MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020969	AT	3	6	633947	633952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020969	A	11	11	633955	633965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_020969	T	6	6	633989	633994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_020969	A	6	6	634056	634061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020969	CCTG	2	8	634147	634154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_020969	GTC	2	6	634227	634232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473534
14007	NC_020969	TAA	2	6	634235	634240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473534
14008	NC_020969	A	6	6	634239	634244	100 %	0 %	0 %	0 %	478473534
14009	NC_020969	TC	3	6	634247	634252	0 %	50 %	0 %	50 %	478473534
14010	NC_020969	AAG	2	6	634306	634311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473534
14011	NC_020969	GAA	2	6	634341	634346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473534
14012	NC_020969	AGGA	2	8	634387	634394	50 %	0 %	50 %	0 %	478473534
14013	NC_020969	TTA	2	6	634426	634431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473534
14014	NC_020969	CCTC	2	8	634465	634472	0 %	25 %	0 %	75 %	478473534
14015	NC_020969	ATC	2	6	634503	634508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473534
14016	NC_020969	AAC	2	6	634630	634635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473534
14017	NC_020969	A	7	7	634649	634655	100 %	0 %	0 %	0 %	478473534
14018	NC_020969	CT	3	6	634683	634688	0 %	50 %	0 %	50 %	478473534
14019	NC_020969	A	6	6	634809	634814	100 %	0 %	0 %	0 %	478473534
14020	NC_020969	ACA	2	6	634830	634835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473534
14021	NC_020969	AAGA	2	8	634851	634858	75 %	0 %	25 %	0 %	478473534
14022	NC_020969	TCT	2	6	634897	634902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473535
14023	NC_020969	GCA	2	6	634950	634955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473535
14024	NC_020969	CTT	2	6	634966	634971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473535
14025	NC_020969	CTC	2	6	634990	634995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473535
14026	NC_020969	A	6	6	635020	635025	100 %	0 %	0 %	0 %	478473535
14027	NC_020969	CCT	2	6	635085	635090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473535
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14030	NC_020969	CCT	2	6	635200	635205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473535
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14032	NC_020969	ACA	2	6	635255	635260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473535
14033	NC_020969	CCT	2	6	635265	635270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473535
14034	NC_020969	A	6	6	635352	635357	100 %	0 %	0 %	0 %	478473535
14035	NC_020969	TCGAG	2	10	635362	635371	20 %	20 %	40 %	20 %	478473535
14036	NC_020969	T	6	6	635389	635394	0 %	100 %	0 %	0 %	478473535
14037	NC_020969	TTG	2	6	635419	635424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473535
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14040	NC_020969	ATC	2	6	635565	635570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473535
14041	NC_020969	TCA	2	6	635581	635586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473535
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14043	NC_020969	ATG	3	9	635685	635693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473535
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14045	NC_020969	CTA	2	6	635763	635768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473535
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14049	NC_020969	TTA	2	6	635867	635872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473536
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14055	NC_020969	TGC	2	6	636052	636057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473536
14056	NC_020969	GGCTC	2	10	636126	636135	0 %	20 %	40 %	40 %	478473537
14057	NC_020969	TA	3	6	636149	636154	50 %	50 %	0 %	0 %	478473537
14058	NC_020969	AGCC	2	8	636162	636169	25 %	0 %	25 %	50 %	478473537
14059	NC_020969	TCTT	2	8	636186	636193	0 %	75 %	0 %	25 %	478473537
14060	NC_020969	ATC	2	6	636227	636232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473537
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14065	NC_020969	CT	3	6	636496	636501	0 %	50 %	0 %	50 %	478473537
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14089	NC_020969	GAG	2	6	637457	637462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473538
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14091	NC_020969	T	7	7	637502	637508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_020969	ATTAA	2	10	637515	637524	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020969	A	6	6	637569	637574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_020969	TCT	2	6	637591	637596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473539
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14119	NC_020969	TCCAT	2	10	638696	638705	20 %	40 %	0 %	40 %	478473540
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14123	NC_020969	CTA	2	6	638765	638770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473540
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14232	NC_020969	T	7	7	643467	643473	0 %	100 %	0 %	0 %	478473545
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14240	NC_020969	AGCG	2	8	643880	643887	25 %	0 %	50 %	25 %	478473545
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14476	NC_020969	A	6	6	654442	654447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14488	NC_020969	GCT	2	6	655047	655052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473554
14489	NC_020969	GAA	2	6	655107	655112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473554
14490	NC_020969	CCTT	2	8	655169	655176	0 %	50 %	0 %	50 %	478473554
14491	NC_020969	TCT	2	6	655215	655220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473554
14492	NC_020969	AT	3	6	655263	655268	50 %	50 %	0 %	0 %	478473554
14493	NC_020969	TCA	2	6	655310	655315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473554
14494	NC_020969	AGA	2	6	655319	655324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473554
14495	NC_020969	A	7	7	655328	655334	100 %	0 %	0 %	0 %	478473554
14496	NC_020969	TC	3	6	655372	655377	0 %	50 %	0 %	50 %	478473554
14497	NC_020969	CTG	2	6	655390	655395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473554
14498	NC_020969	T	6	6	655403	655408	0 %	100 %	0 %	0 %	478473554
14499	NC_020969	GTT	2	6	655425	655430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473554
14500	NC_020969	ACT	2	6	655447	655452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473554

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