MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 23055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020966	CA	3	6	609028	609033	50 %	0 %	0 %	50 %	478459102
13502	NC_020966	GAA	2	6	609078	609083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459102
13503	NC_020966	A	6	6	609094	609099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_020966	TCG	2	6	609131	609136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459103
13505	NC_020966	ACTTC	2	10	609150	609159	20 %	40 %	0 %	40 %	478459103
13506	NC_020966	AG	3	6	609170	609175	50 %	0 %	50 %	0 %	478459103
13507	NC_020966	ATGT	2	8	609217	609224	25 %	50 %	25 %	0 %	478459103
13508	NC_020966	CTT	2	6	609243	609248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459103
13509	NC_020966	TTC	2	6	609317	609322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459103
13510	NC_020966	GAA	2	6	609326	609331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459103
13511	NC_020966	AGAA	2	8	609391	609398	75 %	0 %	25 %	0 %	478459103
13512	NC_020966	TTA	2	6	609437	609442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459103
13513	NC_020966	CAA	2	6	609630	609635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459103
13514	NC_020966	TGTC	2	8	609711	609718	0 %	50 %	25 %	25 %	478459103
13515	NC_020966	TCT	2	6	609728	609733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459103
13516	NC_020966	AT	3	6	609828	609833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_020966	TTC	2	6	609845	609850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_020966	T	6	6	609881	609886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_020966	A	11	11	609934	609944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_020966	CAT	2	6	610036	610041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459104
13521	NC_020966	CAT	2	6	610111	610116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459104
13522	NC_020966	GGA	2	6	610151	610156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459104
13523	NC_020966	A	6	6	610180	610185	100 %	0 %	0 %	0 %	478459104
13524	NC_020966	TAA	2	6	610222	610227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459104
13525	NC_020966	ATTTT	2	10	610235	610244	20 %	80 %	0 %	0 %	478459104
13526	NC_020966	GAAC	2	8	610319	610326	50 %	0 %	25 %	25 %	478459104
13527	NC_020966	GAT	2	6	610383	610388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459104
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13529	NC_020966	GCT	2	6	610538	610543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459104
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13531	NC_020966	CAA	2	6	610823	610828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459104
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13533	NC_020966	CAA	2	6	610953	610958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459104
13534	NC_020966	CCA	2	6	610991	610996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459104
13535	NC_020966	CGCA	2	8	611041	611048	25 %	0 %	25 %	50 %	478459104
13536	NC_020966	TCA	2	6	611054	611059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459104
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13538	NC_020966	GATA	2	8	611160	611167	50 %	25 %	25 %	0 %	478459104
13539	NC_020966	AGT	2	6	611181	611186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459104
13540	NC_020966	TTC	2	6	611353	611358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459104
13541	NC_020966	TCA	2	6	611375	611380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459104
13542	NC_020966	ACA	2	6	611412	611417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459104
13543	NC_020966	GAA	2	6	611426	611431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459104
13544	NC_020966	CA	3	6	611506	611511	50 %	0 %	0 %	50 %	478459104
13545	NC_020966	TGA	2	6	611546	611551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459104
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13550	NC_020966	TTG	2	6	611750	611755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459105
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13552	NC_020966	TTG	2	6	611849	611854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459105
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13554	NC_020966	CTT	2	6	611885	611890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459105
13555	NC_020966	CTGC	2	8	611962	611969	0 %	25 %	25 %	50 %	478459105
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13558	NC_020966	CGCC	2	8	612120	612127	0 %	0 %	25 %	75 %	478459105
13559	NC_020966	TAA	2	6	612189	612194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459105
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13578	NC_020966	A	6	6	612816	612821	100 %	0 %	0 %	0 %	478459105
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13582	NC_020966	T	7	7	613054	613060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_020966	ACC	2	6	613075	613080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13586	NC_020966	TAT	2	6	613135	613140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_020966	AC	3	6	613153	613158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13588	NC_020966	ATCC	2	8	613173	613180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13590	NC_020966	CT	3	6	613210	613215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13591	NC_020966	TCT	2	6	613235	613240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_020966	GAC	2	6	613272	613277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_020966	TAC	2	6	613280	613285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13594	NC_020966	ATG	2	6	613297	613302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_020966	A	6	6	613332	613337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_020966	AC	3	6	613405	613410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13597	NC_020966	CCT	2	6	613457	613462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459106
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13603	NC_020966	GATT	2	8	613740	613747	25 %	50 %	25 %	0 %	478459106
13604	NC_020966	TCT	2	6	613767	613772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459106
13605	NC_020966	TC	3	6	613777	613782	0 %	50 %	0 %	50 %	478459106
13606	NC_020966	GGTT	2	8	613823	613830	0 %	50 %	50 %	0 %	478459106
13607	NC_020966	GGATGG	2	12	613835	613846	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478459106
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13611	NC_020966	GGCGC	2	10	613986	613995	0 %	0 %	60 %	40 %	478459106
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13613	NC_020966	TAT	2	6	614020	614025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459106
13614	NC_020966	ATCG	2	8	614042	614049	25 %	25 %	25 %	25 %	478459106
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13622	NC_020966	TTTA	2	8	614246	614253	25 %	75 %	0 %	0 %	478459106
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