MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 22976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020972	ACA	2	6	69267	69272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_020972	GCA	2	6	69340	69345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468528
1504	NC_020972	CAAGC	2	10	69350	69359	40 %	0 %	20 %	40 %	478468528
1505	NC_020972	A	6	6	69386	69391	100 %	0 %	0 %	0 %	478468528
1506	NC_020972	TCT	2	6	69527	69532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468528
1507	NC_020972	CTG	2	6	69558	69563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468528
1508	NC_020972	ATG	2	6	69566	69571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468528
1509	NC_020972	AAAAG	2	10	69598	69607	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020972	A	6	6	69699	69704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020972	TA	3	6	69734	69739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020972	TTC	2	6	69774	69779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468529
1513	NC_020972	CTT	3	9	69783	69791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468529
1514	NC_020972	AT	3	6	69796	69801	50 %	50 %	0 %	0 %	478468529
1515	NC_020972	TTCG	2	8	69816	69823	0 %	50 %	25 %	25 %	478468529
1516	NC_020972	TGT	2	6	69841	69846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468529
1517	NC_020972	TGAT	2	8	69933	69940	25 %	50 %	25 %	0 %	478468529
1518	NC_020972	T	6	6	69981	69986	0 %	100 %	0 %	0 %	478468529
1519	NC_020972	TCT	2	6	70097	70102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468529
1520	NC_020972	GGAGC	2	10	70220	70229	20 %	0 %	60 %	20 %	478468529
1521	NC_020972	TGC	2	6	70303	70308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468529
1522	NC_020972	A	7	7	70340	70346	100 %	0 %	0 %	0 %	478468529
1523	NC_020972	CT	3	6	70348	70353	0 %	50 %	0 %	50 %	478468529
1524	NC_020972	AGA	2	6	70357	70362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468529
1525	NC_020972	ATT	2	6	70368	70373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468529
1526	NC_020972	GCGAT	2	10	70410	70419	20 %	20 %	40 %	20 %	478468529
1527	NC_020972	GTT	2	6	70432	70437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468529
1528	NC_020972	GCT	2	6	70454	70459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468529
1529	NC_020972	GCA	3	9	70556	70564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468529
1530	NC_020972	AAAG	2	8	70589	70596	75 %	0 %	25 %	0 %	478468529
1531	NC_020972	GCA	2	6	70603	70608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468529
1532	NC_020972	ATT	2	6	70617	70622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468529
1533	NC_020972	TAT	2	6	70725	70730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468529
1534	NC_020972	CTT	2	6	70749	70754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468529
1535	NC_020972	GA	3	6	70758	70763	50 %	0 %	50 %	0 %	478468529
1536	NC_020972	CTCTT	2	10	70764	70773	0 %	60 %	0 %	40 %	478468529
1537	NC_020972	AGAA	2	8	70776	70783	75 %	0 %	25 %	0 %	478468529
1538	NC_020972	TGA	2	6	70804	70809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468529
1539	NC_020972	TTG	2	6	70893	70898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468529
1540	NC_020972	TCT	2	6	70916	70921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468529
1541	NC_020972	GA	3	6	70957	70962	50 %	0 %	50 %	0 %	478468529
1542	NC_020972	AGCT	2	8	70998	71005	25 %	25 %	25 %	25 %	478468529
1543	NC_020972	TGA	2	6	71044	71049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468529
1544	NC_020972	GCAT	2	8	71059	71066	25 %	25 %	25 %	25 %	478468529
1545	NC_020972	AGA	2	6	71077	71082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468529
1546	NC_020972	TCAA	2	8	71203	71210	50 %	25 %	0 %	25 %	478468529
1547	NC_020972	GT	3	6	71233	71238	0 %	50 %	50 %	0 %	478468529
1548	NC_020972	CT	3	6	71314	71319	0 %	50 %	0 %	50 %	478468529
1549	NC_020972	GA	3	6	71335	71340	50 %	0 %	50 %	0 %	478468529
1550	NC_020972	AGT	2	6	71377	71382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468529
1551	NC_020972	AGGGG	2	10	71410	71419	20 %	0 %	80 %	0 %	478468529
1552	NC_020972	AAGAA	2	10	71452	71461	80 %	0 %	20 %	0 %	478468529
1553	NC_020972	AGA	2	6	71524	71529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468529
1554	NC_020972	TGA	2	6	71560	71565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468529
1555	NC_020972	TAT	2	6	71571	71576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468529
1556	NC_020972	T	6	6	71660	71665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020972	T	8	8	71681	71688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020972	CAT	2	6	71746	71751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468530
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1561	NC_020972	A	6	6	71900	71905	100 %	0 %	0 %	0 %	478468530
1562	NC_020972	ATT	2	6	71950	71955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468530
1563	NC_020972	CAA	2	6	72097	72102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468530
1564	NC_020972	TCC	2	6	72121	72126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468530
1565	NC_020972	TTCT	2	8	72143	72150	0 %	75 %	0 %	25 %	478468530
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1568	NC_020972	AGA	2	6	72198	72203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468530
1569	NC_020972	GAGC	2	8	72217	72224	25 %	0 %	50 %	25 %	478468530
1570	NC_020972	TCA	2	6	72242	72247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468530
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1572	NC_020972	CTATTT	2	12	72260	72271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478468530
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1577	NC_020972	CGT	2	6	72510	72515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_020972	T	7	7	72515	72521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020972	CTTGC	2	10	72541	72550	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1584	NC_020972	T	6	6	72758	72763	0 %	100 %	0 %	0 %	478468531
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1595	NC_020972	TGC	2	6	73099	73104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468531
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1598	NC_020972	GATT	2	8	73193	73200	25 %	50 %	25 %	0 %	478468531
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1611	NC_020972	TGT	2	6	73801	73806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468531
1612	NC_020972	GAAAA	2	10	73814	73823	80 %	0 %	20 %	0 %	478468531
1613	NC_020972	A	7	7	73820	73826	100 %	0 %	0 %	0 %	478468531
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1618	NC_020972	GA	3	6	73999	74004	50 %	0 %	50 %	0 %	478468532
1619	NC_020972	TAC	2	6	74024	74029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468532
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1621	NC_020972	TGA	2	6	74102	74107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468532
1622	NC_020972	G	6	6	74160	74165	0 %	0 %	100 %	0 %	478468532
1623	NC_020972	TAT	2	6	74172	74177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468532
1624	NC_020972	A	6	6	74208	74213	100 %	0 %	0 %	0 %	478468532
1625	NC_020972	TGGGA	2	10	74231	74240	20 %	20 %	60 %	0 %	478468532
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