MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020967	ATG	2	6	69544	69549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472120
1503	NC_020967	AAAAG	2	10	69576	69585	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020967	A	6	6	69677	69682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020967	AAG	2	6	69693	69698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020967	TTC	2	6	69752	69757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020967	CTT	3	9	69761	69769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_020967	AT	3	6	69774	69779	50 %	50 %	0 %	0 %	478472121
1509	NC_020967	TTCG	2	8	69794	69801	0 %	50 %	25 %	25 %	478472121
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1512	NC_020967	T	6	6	69959	69964	0 %	100 %	0 %	0 %	478472121
1513	NC_020967	TCT	2	6	70075	70080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472121
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1515	NC_020967	TGC	2	6	70281	70286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472121
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1517	NC_020967	CT	3	6	70326	70331	0 %	50 %	0 %	50 %	478472121
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1519	NC_020967	GCGAT	2	10	70388	70397	20 %	20 %	40 %	20 %	478472121
1520	NC_020967	GTT	2	6	70410	70415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472121
1521	NC_020967	GCT	2	6	70432	70437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472121
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1524	NC_020967	GCA	2	6	70581	70586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478472121
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1541	NC_020967	CT	3	6	71292	71297	0 %	50 %	0 %	50 %	478472121
1542	NC_020967	GA	3	6	71313	71318	50 %	0 %	50 %	0 %	478472121
1543	NC_020967	AGT	2	6	71355	71360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472121
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1550	NC_020967	T	8	8	71659	71666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1554	NC_020967	A	6	6	71878	71883	100 %	0 %	0 %	0 %	478472122
1555	NC_020967	ATT	2	6	71928	71933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472122
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1558	NC_020967	TTCT	2	8	72121	72128	0 %	75 %	0 %	25 %	478472122
1559	NC_020967	ATG	2	6	72133	72138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472122
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1562	NC_020967	GAGC	2	8	72195	72202	25 %	0 %	50 %	25 %	478472122
1563	NC_020967	TCA	2	6	72220	72225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472122
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1565	NC_020967	CTATTT	2	12	72238	72249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478472122
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1567	NC_020967	ATG	2	6	72310	72315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472122
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1569	NC_020967	CGT	2	6	72488	72493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1617	NC_020967	TGGGA	2	10	74209	74218	20 %	20 %	60 %	0 %	478472124
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