MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13504	NC_020967	CT	3	6	611556	611561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13505	NC_020967	TCT	2	6	611581	611586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_020967	GAC	2	6	611618	611623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_020967	TAC	2	6	611626	611631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_020967	ATG	2	6	611643	611648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_020967	A	6	6	611678	611683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_020967	AC	3	6	611751	611756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13512	NC_020967	TCT	2	6	611876	611881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472616
13513	NC_020967	TTC	2	6	611905	611910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472616
13514	NC_020967	TGCCA	2	10	611937	611946	20 %	20 %	20 %	40 %	478472616
13515	NC_020967	GTA	2	6	611996	612001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472616
13516	NC_020967	CT	3	6	612002	612007	0 %	50 %	0 %	50 %	478472616
13517	NC_020967	GATT	2	8	612086	612093	25 %	50 %	25 %	0 %	478472616
13518	NC_020967	TCT	2	6	612113	612118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472616
13519	NC_020967	TC	3	6	612123	612128	0 %	50 %	0 %	50 %	478472616
13520	NC_020967	GGTT	2	8	612169	612176	0 %	50 %	50 %	0 %	478472616
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13523	NC_020967	TGG	2	6	612247	612252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478472616
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13532	NC_020967	CT	3	6	612517	612522	0 %	50 %	0 %	50 %	478472616
13533	NC_020967	TTAC	2	8	612539	612546	25 %	50 %	0 %	25 %	478472616
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13537	NC_020967	CT	3	6	612632	612637	0 %	50 %	0 %	50 %	478472616
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13542	NC_020967	TCT	2	6	612782	612787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472616
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13548	NC_020967	A	6	6	612937	612942	100 %	0 %	0 %	0 %	478472616
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13552	NC_020967	TTG	2	6	613230	613235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472617
13553	NC_020967	CGCT	2	8	613263	613270	0 %	25 %	25 %	50 %	478472617
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13607	NC_020967	A	6	6	615884	615889	100 %	0 %	0 %	0 %	478472617
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13994	NC_020967	TCCT	2	8	633217	633224	0 %	50 %	0 %	50 %	478472632
13995	NC_020967	TCCC	2	8	633249	633256	0 %	25 %	0 %	75 %	478472632
13996	NC_020967	ATT	2	6	633271	633276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472632
13997	NC_020967	ACT	2	6	633307	633312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472632
13998	NC_020967	GCT	2	6	633351	633356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472632
13999	NC_020967	CTAC	2	8	633373	633380	25 %	25 %	0 %	50 %	478472632
14000	NC_020967	TCC	2	6	633406	633411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472632

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