545	NC_020973	AGA	2	6	250401	250406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462384
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5548	NC_020973	GTA	2	6	250476	250481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462384
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5550	NC_020973	A	6	6	250575	250580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020973	TA	3	6	250622	250627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020973	CCAA	2	8	250657	250664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_020973	A	7	7	250681	250687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020973	TAT	2	6	250700	250705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462385
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5556	NC_020973	AGA	3	9	250768	250776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462385
5557	NC_020973	TGTT	2	8	250806	250813	0 %	75 %	25 %	0 %	478462385
5558	NC_020973	CGA	2	6	250927	250932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462385
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5560	NC_020973	AATA	2	8	251025	251032	75 %	25 %	0 %	0 %	478462385
5561	NC_020973	A	6	6	251091	251096	100 %	0 %	0 %	0 %	478462385
5562	NC_020973	A	7	7	251122	251128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_020973	ATA	2	6	251136	251141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_020973	CCT	2	6	251191	251196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5579	NC_020973	GAG	2	6	252114	252119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5590	NC_020973	TACT	2	8	252365	252372	25 %	50 %	0 %	25 %	478462387
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5593	NC_020973	CTC	2	6	252439	252444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462387
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5602	NC_020973	ATA	2	6	252827	252832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_020973	AAT	2	6	252851	252856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_020973	AG	3	6	252913	252918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020973	A	8	8	252931	252938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_020973	TC	3	6	252939	252944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_020973	TC	3	6	253025	253030	0 %	50 %	0 %	50 %	478462388
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5611	NC_020973	T	7	7	253136	253142	0 %	100 %	0 %	0 %	478462388
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5623	NC_020973	TC	3	6	253736	253741	0 %	50 %	0 %	50 %	478462388
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