MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020968	AGAAA	2	10	182603	182612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020968	AAGA	2	8	182624	182631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020968	T	8	8	182648	182655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020968	AGAAAA	2	12	182666	182677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020968	A	7	7	182674	182680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020968	TCG	2	6	182715	182720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459609
4008	NC_020968	TGT	2	6	182727	182732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459609
4009	NC_020968	T	6	6	182745	182750	0 %	100 %	0 %	0 %	478459609
4010	NC_020968	T	7	7	182752	182758	0 %	100 %	0 %	0 %	478459609
4011	NC_020968	AAG	2	6	182805	182810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459609
4012	NC_020968	GATG	2	8	182836	182843	25 %	25 %	50 %	0 %	478459609
4013	NC_020968	TCT	2	6	182853	182858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459609
4014	NC_020968	AGG	2	6	182907	182912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459609
4015	NC_020968	GGA	2	6	182941	182946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459609
4016	NC_020968	TTGAG	2	10	182986	182995	20 %	40 %	40 %	0 %	478459609
4017	NC_020968	GAATG	2	10	183011	183020	40 %	20 %	40 %	0 %	478459609
4018	NC_020968	CT	3	6	183061	183066	0 %	50 %	0 %	50 %	478459609
4019	NC_020968	TGA	2	6	183075	183080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459609
4020	NC_020968	GA	4	8	183103	183110	50 %	0 %	50 %	0 %	478459609
4021	NC_020968	AAC	2	6	183158	183163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459609
4022	NC_020968	TGA	2	6	183177	183182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459609
4023	NC_020968	TGC	2	6	183213	183218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459609
4024	NC_020968	CCAG	2	8	183233	183240	25 %	0 %	25 %	50 %	478459609
4025	NC_020968	TTG	2	6	183242	183247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459609
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4049	NC_020968	TGA	2	6	183986	183991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459610
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4060	NC_020968	TAT	2	6	184365	184370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_020968	GA	3	6	184405	184410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020968	AGA	2	6	184447	184452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459611
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4110	NC_020968	ACGAT	2	10	187168	187177	40 %	20 %	20 %	20 %	478459614
4111	NC_020968	TTTA	2	8	187186	187193	25 %	75 %	0 %	0 %	478459614
4112	NC_020968	AAG	2	6	187197	187202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459614
4113	NC_020968	AGA	2	6	187282	187287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459614
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4120	NC_020968	GCT	2	6	187529	187534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459614
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4123	NC_020968	TAG	2	6	187872	187877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459614
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4125	NC_020968	T	7	7	187915	187921	0 %	100 %	0 %	0 %	478459614
4126	NC_020968	TTA	2	6	187945	187950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459614
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4132	NC_020968	AGT	2	6	188037	188042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_020968	TGC	2	6	188128	188133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4136	NC_020968	AGT	2	6	188219	188224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_020968	TTG	2	6	188227	188232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_020968	T	6	6	188326	188331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_020968	GCA	2	6	188379	188384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4143	NC_020968	AAG	2	6	188531	188536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4147	NC_020968	TAA	2	6	188681	188686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_020968	TGT	2	6	192876	192881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_020968	CTGG	2	8	192930	192937	0 %	25 %	50 %	25 %	478459619
4234	NC_020968	AAAAG	2	10	192970	192979	80 %	0 %	20 %	0 %	478459619
4235	NC_020968	T	6	6	192993	192998	0 %	100 %	0 %	0 %	478459619
4236	NC_020968	TATCA	2	10	193043	193052	40 %	40 %	0 %	20 %	478459619
4237	NC_020968	CTCA	2	8	193076	193083	25 %	25 %	0 %	50 %	478459619
4238	NC_020968	AG	3	6	193085	193090	50 %	0 %	50 %	0 %	478459619
4239	NC_020968	GATCT	2	10	193189	193198	20 %	40 %	20 %	20 %	478459619
4240	NC_020968	ATGC	2	8	193236	193243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4241	NC_020968	GTT	2	6	193244	193249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_020968	GCA	2	6	193297	193302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_020968	CTTT	2	8	193377	193384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4244	NC_020968	AAG	2	6	193424	193429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_020968	T	6	6	193474	193479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_020968	ATT	2	6	193487	193492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_020968	T	6	6	193503	193508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_020968	AAACAT	2	12	193550	193561	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478459620
4249	NC_020968	TTCC	2	8	193577	193584	0 %	50 %	0 %	50 %	478459620
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