MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 2873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020971	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478461250
2	NC_020971	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	478461250
3	NC_020971	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	478461250
4	NC_020971	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	478461250
5	NC_020971	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	478461250
6	NC_020971	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020971	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	478461251
8	NC_020971	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	478461252
9	NC_020971	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	478461252
10	NC_020971	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	478461253
11	NC_020971	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	478461253
12	NC_020971	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	478461253
13	NC_020971	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	478461254
14	NC_020971	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	478461254
15	NC_020971	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	478461254
16	NC_020971	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	478461254
17	NC_020971	TGGA	2	8	5921	5928	25 %	25 %	50 %	0 %	478461255
18	NC_020971	CTTT	2	8	6298	6305	0 %	75 %	0 %	25 %	478461255
19	NC_020971	GGGA	2	8	6813	6820	25 %	0 %	75 %	0 %	478461255
20	NC_020971	GGAG	2	8	6904	6911	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020971	GGTG	2	8	7116	7123	0 %	25 %	75 %	0 %	478461256
22	NC_020971	AAAT	2	8	7182	7189	75 %	25 %	0 %	0 %	478461256
23	NC_020971	TATG	2	8	7553	7560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020971	ATTT	2	8	7694	7701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020971	ATTT	2	8	7785	7792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020971	AAGC	2	8	8420	8427	50 %	0 %	25 %	25 %	478461257
27	NC_020971	ATTG	2	8	8818	8825	25 %	50 %	25 %	0 %	478461258
28	NC_020971	AGCG	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	478461258
29	NC_020971	AAAG	2	8	9306	9313	75 %	0 %	25 %	0 %	478461258
30	NC_020971	CTTT	2	8	9646	9653	0 %	75 %	0 %	25 %	478461258
31	NC_020971	TATT	2	8	9909	9916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020971	TTCG	2	8	10020	10027	0 %	50 %	25 %	25 %	478461259
33	NC_020971	AATT	2	8	10125	10132	50 %	50 %	0 %	0 %	478461259
34	NC_020971	ATGG	2	8	10184	10191	25 %	25 %	50 %	0 %	478461259
35	NC_020971	CTTT	2	8	10809	10816	0 %	75 %	0 %	25 %	478461260
36	NC_020971	GCAA	2	8	11026	11033	50 %	0 %	25 %	25 %	478461260
37	NC_020971	AGCC	2	8	11256	11263	25 %	0 %	25 %	50 %	478461260
38	NC_020971	GAAA	2	8	11399	11406	75 %	0 %	25 %	0 %	478461260
39	NC_020971	AGAA	2	8	11803	11810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020971	AATG	2	8	12142	12149	50 %	25 %	25 %	0 %	478461261
41	NC_020971	GTTT	2	8	13174	13181	0 %	75 %	25 %	0 %	478461262
42	NC_020971	ATGC	2	8	13604	13611	25 %	25 %	25 %	25 %	478461262
43	NC_020971	AAGG	2	8	14039	14046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020971	TTGT	2	8	14640	14647	0 %	75 %	25 %	0 %	478461263
45	NC_020971	TTCT	2	8	14811	14818	0 %	75 %	0 %	25 %	478461263
46	NC_020971	ATTT	2	8	15017	15024	25 %	75 %	0 %	0 %	478461263
47	NC_020971	TTTC	2	8	15679	15686	0 %	75 %	0 %	25 %	478461264
48	NC_020971	AAAT	2	8	16161	16168	75 %	25 %	0 %	0 %	478461264
49	NC_020971	CAAA	2	8	16673	16680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020971	GTAA	2	8	17003	17010	50 %	25 %	25 %	0 %	478461265
51	NC_020971	CTAA	2	8	17196	17203	50 %	25 %	0 %	25 %	478461265
52	NC_020971	AGAA	2	8	17459	17466	75 %	0 %	25 %	0 %	478461265
53	NC_020971	ATTT	2	8	17605	17612	25 %	75 %	0 %	0 %	478461265
54	NC_020971	TGCG	2	8	19127	19134	0 %	25 %	50 %	25 %	478461267
55	NC_020971	GAAG	2	8	20111	20118	50 %	0 %	50 %	0 %	478461267
56	NC_020971	TTTG	2	8	20137	20144	0 %	75 %	25 %	0 %	478461267
57	NC_020971	TGTA	2	8	20829	20836	25 %	50 %	25 %	0 %	478461268
58	NC_020971	GCCA	2	8	21621	21628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020971	CGCT	2	8	21869	21876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020971	TTAA	2	8	21890	21897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020971	GTTA	2	8	21927	21934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020971	GATC	2	8	21982	21989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020971	TGGG	2	8	22247	22254	0 %	25 %	75 %	0 %	478461269
64	NC_020971	CATT	2	8	23304	23311	25 %	50 %	0 %	25 %	478461269
65	NC_020971	GCTT	2	8	23647	23654	0 %	50 %	25 %	25 %	478461269
66	NC_020971	GGTT	2	8	23695	23702	0 %	50 %	50 %	0 %	478461269
67	NC_020971	TTCT	2	8	24065	24072	0 %	75 %	0 %	25 %	478461269
68	NC_020971	TAAC	2	8	24167	24174	50 %	25 %	0 %	25 %	478461269
69	NC_020971	CATT	2	8	24290	24297	25 %	50 %	0 %	25 %	478461269
70	NC_020971	GGTA	2	8	24660	24667	25 %	25 %	50 %	0 %	478461269
71	NC_020971	TTGA	2	8	25655	25662	25 %	50 %	25 %	0 %	478461270
72	NC_020971	TTCG	2	8	25800	25807	0 %	50 %	25 %	25 %	478461270
73	NC_020971	TAGG	2	8	25879	25886	25 %	25 %	50 %	0 %	478461270
74	NC_020971	TTCC	2	8	26003	26010	0 %	50 %	0 %	50 %	478461270
75	NC_020971	TAGG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	50 %	0 %	478461270
76	NC_020971	TTTC	2	8	26552	26559	0 %	75 %	0 %	25 %	478461270
77	NC_020971	GCTT	2	8	26889	26896	0 %	50 %	25 %	25 %	478461270
78	NC_020971	GGAA	2	8	27472	27479	50 %	0 %	50 %	0 %	478461271
79	NC_020971	TTAA	2	8	27545	27552	50 %	50 %	0 %	0 %	478461271
80	NC_020971	AAAG	2	8	27595	27602	75 %	0 %	25 %	0 %	478461271
81	NC_020971	GGGC	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	478461271
82	NC_020971	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	478461272
83	NC_020971	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	478461272
84	NC_020971	ATTG	2	8	28539	28546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020971	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	478461274
86	NC_020971	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	478461274
87	NC_020971	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	478461274
88	NC_020971	TGGC	2	8	30365	30372	0 %	25 %	50 %	25 %	478461274
89	NC_020971	AAAG	2	8	30925	30932	75 %	0 %	25 %	0 %	478461275
90	NC_020971	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	478461275
91	NC_020971	GATG	2	8	31138	31145	25 %	25 %	50 %	0 %	478461275
92	NC_020971	GATA	2	8	32247	32254	50 %	25 %	25 %	0 %	478461277
93	NC_020971	TGAT	2	8	34742	34749	25 %	50 %	25 %	0 %	478461280
94	NC_020971	AAGA	3	12	34870	34881	75 %	0 %	25 %	0 %	478461280
95	NC_020971	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	478461281
96	NC_020971	GTTC	2	8	35123	35130	0 %	50 %	25 %	25 %	478461281
97	NC_020971	GGCA	2	8	35502	35509	25 %	0 %	50 %	25 %	478461282
98	NC_020971	TCGA	2	8	35759	35766	25 %	25 %	25 %	25 %	478461282
99	NC_020971	TGCT	2	8	35912	35919	0 %	50 %	25 %	25 %	478461282
100	NC_020971	TTGG	2	8	36144	36151	0 %	50 %	50 %	0 %	478461282
101	NC_020971	AGAT	2	8	36864	36871	50 %	25 %	25 %	0 %	478461282
102	NC_020971	CTTT	2	8	37237	37244	0 %	75 %	0 %	25 %	478461283
103	NC_020971	ATGA	2	8	37727	37734	50 %	25 %	25 %	0 %	478461283
104	NC_020971	TAGG	2	8	37886	37893	25 %	25 %	50 %	0 %	478461283
105	NC_020971	CAAT	2	8	38070	38077	50 %	25 %	0 %	25 %	478461283
106	NC_020971	AATG	2	8	38857	38864	50 %	25 %	25 %	0 %	478461283
107	NC_020971	AGAA	2	8	39694	39701	75 %	0 %	25 %	0 %	478461284
108	NC_020971	AAGA	2	8	39746	39753	75 %	0 %	25 %	0 %	478461284
109	NC_020971	ATCC	2	8	39754	39761	25 %	25 %	0 %	50 %	478461284
110	NC_020971	TAAT	2	8	39965	39972	50 %	50 %	0 %	0 %	478461284
111	NC_020971	GTGC	2	8	42054	42061	0 %	25 %	50 %	25 %	478461286
112	NC_020971	AGAA	2	8	42473	42480	75 %	0 %	25 %	0 %	478461286
113	NC_020971	GGAT	2	8	42625	42632	25 %	25 %	50 %	0 %	478461286
114	NC_020971	AAAC	2	8	43833	43840	75 %	0 %	0 %	25 %	478461289
115	NC_020971	CAAT	2	8	44037	44044	50 %	25 %	0 %	25 %	478461289
116	NC_020971	TGTT	2	8	44417	44424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020971	AATA	2	8	44656	44663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020971	ATTT	2	8	44794	44801	25 %	75 %	0 %	0 %	478461290
119	NC_020971	GCTC	2	8	45102	45109	0 %	25 %	25 %	50 %	478461290
120	NC_020971	TTCT	2	8	45244	45251	0 %	75 %	0 %	25 %	478461290
121	NC_020971	TTGA	2	8	45844	45851	25 %	50 %	25 %	0 %	478461291
122	NC_020971	TGTT	2	8	46016	46023	0 %	75 %	25 %	0 %	478461291
123	NC_020971	CTAT	2	8	46046	46053	25 %	50 %	0 %	25 %	478461291
124	NC_020971	TGTT	2	8	46075	46082	0 %	75 %	25 %	0 %	478461291
125	NC_020971	CTAT	2	8	46371	46378	25 %	50 %	0 %	25 %	478461291
126	NC_020971	AAGA	2	8	46867	46874	75 %	0 %	25 %	0 %	478461292
127	NC_020971	AAGA	2	8	46924	46931	75 %	0 %	25 %	0 %	478461292
128	NC_020971	AAAG	2	8	46964	46971	75 %	0 %	25 %	0 %	478461292
129	NC_020971	AAGA	2	8	47079	47086	75 %	0 %	25 %	0 %	478461292
130	NC_020971	ACTT	2	8	47340	47347	25 %	50 %	0 %	25 %	478461292
131	NC_020971	ATGG	2	8	47966	47973	25 %	25 %	50 %	0 %	478461292
132	NC_020971	AGGA	2	8	47997	48004	50 %	0 %	50 %	0 %	478461292
133	NC_020971	GAAC	2	8	48544	48551	50 %	0 %	25 %	25 %	478461292
134	NC_020971	AAGT	2	8	48579	48586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020971	AACA	2	8	48788	48795	75 %	0 %	0 %	25 %	478461293
136	NC_020971	CTTT	2	8	48984	48991	0 %	75 %	0 %	25 %	478461293
137	NC_020971	CTTT	2	8	49875	49882	0 %	75 %	0 %	25 %	478461294
138	NC_020971	GTAG	2	8	49893	49900	25 %	25 %	50 %	0 %	478461294
139	NC_020971	GAAG	2	8	51321	51328	50 %	0 %	50 %	0 %	478461295
140	NC_020971	TTCA	2	8	51743	51750	25 %	50 %	0 %	25 %	478461295
141	NC_020971	TCTA	2	8	51960	51967	25 %	50 %	0 %	25 %	478461295
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143	NC_020971	GGAA	2	8	53126	53133	50 %	0 %	50 %	0 %	478461297
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