MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa1 complete genome

Total Repeats: 22983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020970	CTA	2	6	227589	227594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460555
5003	NC_020970	TCA	2	6	227596	227601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460555
5004	NC_020970	TG	3	6	227629	227634	0 %	50 %	50 %	0 %	478460555
5005	NC_020970	TCCTAG	2	12	227750	227761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478460555
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5008	NC_020970	GAG	2	6	227904	227909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460556
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5010	NC_020970	TCGA	2	8	227999	228006	25 %	25 %	25 %	25 %	478460556
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5012	NC_020970	GAT	2	6	228049	228054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460556
5013	NC_020970	ATG	2	6	228086	228091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460556
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5018	NC_020970	GCAACG	2	12	228238	228249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478460556
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5020	NC_020970	AATT	2	8	228285	228292	50 %	50 %	0 %	0 %	478460556
5021	NC_020970	ATTT	2	8	228348	228355	25 %	75 %	0 %	0 %	478460556
5022	NC_020970	T	6	6	228385	228390	0 %	100 %	0 %	0 %	478460556
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5028	NC_020970	TCCT	2	8	228748	228755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5030	NC_020970	ATT	2	6	228837	228842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5037	NC_020970	TGA	2	6	229201	229206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460557
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5041	NC_020970	TTG	2	6	229392	229397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478460557
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5057	NC_020970	TAT	2	6	230247	230252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478460558
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5123	NC_020970	TCA	2	6	233514	233519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460560
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5373	NC_020970	GCA	2	6	245715	245720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478460570
5374	NC_020970	TTCA	2	8	245729	245736	25 %	50 %	0 %	25 %	478460570
5375	NC_020970	ATA	2	6	245818	245823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478460570
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5377	NC_020970	CTT	2	6	245948	245953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460570
5378	NC_020970	TGC	2	6	246044	246049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460570
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5393	NC_020970	TTCT	2	8	246772	246779	0 %	75 %	0 %	25 %	478460570
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5401	NC_020970	TTTC	2	8	246983	246990	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5494	NC_020970	ATA	2	6	250982	250987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478460575
5495	NC_020970	ATC	2	6	250997	251002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460575
5496	NC_020970	ATG	2	6	251042	251047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460575
5497	NC_020970	ACA	2	6	251061	251066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478460575
5498	NC_020970	GGAA	2	8	251078	251085	50 %	0 %	50 %	0 %	478460575
5499	NC_020970	GCT	2	6	251105	251110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460575
5500	NC_020970	CCA	2	6	251132	251137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478460575

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