MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020967	GGA	2	6	182979	182984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478472216
4003	NC_020967	TTGAG	2	10	183025	183034	20 %	40 %	40 %	0 %	478472216
4004	NC_020967	GAATG	2	10	183050	183059	40 %	20 %	40 %	0 %	478472216
4005	NC_020967	CT	3	6	183100	183105	0 %	50 %	0 %	50 %	478472216
4006	NC_020967	TGA	2	6	183114	183119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472216
4007	NC_020967	GA	4	8	183142	183149	50 %	0 %	50 %	0 %	478472216
4008	NC_020967	AAC	2	6	183197	183202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478472216
4009	NC_020967	TGA	2	6	183216	183221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472216
4010	NC_020967	TGC	2	6	183252	183257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472216
4011	NC_020967	CCAG	2	8	183272	183279	25 %	0 %	25 %	50 %	478472216
4012	NC_020967	TTG	2	6	183281	183286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472216
4013	NC_020967	GAC	2	6	183290	183295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478472216
4014	NC_020967	GAT	2	6	183320	183325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472216
4015	NC_020967	GA	3	6	183346	183351	50 %	0 %	50 %	0 %	478472216
4016	NC_020967	GCG	2	6	183354	183359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478472216
4017	NC_020967	ACT	2	6	183402	183407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472216
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4019	NC_020967	GCA	2	6	183491	183496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478472217
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4021	NC_020967	AGA	2	6	183545	183550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472217
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4040	NC_020967	GGA	3	9	184154	184162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478472217
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4042	NC_020967	ATT	2	6	184189	184194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472217
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4044	NC_020967	T	8	8	184231	184238	0 %	100 %	0 %	0 %	478472217
4045	NC_020967	ATA	2	6	184281	184286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478472217
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4047	NC_020967	TAT	2	6	184362	184367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_020967	GA	3	6	184402	184407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4053	NC_020967	CTG	2	6	184693	184698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472218
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4074	NC_020967	T	7	7	186209	186215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4113	NC_020967	TTA	2	6	187942	187947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472221
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4116	NC_020967	T	6	6	187990	187995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_020967	AGT	2	6	188034	188039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020967	AAAC	2	8	188059	188066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_020967	TGC	2	6	188125	188130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_020967	AGT	2	6	188193	188198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020967	AGT	2	6	188216	188221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_020967	TAT	2	6	188304	188309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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