MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020967	CAT	4	12	251863	251874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472282
5503	NC_020967	TTA	2	6	252009	252014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472282
5504	NC_020967	CTC	2	6	252040	252045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472282
5505	NC_020967	AGT	2	6	252064	252069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472282
5506	NC_020967	GCAG	2	8	252111	252118	25 %	0 %	50 %	25 %	478472282
5507	NC_020967	TCTT	2	8	252128	252135	0 %	75 %	0 %	25 %	478472282
5508	NC_020967	C	7	7	252140	252146	0 %	0 %	0 %	100 %	478472282
5509	NC_020967	AGA	2	6	252156	252161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472282
5510	NC_020967	CTT	2	6	252172	252177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472282
5511	NC_020967	ACA	2	6	252188	252193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478472282
5512	NC_020967	TC	3	6	252230	252235	0 %	50 %	0 %	50 %	478472282
5513	NC_020967	TTG	2	6	252287	252292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472282
5514	NC_020967	TCT	2	6	252309	252314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472282
5515	NC_020967	T	7	7	252349	252355	0 %	100 %	0 %	0 %	478472282
5516	NC_020967	CAA	2	6	252366	252371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478472282
5517	NC_020967	AGA	3	9	252439	252447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472282
5518	NC_020967	GGC	2	6	252450	252455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478472282
5519	NC_020967	ACA	2	6	252480	252485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478472282
5520	NC_020967	CAC	2	6	252487	252492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478472282
5521	NC_020967	CAG	2	6	252493	252498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478472282
5522	NC_020967	T	8	8	252562	252569	0 %	100 %	0 %	0 %	478472282
5523	NC_020967	TCC	2	6	252653	252658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_020967	GAAA	2	8	252674	252681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_020967	T	7	7	252695	252701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_020967	GCAG	2	8	252723	252730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_020967	AGAA	2	8	252756	252763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_020967	AG	3	6	252798	252803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_020967	TAT	2	6	252821	252826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_020967	ACA	2	6	252862	252867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_020967	A	6	6	252911	252916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_020967	TTG	2	6	253091	253096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472283
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5534	NC_020967	TC	3	6	253160	253165	0 %	50 %	0 %	50 %	478472283
5535	NC_020967	T	7	7	253196	253202	0 %	100 %	0 %	0 %	478472283
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5538	NC_020967	AATA	2	8	253316	253323	75 %	25 %	0 %	0 %	478472283
5539	NC_020967	GCT	2	6	253326	253331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472283
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5541	NC_020967	CCA	2	6	253423	253428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478472283
5542	NC_020967	CAA	2	6	253471	253476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478472283
5543	NC_020967	CCCA	2	8	253579	253586	25 %	0 %	0 %	75 %	478472284
5544	NC_020967	CTT	2	6	253708	253713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472284
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5546	NC_020967	CTC	2	6	253798	253803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472284
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5550	NC_020967	GCAA	2	8	253869	253876	50 %	0 %	25 %	25 %	478472284
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5553	NC_020967	AAC	2	6	253970	253975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_020967	A	6	6	253984	253989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_020967	TAA	2	6	254035	254040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5585	NC_020967	A	6	6	255073	255078	100 %	0 %	0 %	0 %	478472286
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5610	NC_020967	TTG	2	6	256216	256221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472288
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5612	NC_020967	TCC	2	6	256271	256276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472288
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5622	NC_020967	TAT	2	6	256799	256804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_020967	ATA	2	6	256808	256813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_020967	AAT	2	6	256832	256837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_020967	A	8	8	256912	256919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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