MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020971	CT	3	6	70068	70073	0 %	50 %	0 %	50 %	478461310
1502	NC_020971	AGA	2	6	70077	70082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461310
1503	NC_020971	GCGAT	2	10	70130	70139	20 %	20 %	40 %	20 %	478461310
1504	NC_020971	GTT	2	6	70152	70157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461310
1505	NC_020971	GCT	2	6	70174	70179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461310
1506	NC_020971	GCA	3	9	70276	70284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461310
1507	NC_020971	AAAG	2	8	70309	70316	75 %	0 %	25 %	0 %	478461310
1508	NC_020971	GCA	2	6	70323	70328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461310
1509	NC_020971	ATT	2	6	70337	70342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461310
1510	NC_020971	TAT	2	6	70445	70450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461310
1511	NC_020971	CTT	2	6	70469	70474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461310
1512	NC_020971	GA	3	6	70478	70483	50 %	0 %	50 %	0 %	478461310
1513	NC_020971	CTCTT	2	10	70484	70493	0 %	60 %	0 %	40 %	478461310
1514	NC_020971	AGAA	2	8	70496	70503	75 %	0 %	25 %	0 %	478461310
1515	NC_020971	TGA	2	6	70524	70529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461310
1516	NC_020971	TTG	2	6	70613	70618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461310
1517	NC_020971	TCT	2	6	70636	70641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461310
1518	NC_020971	GA	3	6	70677	70682	50 %	0 %	50 %	0 %	478461310
1519	NC_020971	AGCT	2	8	70718	70725	25 %	25 %	25 %	25 %	478461310
1520	NC_020971	TGA	2	6	70764	70769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461310
1521	NC_020971	GCAT	2	8	70779	70786	25 %	25 %	25 %	25 %	478461310
1522	NC_020971	AGA	2	6	70797	70802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461310
1523	NC_020971	TCAA	2	8	70923	70930	50 %	25 %	0 %	25 %	478461310
1524	NC_020971	GT	3	6	70953	70958	0 %	50 %	50 %	0 %	478461310
1525	NC_020971	CT	3	6	71034	71039	0 %	50 %	0 %	50 %	478461310
1526	NC_020971	GA	3	6	71055	71060	50 %	0 %	50 %	0 %	478461310
1527	NC_020971	AGT	2	6	71097	71102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461310
1528	NC_020971	AGGGG	2	10	71130	71139	20 %	0 %	80 %	0 %	478461310
1529	NC_020971	AAGAA	2	10	71172	71181	80 %	0 %	20 %	0 %	478461310
1530	NC_020971	AGA	2	6	71244	71249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461310
1531	NC_020971	TGA	2	6	71280	71285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461310
1532	NC_020971	TAT	2	6	71291	71296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461310
1533	NC_020971	T	6	6	71380	71385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020971	T	8	8	71401	71408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020971	CAT	2	6	71466	71471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461311
1536	NC_020971	CCTT	2	8	71495	71502	0 %	50 %	0 %	50 %	478461311
1537	NC_020971	GCTT	2	8	71525	71532	0 %	50 %	25 %	25 %	478461311
1538	NC_020971	A	6	6	71620	71625	100 %	0 %	0 %	0 %	478461311
1539	NC_020971	ATT	2	6	71670	71675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461311
1540	NC_020971	CAA	2	6	71817	71822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461311
1541	NC_020971	TCC	2	6	71841	71846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461311
1542	NC_020971	TTCT	2	8	71863	71870	0 %	75 %	0 %	25 %	478461311
1543	NC_020971	ATG	2	6	71875	71880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461311
1544	NC_020971	GCTT	2	8	71909	71916	0 %	50 %	25 %	25 %	478461311
1545	NC_020971	AGA	2	6	71918	71923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461311
1546	NC_020971	GAGC	2	8	71937	71944	25 %	0 %	50 %	25 %	478461311
1547	NC_020971	TCA	2	6	71962	71967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461311
1548	NC_020971	A	7	7	71969	71975	100 %	0 %	0 %	0 %	478461311
1549	NC_020971	CTATTT	2	12	71980	71991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478461311
1550	NC_020971	TGA	2	6	72014	72019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461311
1551	NC_020971	ATG	2	6	72052	72057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461311
1552	NC_020971	AGA	2	6	72182	72187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020971	CGT	2	6	72230	72235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_020971	T	7	7	72235	72241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020971	CTTGC	2	10	72261	72270	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1556	NC_020971	GATA	2	8	72285	72292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020971	TTC	2	6	72376	72381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461312
1558	NC_020971	CTT	2	6	72444	72449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461312
1559	NC_020971	ATTGG	2	10	72462	72471	20 %	40 %	40 %	0 %	478461312
1560	NC_020971	T	6	6	72478	72483	0 %	100 %	0 %	0 %	478461312
1561	NC_020971	AGC	2	6	72493	72498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461312
1562	NC_020971	TTG	2	6	72522	72527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461312
1563	NC_020971	ATA	2	6	72606	72611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461312
1564	NC_020971	GCT	2	6	72626	72631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461312
1565	NC_020971	GCTA	2	8	72635	72642	25 %	25 %	25 %	25 %	478461312
1566	NC_020971	AAT	2	6	72665	72670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461312
1567	NC_020971	TGG	2	6	72696	72701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478461312
1568	NC_020971	T	6	6	72703	72708	0 %	100 %	0 %	0 %	478461312
1569	NC_020971	AGC	2	6	72765	72770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461312
1570	NC_020971	TTAT	2	8	72811	72818	25 %	75 %	0 %	0 %	478461312
1571	NC_020971	TGC	2	6	72819	72824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461312
1572	NC_020971	TGT	2	6	72862	72867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461312
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1574	NC_020971	GATT	2	8	72913	72920	25 %	50 %	25 %	0 %	478461312
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1577	NC_020971	CTC	2	6	73041	73046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461312
1578	NC_020971	ACTCTT	2	12	73109	73120	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478461312
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1580	NC_020971	TGA	2	6	73147	73152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461312
1581	NC_020971	GAA	2	6	73180	73185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461312
1582	NC_020971	T	6	6	73262	73267	0 %	100 %	0 %	0 %	478461312
1583	NC_020971	TAG	2	6	73302	73307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461312
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1585	NC_020971	AGA	2	6	73418	73423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461312
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1587	NC_020971	TGT	2	6	73521	73526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461312
1588	NC_020971	GAAAA	2	10	73534	73543	80 %	0 %	20 %	0 %	478461312
1589	NC_020971	A	7	7	73540	73546	100 %	0 %	0 %	0 %	478461312
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1592	NC_020971	TTTCTG	2	12	73659	73670	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478461313
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1594	NC_020971	GA	3	6	73719	73724	50 %	0 %	50 %	0 %	478461313
1595	NC_020971	TAC	2	6	73744	73749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461313
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1597	NC_020971	TGA	2	6	73822	73827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461313
1598	NC_020971	G	6	6	73880	73885	0 %	0 %	100 %	0 %	478461313
1599	NC_020971	TAT	2	6	73892	73897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461313
1600	NC_020971	A	6	6	73928	73933	100 %	0 %	0 %	0 %	478461313
1601	NC_020971	TGGGA	2	10	73951	73960	20 %	20 %	60 %	0 %	478461313
1602	NC_020971	GCT	2	6	74060	74065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461313
1603	NC_020971	TGGA	2	8	74070	74077	25 %	25 %	50 %	0 %	478461313
1604	NC_020971	AGG	2	6	74104	74109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461313
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1606	NC_020971	T	6	6	74234	74239	0 %	100 %	0 %	0 %	478461313
1607	NC_020971	AGC	3	9	74278	74286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461313
1608	NC_020971	AGGC	2	8	74394	74401	25 %	0 %	50 %	25 %	478461313
1609	NC_020971	ATT	2	6	74417	74422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461313
1610	NC_020971	AAG	2	6	74457	74462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461313
1611	NC_020971	AAG	2	6	74520	74525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461313
1612	NC_020971	TGC	2	6	74598	74603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461313
1613	NC_020971	TC	3	6	74613	74618	0 %	50 %	0 %	50 %	478461313
1614	NC_020971	TCA	2	6	74707	74712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461313
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1617	NC_020971	ATG	2	6	74868	74873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461313
1618	NC_020971	AAG	2	6	75023	75028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020971	ACT	2	6	75038	75043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_020971	T	6	6	75049	75054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020971	AGT	2	6	75074	75079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020971	CAA	2	6	75100	75105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461314
1623	NC_020971	T	6	6	75158	75163	0 %	100 %	0 %	0 %	478461314
1624	NC_020971	CCA	2	6	75201	75206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478461314
1625	NC_020971	TC	3	6	75247	75252	0 %	50 %	0 %	50 %	478461314
1626	NC_020971	AAT	2	6	75257	75262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461314
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