MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020971	GGAT	2	8	136567	136574	25 %	25 %	50 %	0 %	478461367
3002	NC_020971	CTG	2	6	136688	136693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461368
3003	NC_020971	CAAT	2	8	136716	136723	50 %	25 %	0 %	25 %	478461368
3004	NC_020971	AAGC	2	8	136770	136777	50 %	0 %	25 %	25 %	478461368
3005	NC_020971	TTTG	2	8	136796	136803	0 %	75 %	25 %	0 %	478461368
3006	NC_020971	GCG	2	6	136839	136844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478461368
3007	NC_020971	CTG	3	9	136861	136869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461368
3008	NC_020971	TTC	2	6	136870	136875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461368
3009	NC_020971	CTG	2	6	136881	136886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461368
3010	NC_020971	AAC	2	6	136892	136897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461368
3011	NC_020971	TTTG	2	8	136911	136918	0 %	75 %	25 %	0 %	478461368
3012	NC_020971	CAG	2	6	136948	136953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461368
3013	NC_020971	GAA	2	6	136983	136988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461368
3014	NC_020971	GCT	2	6	136998	137003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461368
3015	NC_020971	CAG	2	6	137016	137021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461368
3016	NC_020971	AGG	2	6	137027	137032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461368
3017	NC_020971	GAG	2	6	137043	137048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461368
3018	NC_020971	CAC	2	6	137056	137061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478461368
3019	NC_020971	GAT	2	6	137139	137144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461368
3020	NC_020971	ATAA	2	8	137145	137152	75 %	25 %	0 %	0 %	478461368
3021	NC_020971	ACA	2	6	137155	137160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461368
3022	NC_020971	AGG	2	6	137216	137221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_020971	CCT	2	6	137226	137231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_020971	T	11	11	137233	137243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_020971	TTGCA	2	10	137331	137340	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_020971	GAG	2	6	137395	137400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461369
3027	NC_020971	TC	3	6	137405	137410	0 %	50 %	0 %	50 %	478461369
3028	NC_020971	CT	3	6	137434	137439	0 %	50 %	0 %	50 %	478461369
3029	NC_020971	TTC	2	6	137532	137537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461369
3030	NC_020971	CTT	2	6	137582	137587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461369
3031	NC_020971	CT	3	6	137616	137621	0 %	50 %	0 %	50 %	478461369
3032	NC_020971	A	6	6	137666	137671	100 %	0 %	0 %	0 %	478461369
3033	NC_020971	TCT	2	6	137683	137688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461369
3034	NC_020971	CAG	2	6	137777	137782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461369
3035	NC_020971	AG	3	6	137781	137786	50 %	0 %	50 %	0 %	478461369
3036	NC_020971	GAA	2	6	137822	137827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461369
3037	NC_020971	TTCT	2	8	137829	137836	0 %	75 %	0 %	25 %	478461369
3038	NC_020971	AATT	2	8	137855	137862	50 %	50 %	0 %	0 %	478461369
3039	NC_020971	AAG	2	6	137967	137972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461369
3040	NC_020971	CAA	2	6	138005	138010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461369
3041	NC_020971	GCT	2	6	138067	138072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461369
3042	NC_020971	AAG	2	6	138095	138100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461369
3043	NC_020971	TTG	2	6	138285	138290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461370
3044	NC_020971	ATGT	2	8	138435	138442	25 %	50 %	25 %	0 %	478461370
3045	NC_020971	AGG	2	6	138452	138457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461370
3046	NC_020971	AAT	2	6	138485	138490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461370
3047	NC_020971	CTT	2	6	138508	138513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_020971	GA	3	6	138582	138587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_020971	A	6	6	138598	138603	100 %	0 %	0 %	0 %	478461371
3050	NC_020971	TAT	2	6	138627	138632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461371
3051	NC_020971	AGA	2	6	138675	138680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461371
3052	NC_020971	ATGG	2	8	138712	138719	25 %	25 %	50 %	0 %	478461371
3053	NC_020971	GTT	2	6	138754	138759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461371
3054	NC_020971	TC	3	6	138947	138952	0 %	50 %	0 %	50 %	478461371
3055	NC_020971	AGAA	2	8	139062	139069	75 %	0 %	25 %	0 %	478461371
3056	NC_020971	GAAG	2	8	139108	139115	50 %	0 %	50 %	0 %	478461371
3057	NC_020971	TTGA	2	8	139120	139127	25 %	50 %	25 %	0 %	478461371
3058	NC_020971	GGT	2	6	139135	139140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478461371
3059	NC_020971	CCT	2	6	139199	139204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461371
3060	NC_020971	T	7	7	139206	139212	0 %	100 %	0 %	0 %	478461371
3061	NC_020971	GAAA	2	8	139233	139240	75 %	0 %	25 %	0 %	478461371
3062	NC_020971	GAA	2	6	139261	139266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461371
3063	NC_020971	AGT	2	6	139330	139335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461372
3064	NC_020971	TTA	2	6	139374	139379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461372
3065	NC_020971	GA	3	6	139418	139423	50 %	0 %	50 %	0 %	478461372
3066	NC_020971	AAG	2	6	139449	139454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461372
3067	NC_020971	T	6	6	139626	139631	0 %	100 %	0 %	0 %	478461372
3068	NC_020971	AGG	2	6	139705	139710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461372
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3070	NC_020971	TTA	2	6	139779	139784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461372
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3072	NC_020971	GAGTTA	2	12	139922	139933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461373
3073	NC_020971	AAGA	2	8	140004	140011	75 %	0 %	25 %	0 %	478461373
3074	NC_020971	AG	3	6	140053	140058	50 %	0 %	50 %	0 %	478461373
3075	NC_020971	GAA	2	6	140065	140070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461373
3076	NC_020971	TTA	2	6	140160	140165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461373
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3079	NC_020971	TCCAG	2	10	140287	140296	20 %	20 %	20 %	40 %	478461373
3080	NC_020971	GAA	2	6	140338	140343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461374
3081	NC_020971	ATTG	2	8	140347	140354	25 %	50 %	25 %	0 %	478461374
3082	NC_020971	ATT	2	6	140381	140386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461374
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3086	NC_020971	CCTA	2	8	140508	140515	25 %	25 %	0 %	50 %	478461374
3087	NC_020971	GCT	2	6	140534	140539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461374
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3089	NC_020971	TAA	2	6	140908	140913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461374
3090	NC_020971	GTACA	2	10	141018	141027	40 %	20 %	20 %	20 %	478461374
3091	NC_020971	AGA	2	6	141049	141054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461374
3092	NC_020971	GAA	2	6	141233	141238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461374
3093	NC_020971	TAA	2	6	141367	141372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461374
3094	NC_020971	TAGAT	2	10	141391	141400	40 %	40 %	20 %	0 %	478461374
3095	NC_020971	TAT	2	6	141401	141406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461374
3096	NC_020971	CTCC	2	8	141407	141414	0 %	25 %	0 %	75 %	478461374
3097	NC_020971	CTG	2	6	141423	141428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461374
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3099	NC_020971	TAT	2	6	141473	141478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461374
3100	NC_020971	TGG	2	6	141568	141573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478461374
3101	NC_020971	TCA	2	6	141595	141600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461374
3102	NC_020971	TCT	2	6	141625	141630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461374
3103	NC_020971	ATTA	2	8	141644	141651	50 %	50 %	0 %	0 %	478461374
3104	NC_020971	T	8	8	141713	141720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_020971	T	6	6	141758	141763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_020971	AAG	2	6	141767	141772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_020971	AAAAG	2	10	141803	141812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_020971	T	6	6	141827	141832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_020971	GCT	2	6	141863	141868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_020971	A	6	6	141879	141884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_020971	ATC	2	6	141887	141892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_020971	A	6	6	141936	141941	100 %	0 %	0 %	0 %	478461375
3113	NC_020971	CTC	2	6	142086	142091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461375
3114	NC_020971	AAAAC	2	10	142283	142292	80 %	0 %	0 %	20 %	478461375
3115	NC_020971	AGA	2	6	142437	142442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461376
3116	NC_020971	GGA	2	6	142611	142616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461376
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3118	NC_020971	CTT	2	6	142712	142717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461376
3119	NC_020971	AAGA	2	8	142734	142741	75 %	0 %	25 %	0 %	478461376
3120	NC_020971	A	6	6	142746	142751	100 %	0 %	0 %	0 %	478461376
3121	NC_020971	AT	3	6	142814	142819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_020971	CTT	2	6	142841	142846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_020971	AAG	2	6	142851	142856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461377
3124	NC_020971	AAAG	2	8	142931	142938	75 %	0 %	25 %	0 %	478461377
3125	NC_020971	T	6	6	142975	142980	0 %	100 %	0 %	0 %	478461377
3126	NC_020971	GCA	2	6	142983	142988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461377
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3128	NC_020971	TCA	2	6	143014	143019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461377
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3135	NC_020971	AG	3	6	143283	143288	50 %	0 %	50 %	0 %	478461377
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3142	NC_020971	A	6	6	143457	143462	100 %	0 %	0 %	0 %	478461377
3143	NC_020971	CTT	2	6	143464	143469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461377
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3169	NC_020971	T	7	7	144665	144671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_020971	CGTA	2	8	148712	148719	25 %	25 %	25 %	25 %	478461381
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