MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2626	NC_020967	TCC	2	6	119328	119333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472162
2627	NC_020967	TTTA	2	8	119346	119353	25 %	75 %	0 %	0 %	478472162
2628	NC_020967	CTG	2	6	119544	119549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472162
2629	NC_020967	AGA	2	6	119573	119578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472162
2630	NC_020967	TTGCCA	2	12	119596	119607	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478472162
2631	NC_020967	GA	4	8	119619	119626	50 %	0 %	50 %	0 %	478472162
2632	NC_020967	GAA	2	6	119633	119638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472162
2633	NC_020967	TTC	2	6	119672	119677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472162
2634	NC_020967	TACT	2	8	119734	119741	25 %	50 %	0 %	25 %	478472162
2635	NC_020967	GTT	2	6	119778	119783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472162
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2637	NC_020967	GAT	2	6	119829	119834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472162
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2640	NC_020967	AG	3	6	120054	120059	50 %	0 %	50 %	0 %	478472163
2641	NC_020967	GCTA	2	8	120076	120083	25 %	25 %	25 %	25 %	478472163
2642	NC_020967	GA	3	6	120087	120092	50 %	0 %	50 %	0 %	478472163
2643	NC_020967	AAG	2	6	120095	120100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472163
2644	NC_020967	GCT	3	9	120101	120109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472163
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2647	NC_020967	TC	3	6	120175	120180	0 %	50 %	0 %	50 %	478472163
2648	NC_020967	GCTA	2	8	120208	120215	25 %	25 %	25 %	25 %	478472163
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2652	NC_020967	TCC	2	6	120319	120324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472163
2653	NC_020967	AG	3	6	120365	120370	50 %	0 %	50 %	0 %	478472163
2654	NC_020967	GA	4	8	120408	120415	50 %	0 %	50 %	0 %	478472163
2655	NC_020967	GGC	2	6	120448	120453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478472163
2656	NC_020967	T	6	6	120547	120552	0 %	100 %	0 %	0 %	478472163
2657	NC_020967	TCT	2	6	120632	120637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472163
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2659	NC_020967	ATC	2	6	120835	120840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472163
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2661	NC_020967	GA	3	6	120916	120921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2662	NC_020967	TAT	2	6	120940	120945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_020967	ATA	2	6	120961	120966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_020967	CTGG	2	8	120984	120991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2665	NC_020967	TAAAAA	2	12	121088	121099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2666	NC_020967	TTGGTA	2	12	121136	121147	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478472164
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2705	NC_020967	TA	3	6	123151	123156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2723	NC_020967	T	6	6	124184	124189	0 %	100 %	0 %	0 %	478472166
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2731	NC_020967	TTA	2	6	124433	124438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472166
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2736	NC_020967	A	7	7	124585	124591	100 %	0 %	0 %	0 %	478472166
2737	NC_020967	CTG	2	6	124594	124599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472166
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2740	NC_020967	ATCG	2	8	124653	124660	25 %	25 %	25 %	25 %	478472166
2741	NC_020967	AG	3	6	124674	124679	50 %	0 %	50 %	0 %	478472166
2742	NC_020967	AGC	2	6	124862	124867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478472166
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2744	NC_020967	TGA	2	6	124921	124926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472166
2745	NC_020967	AAGAGA	2	12	124936	124947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472166
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2747	NC_020967	AGA	2	6	124991	124996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472166
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2999	NC_020967	AGG	2	6	136114	136119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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