MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020968	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478459454
2	NC_020968	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	478459454
3	NC_020968	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	478459454
4	NC_020968	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020968	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	478459457
6	NC_020968	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	478459457
7	NC_020968	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	478459458
8	NC_020968	TC	3	6	5864	5869	0 %	50 %	0 %	50 %	478459459
9	NC_020968	GA	3	6	5875	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	478459459
10	NC_020968	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	478459459
11	NC_020968	TG	3	6	6132	6137	0 %	50 %	50 %	0 %	478459459
12	NC_020968	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	478459459
13	NC_020968	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020968	AC	3	6	8248	8253	50 %	0 %	0 %	50 %	478459461
15	NC_020968	AG	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	478459462
16	NC_020968	CT	4	8	9110	9117	0 %	50 %	0 %	50 %	478459462
17	NC_020968	GT	3	6	9192	9197	0 %	50 %	50 %	0 %	478459462
18	NC_020968	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478459464
19	NC_020968	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478459464
20	NC_020968	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020968	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478459465
22	NC_020968	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478459465
23	NC_020968	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478459466
24	NC_020968	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478459466
25	NC_020968	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478459466
26	NC_020968	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020968	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020968	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478459467
29	NC_020968	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478459468
30	NC_020968	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478459468
31	NC_020968	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478459469
32	NC_020968	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478459469
33	NC_020968	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478459469
34	NC_020968	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020968	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020968	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478459470
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39	NC_020968	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478459471
40	NC_020968	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478459471
41	NC_020968	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478459471
42	NC_020968	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478459471
43	NC_020968	AG	4	8	20116	20123	50 %	0 %	50 %	0 %	478459471
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46	NC_020968	TG	3	6	20720	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	478459472
47	NC_020968	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020968	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020968	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020968	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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55	NC_020968	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478459473
56	NC_020968	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478459473
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61	NC_020968	GA	3	6	27112	27117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020968	CT	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020968	AT	3	6	27405	27410	50 %	50 %	0 %	0 %	478459475
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66	NC_020968	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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75	NC_020968	GA	3	6	31829	31834	50 %	0 %	50 %	0 %	478459479
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92	NC_020968	AG	3	6	39202	39207	50 %	0 %	50 %	0 %	478459487
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111	NC_020968	TC	3	6	44243	44248	0 %	50 %	0 %	50 %	478459492
112	NC_020968	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020968	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_020968	GA	3	6	45956	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	478459494
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118	NC_020968	AG	4	8	46626	46633	50 %	0 %	50 %	0 %	478459495
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121	NC_020968	AG	3	6	47071	47076	50 %	0 %	50 %	0 %	478459495
122	NC_020968	AG	3	6	48643	48648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_020968	GA	3	6	53976	53981	50 %	0 %	50 %	0 %	478459501
129	NC_020968	CT	3	6	54293	54298	0 %	50 %	0 %	50 %	478459501
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131	NC_020968	AT	3	6	56179	56184	50 %	50 %	0 %	0 %	478459502
132	NC_020968	GA	3	6	56216	56221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_020968	TG	3	6	57868	57873	0 %	50 %	50 %	0 %	478459503
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