MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa1 complete genome

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020970	GAAGGA	2	12	1360	1371	50 %	0 %	50 %	0 %	478460355
2	NC_020970	TATGGA	2	12	1413	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460355
3	NC_020970	AAAGCT	2	12	5541	5552	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460359
4	NC_020970	CAAAAA	2	12	6852	6863	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020970	TAGCAA	2	12	11428	11439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460365
6	NC_020970	AAAGCT	2	12	11559	11570	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460365
7	NC_020970	TAGTGA	2	12	12705	12716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460366
8	NC_020970	GTTCCT	2	12	19989	20000	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478460372
9	NC_020970	CTTTTT	2	12	22143	22154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478460374
10	NC_020970	GTGAGG	2	12	26073	26084	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478460375
11	NC_020970	GGATTT	2	12	36550	36561	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460387
12	NC_020970	AATTAG	2	12	37970	37981	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478460388
13	NC_020970	TTCCTG	2	12	38269	38280	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478460388
14	NC_020970	TTTTGA	2	12	45577	45588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478460394
15	NC_020970	TGAACG	2	12	52818	52829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460401
16	NC_020970	GTGATT	2	12	52837	52848	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460401
17	NC_020970	GATCTG	2	12	55486	55497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460403
18	NC_020970	GTGTAA	2	12	55534	55545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460403
19	NC_020970	GGTTCA	2	12	55623	55634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460403
20	NC_020970	GAAAAG	2	12	56882	56893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460404
21	NC_020970	AGTTGT	2	12	58233	58244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460405
22	NC_020970	TTGTTC	2	12	59153	59164	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478460405
23	NC_020970	TGAAAA	2	12	59623	59634	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478460406
24	NC_020970	TCCTAA	2	12	59962	59973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460406
25	NC_020970	AAAAAT	2	12	61457	61468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020970	GTTCTT	2	12	63882	63893	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478460408
27	NC_020970	CTATTT	2	12	72204	72215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478460415
28	NC_020970	ACTCTT	2	12	73333	73344	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478460416
29	NC_020970	TTTCTG	2	12	73883	73894	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478460417
30	NC_020970	GATCAT	2	12	74013	74024	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460417
31	NC_020970	TAGTAC	2	12	77007	77018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460418
32	NC_020970	ATCTAG	2	12	77186	77197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020970	GGTTTA	2	12	80658	80669	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460421
34	NC_020970	TTTAGT	2	12	82431	82442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478460423
35	NC_020970	GTCTGT	2	12	83702	83713	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	478460424
36	NC_020970	TTCTGA	2	12	89316	89327	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460428
37	NC_020970	AAAAGA	2	12	94380	94391	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478460434
38	NC_020970	AGCTGT	2	12	96473	96484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460435
39	NC_020970	TCTTTT	2	12	97138	97149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478460437
40	NC_020970	GGGGCT	2	12	98086	98097	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	478460437
41	NC_020970	TTTGAG	2	12	100290	100301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460439
42	NC_020970	TCAGAA	2	12	106931	106942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460444
43	NC_020970	CATAAC	2	12	109975	109986	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478460447
44	NC_020970	TGTTCT	2	12	112739	112750	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478460449
45	NC_020970	ACTTCG	2	12	116023	116034	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478460451
46	NC_020970	TTTTAG	2	12	116458	116469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020970	TTGCCA	2	12	119561	119572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478460456
48	NC_020970	TAAAAA	2	12	121053	121064	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020970	TTGGTA	2	12	121101	121112	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460458
50	NC_020970	AGGATC	2	12	121480	121491	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460458
51	NC_020970	AAGGGT	2	12	123287	123298	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478460459
52	NC_020970	GGGTTT	2	12	124250	124261	0 %	50 %	50 %	0 %	478460460
53	NC_020970	TTGCAT	2	12	124532	124543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460460
54	NC_020970	AAGAGA	2	12	124901	124912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460460
55	NC_020970	TTAAAA	2	12	133835	133846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478460466
56	NC_020970	AGGTTG	2	12	135077	135088	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	478460467
57	NC_020970	CTGTTT	2	12	135772	135783	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478460468
58	NC_020970	GAGTTA	2	12	140127	140138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460476
59	NC_020970	TGGAAA	2	12	142680	142691	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478460479
60	NC_020970	TGGAAT	2	12	143555	143566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460480
61	NC_020970	ATGGTT	2	12	143799	143810	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460480
62	NC_020970	TGCTCT	2	12	145990	146001	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478460483
63	NC_020970	GAAAGG	2	12	149728	149739	50 %	0 %	50 %	0 %	478460485
64	NC_020970	GCTTTG	2	12	149971	149982	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	478460485
65	NC_020970	CCTCAT	2	12	155391	155402	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460490
66	NC_020970	TGGAGA	2	12	156849	156860	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478460492
67	NC_020970	CTCCAT	2	12	158216	158227	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460493
68	NC_020970	TCCTTG	2	12	158812	158823	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478460494
69	NC_020970	AACAGC	2	12	161449	161460	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478460497
70	NC_020970	AAAAAG	2	12	174036	174047	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478460504
71	NC_020970	TCCCAA	2	12	182466	182477	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478460510
72	NC_020970	AGAAAA	2	12	183083	183094	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020970	ACTTCT	2	12	190147	190158	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478460518
74	NC_020970	ATTTGC	2	12	192839	192850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460520
75	NC_020970	AAACAT	2	12	193929	193940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478460523
76	NC_020970	AGCAAC	2	12	194264	194275	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478460523
77	NC_020970	TATGAA	2	12	195858	195869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020970	TTGCCT	2	12	196973	196984	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478460527
79	NC_020970	TCTGGA	2	12	200223	200234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460531
80	NC_020970	CTGGAT	2	12	215814	215825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460544
81	NC_020970	GAAATA	2	12	216137	216148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478460544
82	NC_020970	TTTTAC	2	12	221868	221879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020970	GATGCA	2	12	223029	223040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460551
84	NC_020970	ACTCCA	2	12	223919	223930	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478460552
85	NC_020970	CTGCTT	2	12	224151	224162	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478460552
86	NC_020970	ATTGCT	2	12	227460	227471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460555
87	NC_020970	TCCTAG	2	12	227750	227761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478460555
88	NC_020970	GCAACG	2	12	228238	228249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478460556
89	NC_020970	CTTAGC	2	12	230871	230882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478460558
90	NC_020970	TTCCTT	2	12	237703	237714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460563
91	NC_020970	TCTCCT	2	12	240584	240595	0 %	50 %	0 %	50 %	478460564
92	NC_020970	AAACCA	2	12	241159	241170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478460565
93	NC_020970	AACCCT	2	12	255583	255594	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020970	ATTTTT	2	12	256387	256398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020970	CCTGCA	2	12	256548	256559	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478460583
96	NC_020970	ACCTTT	2	12	261743	261754	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478460588
97	NC_020970	TCATAA	2	12	269590	269601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478460595
98	NC_020970	AAGTGT	2	12	270316	270327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460595
99	NC_020970	AGGAGA	2	12	271489	271500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020970	ATCTAA	2	12	273594	273605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478460598
101	NC_020970	TGGAAT	2	12	275792	275803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460600
102	NC_020970	GGAACA	2	12	279679	279690	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478460602
103	NC_020970	ATATTA	2	12	280387	280398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020970	CACGCG	2	12	282052	282063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478460604
105	NC_020970	TTTCTT	2	12	282231	282242	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478460604
106	NC_020970	CTCCTA	2	12	286393	286404	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460607
107	NC_020970	GCAATG	2	12	292511	292522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460613
108	NC_020970	CGACAT	2	12	293184	293195	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478460614
109	NC_020970	CCCTTA	2	12	294638	294649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460616
110	NC_020970	AAAATA	2	12	296736	296747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478460618
111	NC_020970	ACCACT	2	12	299091	299102	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478460620
112	NC_020970	CATTGC	2	12	302337	302348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478460623
113	NC_020970	CCAAAA	2	12	303516	303527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478460624
114	NC_020970	TCTTTT	2	12	305401	305412	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478460626
115	NC_020970	CAAGAC	2	12	306492	306503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478460627
116	NC_020970	AGCTTA	2	12	307773	307784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460629
117	NC_020970	CAAAGA	2	12	313145	313156	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478460634
118	NC_020970	ATGGCT	2	12	313761	313772	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460635
119	NC_020970	TACAAA	2	12	317951	317962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478460638
120	NC_020970	TTAATT	2	12	319630	319641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478460640
121	NC_020970	AAAACA	2	12	323116	323127	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	478460642
122	NC_020970	AAAAAG	2	12	324542	324553	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020970	AGAGAA	2	12	325208	325219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460643
124	NC_020970	CAGAAC	2	12	345101	345112	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478460661
125	NC_020970	ATTCAA	2	12	350078	350089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478460666
126	NC_020970	AGAATA	2	12	362035	362046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020970	TTCTTA	2	12	362055	362066	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478460674
128	NC_020970	CAGCCT	2	12	374026	374037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478460688
129	NC_020970	AGCTGA	2	12	374076	374087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460688
130	NC_020970	ATGCTA	2	12	377943	377954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460690
131	NC_020970	CAATAG	2	12	384549	384560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460693
132	NC_020970	ACTGAA	2	12	384690	384701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460693
133	NC_020970	CTGCAC	2	12	384883	384894	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478460693
134	NC_020970	TCCATA	2	12	395241	395252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460702
135	NC_020970	TTAGGT	2	12	396599	396610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460704
136	NC_020970	AGGGAA	2	12	397925	397936	50 %	0 %	50 %	0 %	478460705
137	NC_020970	CTGAAG	2	12	398760	398771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460706
138	NC_020970	TAATCT	2	12	404177	404188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478460709
139	NC_020970	GAACAA	2	12	404679	404690	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478460710
140	NC_020970	CTAAAG	2	12	405062	405073	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460711
141	NC_020970	CCTTTC	2	12	406226	406237	0 %	50 %	0 %	50 %	478460712
142	NC_020970	TTTTAA	2	12	410090	410101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478460714
143	NC_020970	ACATGC	2	12	415769	415780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478460722
144	NC_020970	GGCTCT	2	12	416504	416515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460723
145	NC_020970	ATCTTG	2	12	418098	418109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460724
146	NC_020970	CCCCCA	2	12	419432	419443	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	478460725
147	NC_020970	TTCCTC	2	12	423497	423508	0 %	50 %	0 %	50 %	478460729
148	NC_020970	CTCTAC	2	12	426746	426757	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460731
149	NC_020970	ACATCA	2	12	427391	427402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478460732
150	NC_020970	CGGAAT	2	12	427653	427664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460733
151	NC_020970	TGATAA	2	12	429558	429569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478460734
152	NC_020970	AGCTAA	2	12	431932	431943	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460737
153	NC_020970	TTCTCC	2	12	443968	443979	0 %	50 %	0 %	50 %	478460748
154	NC_020970	ATGAAG	2	12	453019	453030	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478460756
155	NC_020970	TAACTC	2	12	453536	453547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460756
156	NC_020970	ATCCGC	2	12	454461	454472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478460756
157	NC_020970	CTAAAG	2	12	456879	456890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460757
158	NC_020970	CCAATA	2	12	461864	461875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478460761
159	NC_020970	ATCGGC	2	12	467711	467722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	478460769
160	NC_020970	TATTGG	2	12	468304	468315	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478460769
161	NC_020970	AAATAC	2	12	478584	478595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478460773
162	NC_020970	TCTTCA	2	12	481023	481034	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478460774
163	NC_020970	CTACAA	2	12	484786	484797	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478460774
164	NC_020970	CCAATC	2	12	489254	489265	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478460778
165	NC_020970	TTCTTT	2	12	493076	493087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478460785
166	NC_020970	CTGAAG	2	12	496135	496146	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460787
167	NC_020970	TGAGTA	2	12	496589	496600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460787
168	NC_020970	AAACTG	2	12	500036	500047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460792
169	NC_020970	TAACTA	2	12	503559	503570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_020970	AAGAAA	2	12	503572	503583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020970	GGTAAT	2	12	508374	508385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460800
172	NC_020970	AGTTTT	2	12	509382	509393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478460802
173	NC_020970	AGAATA	2	12	509547	509558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020970	GGTTGT	2	12	511510	511521	0 %	50 %	50 %	0 %	478460804
175	NC_020970	GCTGTT	2	12	513869	513880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	478460806
176	NC_020970	AACTAA	2	12	515280	515291	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
177	NC_020970	CTCTAT	2	12	517363	517374	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478460810
178	NC_020970	TGAACT	2	12	517870	517881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460810
179	NC_020970	TAATTC	2	12	519193	519204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478460811
180	NC_020970	ACTCCT	2	12	519462	519473	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460811
181	NC_020970	GATGAA	2	12	519982	519993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478460811
182	NC_020970	CAAAGC	2	12	524342	524353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478460812
183	NC_020970	CTTTAG	2	12	525620	525631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460814
184	NC_020970	CAGGAA	2	12	527322	527333	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478460816
185	NC_020970	ACTGTA	2	12	532107	532118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460820
186	NC_020970	AGCCAC	2	12	532142	532153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	478460820
187	NC_020970	AATGTC	2	12	533166	533177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460820
188	NC_020970	CAAATC	2	12	535635	535646	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478460822
189	NC_020970	CTCCAG	2	12	536417	536428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478460823
190	NC_020970	AGGGAA	2	12	540076	540087	50 %	0 %	50 %	0 %	478460827
191	NC_020970	AAAGAA	2	12	541933	541944	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478460830
192	NC_020970	CTTCCT	2	12	542582	542593	0 %	50 %	0 %	50 %	478460831
193	NC_020970	ACAAGA	2	12	544085	544096	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478460832
194	NC_020970	TAATTG	2	12	546130	546141	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478460835
195	NC_020970	TCCCTC	2	12	548996	549007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
196	NC_020970	ATTACA	2	12	551176	551187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478460839
197	NC_020970	CGGAAA	2	12	556662	556673	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478460844
198	NC_020970	ATATAG	2	12	557133	557144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478460844
199	NC_020970	GCATAG	2	12	560166	560177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478460848
200	NC_020970	TTTCAA	2	12	561338	561349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478460850
201	NC_020970	CAAAAA	2	12	561717	561728	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	478460850
202	NC_020970	AGATCC	2	12	564551	564562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478460853
203	NC_020970	AAAAAT	2	12	566971	566982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_020970	TTTTGC	2	12	573838	573849	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478460861
205	NC_020970	TCATAT	2	12	577935	577946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478460864
206	NC_020970	TGGAGA	2	12	579203	579214	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478460864
207	NC_020970	CTCCAT	2	12	579726	579737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460865
208	NC_020970	TTCAAA	2	12	586073	586084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478460873
209	NC_020970	TTTGTT	2	12	586855	586866	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	478460875
210	NC_020970	CTGATA	2	12	601211	601222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460899
211	NC_020970	CTGCTC	2	12	601259	601270	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	478460899
212	NC_020970	AGTCCA	2	12	603171	603182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478460900
213	NC_020970	TAGGGG	2	12	606139	606150	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
214	NC_020970	CAAAGA	2	12	606953	606964	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478460905
215	NC_020970	CCAAAA	2	12	610471	610482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478460909
216	NC_020970	GGATGG	2	12	612243	612254	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478460910
217	NC_020970	CGATAT	3	18	614571	614588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460911
218	NC_020970	TCTTTT	2	12	618133	618144	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
219	NC_020970	ACTGTA	2	12	619825	619836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478460915
220	NC_020970	CACTCT	2	12	620141	620152	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478460915
221	NC_020970	CCTTAG	2	12	623926	623937	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478460921
222	NC_020970	AACCTC	2	12	631991	632002	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478460925
223	NC_020970	CTCTTT	2	12	639001	639012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460934
224	NC_020970	ATATCC	2	12	639018	639029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460934
225	NC_020970	TAAACA	2	12	639129	639140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478460934
226	NC_020970	ATAAAC	2	12	642840	642851	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478460939
227	NC_020970	ATCTTG	2	12	643533	643544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460939
228	NC_020970	TTAAAT	2	12	646305	646316	50 %	50 %	0 %	0 %	478460941
229	NC_020970	TTATTT	2	12	649344	649355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_020970	GCTTCT	2	12	650694	650705	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478460945
231	NC_020970	TAGGAG	2	12	651661	651672	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478460945
232	NC_020970	CACAGG	2	12	653654	653665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478460947
233	NC_020970	TTCTAT	2	12	667483	667494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478460956
234	NC_020970	AGAAAG	2	12	669805	669816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460957
235	NC_020970	CATATT	2	12	681679	681690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478460969
236	NC_020970	AGCTGG	2	12	687855	687866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478460977
237	NC_020970	GCATCA	2	12	689697	689708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478460978
238	NC_020970	ATCAAT	2	12	694022	694033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478460982
239	NC_020970	CCGCAA	2	12	698903	698914	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	478460987
240	NC_020970	AAATGC	2	12	704865	704876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478460989
241	NC_020970	GAAAGA	2	12	706983	706994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460990
242	NC_020970	TCTTGA	2	12	712089	712100	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478460993
243	NC_020970	TATCCA	2	12	722272	722283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461003
244	NC_020970	TATTGA	2	12	738160	738171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478461012
245	NC_020970	TCTGCA	2	12	745813	745824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_020970	TGTGAT	2	12	746456	746467	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478461019
247	NC_020970	CAGGAA	2	12	749682	749693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478461021
248	NC_020970	TATTTT	2	12	755291	755302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_020970	GGGAAG	2	12	759413	759424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461032
250	NC_020970	GGAAGA	2	12	763077	763088	50 %	0 %	50 %	0 %	478461034
251	NC_020970	ATGCAA	2	12	765389	765400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478461038
252	NC_020970	GAGAAA	2	12	765618	765629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461038
253	NC_020970	TATATT	2	12	771058	771069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461043
254	NC_020970	TTTCCA	2	12	777880	777891	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478461049
255	NC_020970	ATGAAG	2	12	784489	784500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478461052
256	NC_020970	ATTAGG	2	12	790275	790286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461057
257	NC_020970	CCCTGA	2	12	793271	793282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478461060
258	NC_020970	AGAATT	2	12	796193	796204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478461063
259	NC_020970	AAGCTC	2	12	796432	796443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478461063
260	NC_020970	TTTCTT	2	12	799297	799308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478461065
261	NC_020970	AGAAAT	2	12	802487	802498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478461068
262	NC_020970	GAGAAA	2	12	802757	802768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020970	GAAATT	2	12	804100	804111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478461070
264	NC_020970	GCTGAG	2	12	804782	804793	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478461070
265	NC_020970	TTTTCT	2	12	805215	805226	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
266	NC_020970	TAGCCT	2	12	807729	807740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478461071
267	NC_020970	ATTTTT	2	12	808994	809005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020970	CACCTA	2	12	822290	822301	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478461081
269	NC_020970	AGCTAC	2	12	826258	826269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478461083
270	NC_020970	AAGAGG	2	12	828129	828140	50 %	0 %	50 %	0 %	478461085
271	NC_020970	GAAAGG	2	12	833005	833016	50 %	0 %	50 %	0 %	478461090
272	NC_020970	AGCTTC	2	12	834459	834470	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478461091
273	NC_020970	TTTTTA	2	12	835432	835443	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020970	ATCACA	2	12	838564	838575	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478461096
275	NC_020970	GATCCG	2	12	843173	843184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	478461100
276	NC_020970	TTATGC	2	12	850111	850122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478461106
277	NC_020970	ATGGGG	2	12	853145	853156	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478461109
278	NC_020970	AAAGAA	2	12	853624	853635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478461109
279	NC_020970	GGCTAG	2	12	854007	854018	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478461109
280	NC_020970	GAGAAA	2	12	854054	854065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461109
281	NC_020970	TAAGGA	2	12	856395	856406	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020970	CCGGAG	2	12	857313	857324	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_020970	CTTCTA	2	12	861238	861249	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478461110
284	NC_020970	CTTTTT	2	12	861922	861933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478461111
285	NC_020970	GACCTG	2	12	866884	866895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	478461115
286	NC_020970	CCTCTA	2	12	870459	870470	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
287	NC_020970	TAAGGA	2	12	878441	878452	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020970	CCGGAG	2	12	879359	879370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_020970	TTTTCT	2	12	889741	889752	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478461126
290	NC_020970	CTGTTC	2	12	890054	890065	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478461126
291	NC_020970	GTTTTT	2	12	890708	890719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	478461127
292	NC_020970	GTGTAT	2	12	891620	891631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478461128
293	NC_020970	TATTGG	2	12	895699	895710	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478461132
294	NC_020970	CCAACG	2	12	898027	898038	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	478461132
295	NC_020970	TCCAGA	2	12	900665	900676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478461136
296	NC_020970	TTTTGG	2	12	905868	905879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461140
297	NC_020970	CAATTT	2	12	906535	906546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478461142
298	NC_020970	ATCGCC	2	12	906806	906817	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478461142
299	NC_020970	GATAGT	2	12	915489	915500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461149
300	NC_020970	GACGGC	2	12	921789	921800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_020970	CTTCTC	2	12	922698	922709	0 %	50 %	0 %	50 %	478461156
302	NC_020970	AAACAA	2	12	923477	923488	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
303	NC_020970	GAGCAA	2	12	925300	925311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478461160
304	NC_020970	ATAGGG	2	12	946052	946063	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478461176
305	NC_020970	CGGAGG	2	12	946373	946384	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	478461177
306	NC_020970	GGATTA	2	12	956289	956300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461183
307	NC_020970	GAAAAA	2	12	956835	956846	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478461183
308	NC_020970	TTAAAA	2	12	960724	960735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461187
309	NC_020970	GCTATT	2	12	968344	968355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478461195
310	NC_020970	CAAATG	2	12	970877	970888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478461196
311	NC_020970	GGCTGG	2	12	981988	981999	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	478461203
312	NC_020970	ACAGGA	2	12	982100	982111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478461203
313	NC_020970	TTAAGC	2	12	983148	983159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478461204
314	NC_020970	CAGGGA	2	12	992119	992130	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	478461212
315	NC_020970	CTCCAT	2	12	994643	994654	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478461213
316	NC_020970	TCAGTA	2	12	995831	995842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478461214
317	NC_020970	CAGAAT	2	12	997104	997115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478461217
318	NC_020970	TACTAG	2	12	997617	997628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478461217
319	NC_020970	AGAATA	2	12	1004600	1004611	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478461226
320	NC_020970	AATTAA	2	12	1007344	1007355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461228
321	NC_020970	GCAATA	2	12	1008290	1008301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478461228
322	NC_020970	CTTTAT	2	12	1011683	1011694	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478461230
323	NC_020970	AGCTGG	2	12	1012111	1012122	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478461230
324	NC_020970	TTGTAA	2	12	1014979	1014990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478461233
325	NC_020970	GAAAAA	2	12	1029230	1029241	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478461243
326	NC_020970	TTTCTT	2	12	1029894	1029905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478461244
327	NC_020970	GTTTCC	2	12	1031181	1031192	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478461244
328	NC_020970	CAGCAC	2	12	1036075	1036086	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	478461246
329	NC_020970	GTAATA	2	12	1036240	1036251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478461246
330	NC_020970	ACCATC	2	12	1036982	1036993	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478461246
331	NC_020970	ATTTTT	2	12	1038964	1038975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_020970	TAAAAT	2	12	1042587	1042598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.