MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 22976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020972	A	6	6	248912	248917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020972	GCAG	2	8	248925	248932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_020972	AG	3	6	249000	249005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020972	TAT	2	6	249023	249028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020972	ACA	2	6	249064	249069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_020972	A	6	6	249113	249118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020972	TTG	2	6	249293	249298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468688
5508	NC_020972	TCT	2	6	249315	249320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468688
5509	NC_020972	TC	3	6	249362	249367	0 %	50 %	0 %	50 %	478468688
5510	NC_020972	T	7	7	249398	249404	0 %	100 %	0 %	0 %	478468688
5511	NC_020972	CCA	2	6	249411	249416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468688
5512	NC_020972	AAC	2	6	249464	249469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468688
5513	NC_020972	AATA	2	8	249518	249525	75 %	25 %	0 %	0 %	478468688
5514	NC_020972	GCT	2	6	249528	249533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468688
5515	NC_020972	ACA	2	6	249593	249598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468688
5516	NC_020972	CCA	2	6	249625	249630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468688
5517	NC_020972	CAA	2	6	249673	249678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468688
5518	NC_020972	CCCA	2	8	249798	249805	25 %	0 %	0 %	75 %	478468689
5519	NC_020972	CTT	2	6	249927	249932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468689
5520	NC_020972	AAT	2	6	250006	250011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468689
5521	NC_020972	CTC	2	6	250017	250022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468689
5522	NC_020972	ACT	2	6	250025	250030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468689
5523	NC_020972	GAA	2	6	250043	250048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468689
5524	NC_020972	CTC	2	6	250074	250079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468689
5525	NC_020972	GCAA	2	8	250088	250095	50 %	0 %	25 %	25 %	478468689
5526	NC_020972	AAC	2	6	250105	250110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468689
5527	NC_020972	GTT	2	6	250150	250155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468689
5528	NC_020972	AAC	2	6	250189	250194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_020972	A	6	6	250203	250208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_020972	TAA	2	6	250254	250259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_020972	TTC	2	6	250272	250277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468690
5532	NC_020972	GCT	2	6	250304	250309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468690
5533	NC_020972	T	7	7	250313	250319	0 %	100 %	0 %	0 %	478468690
5534	NC_020972	AGCA	2	8	250350	250357	50 %	0 %	25 %	25 %	478468690
5535	NC_020972	CTT	2	6	250367	250372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468690
5536	NC_020972	TCT	3	9	250378	250386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468690
5537	NC_020972	GATAA	2	10	250406	250415	60 %	20 %	20 %	0 %	478468690
5538	NC_020972	TCG	2	6	250472	250477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468690
5539	NC_020972	CATA	2	8	250493	250500	50 %	25 %	0 %	25 %	478468690
5540	NC_020972	TCC	2	6	250512	250517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468690
5541	NC_020972	TAA	2	6	250545	250550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468690
5542	NC_020972	AG	4	8	250570	250577	50 %	0 %	50 %	0 %	478468690
5543	NC_020972	A	6	6	250589	250594	100 %	0 %	0 %	0 %	478468690
5544	NC_020972	AGA	2	6	250600	250605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468690
5545	NC_020972	CAC	2	6	250607	250612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468690
5546	NC_020972	CAA	2	6	250653	250658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468690
5547	NC_020972	GTA	2	6	250675	250680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468690
5548	NC_020972	ACA	2	6	250734	250739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468690
5549	NC_020972	A	6	6	250774	250779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020972	TA	3	6	250821	250826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020972	CCAA	2	8	250856	250863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_020972	A	7	7	250880	250886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020972	TAT	2	6	250899	250904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468691
5554	NC_020972	TTCA	2	8	250931	250938	25 %	50 %	0 %	25 %	478468691
5555	NC_020972	AGA	3	9	250967	250975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468691
5556	NC_020972	TGTT	2	8	251005	251012	0 %	75 %	25 %	0 %	478468691
5557	NC_020972	CGA	2	6	251126	251131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468691
5558	NC_020972	GCAAA	2	10	251138	251147	60 %	0 %	20 %	20 %	478468691
5559	NC_020972	AATA	2	8	251224	251231	75 %	25 %	0 %	0 %	478468691
5560	NC_020972	A	6	6	251290	251295	100 %	0 %	0 %	0 %	478468691
5561	NC_020972	A	7	7	251321	251327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_020972	ATA	2	6	251335	251340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_020972	CCT	2	6	251390	251395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_020972	AAAC	2	8	251464	251471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_020972	AAG	2	6	251588	251593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468692
5566	NC_020972	AGC	2	6	251622	251627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468692
5567	NC_020972	CAAT	2	8	251728	251735	50 %	25 %	0 %	25 %	478468692
5568	NC_020972	TTA	2	6	251800	251805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468692
5569	NC_020972	CTTCT	2	10	251832	251841	0 %	60 %	0 %	40 %	478468692
5570	NC_020972	T	6	6	251875	251880	0 %	100 %	0 %	0 %	478468692
5571	NC_020972	CA	3	6	251934	251939	50 %	0 %	0 %	50 %	478468692
5572	NC_020972	AAT	2	6	251949	251954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468692
5573	NC_020972	ACA	2	6	252025	252030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468692
5574	NC_020972	TTG	2	6	252089	252094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468692
5575	NC_020972	AGA	2	6	252144	252149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468692
5576	NC_020972	TAG	2	6	252164	252169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468692
5577	NC_020972	TTTTTA	2	12	252186	252197	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020972	GAG	2	6	252313	252318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020972	ATT	2	6	252325	252330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468693
5580	NC_020972	T	6	6	252329	252334	0 %	100 %	0 %	0 %	478468693
5581	NC_020972	ACG	2	6	252335	252340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468693
5582	NC_020972	CCTGCA	2	12	252346	252357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478468693
5583	NC_020972	CTG	2	6	252403	252408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468693
5584	NC_020972	TTG	2	6	252434	252439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468693
5585	NC_020972	TCTG	2	8	252459	252466	0 %	50 %	25 %	25 %	478468693
5586	NC_020972	TCC	2	6	252489	252494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468693
5587	NC_020972	TTG	2	6	252508	252513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468693
5588	NC_020972	T	6	6	252541	252546	0 %	100 %	0 %	0 %	478468693
5589	NC_020972	TACT	2	8	252564	252571	25 %	50 %	0 %	25 %	478468693
5590	NC_020972	CGA	2	6	252579	252584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468693
5591	NC_020972	TTC	2	6	252626	252631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468693
5592	NC_020972	CTC	2	6	252638	252643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468693
5593	NC_020972	ACG	2	6	252686	252691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468693
5594	NC_020972	AACC	2	8	252730	252737	50 %	0 %	0 %	50 %	478468693
5595	NC_020972	CAG	2	6	252754	252759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468693
5596	NC_020972	AAG	2	6	252763	252768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468693
5597	NC_020972	CTG	2	6	252787	252792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468693
5598	NC_020972	TAA	2	6	252829	252834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468693
5599	NC_020972	GCT	2	6	252915	252920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468693
5600	NC_020972	ATTT	2	8	252972	252979	25 %	75 %	0 %	0 %	478468693
5601	NC_020972	ATA	2	6	253026	253031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_020972	AAT	2	6	253050	253055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_020972	AG	3	6	253112	253117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_020972	A	8	8	253130	253137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020972	TC	3	6	253138	253143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_020972	TC	3	6	253224	253229	0 %	50 %	0 %	50 %	478468694
5607	NC_020972	A	6	6	253233	253238	100 %	0 %	0 %	0 %	478468694
5608	NC_020972	ATG	2	6	253244	253249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468694
5609	NC_020972	ATCT	2	8	253293	253300	25 %	50 %	0 %	25 %	478468694
5610	NC_020972	T	7	7	253335	253341	0 %	100 %	0 %	0 %	478468694
5611	NC_020972	GCT	2	6	253345	253350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468694
5612	NC_020972	CTT	2	6	253355	253360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468694
5613	NC_020972	T	6	6	253376	253381	0 %	100 %	0 %	0 %	478468694
5614	NC_020972	CT	4	8	253444	253451	0 %	50 %	0 %	50 %	478468694
5615	NC_020972	TTA	2	6	253509	253514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468694
5616	NC_020972	GCC	2	6	253643	253648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478468694
5617	NC_020972	TTCG	2	8	253706	253713	0 %	50 %	25 %	25 %	478468694
5618	NC_020972	CTT	2	6	253742	253747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468694
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5620	NC_020972	TTC	2	6	253905	253910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468694
5621	NC_020972	CTT	2	6	253913	253918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468694
5622	NC_020972	TC	3	6	253935	253940	0 %	50 %	0 %	50 %	478468694
5623	NC_020972	TCT	2	6	253997	254002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468694
5624	NC_020972	CAA	2	6	254058	254063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468694
5625	NC_020972	GTTTT	2	10	254070	254079	0 %	80 %	20 %	0 %	478468694
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5627	NC_020972	CATT	2	8	254118	254125	25 %	50 %	0 %	25 %	478468694
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