MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 23055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020966	TCT	2	6	250745	250750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458768
5502	NC_020966	TTC	2	6	250781	250786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458768
5503	NC_020966	CAA	2	6	250837	250842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458768
5504	NC_020966	TTTC	2	8	250845	250852	0 %	75 %	0 %	25 %	478458768
5505	NC_020966	T	6	6	250879	250884	0 %	100 %	0 %	0 %	478458768
5506	NC_020966	GTG	2	6	250935	250940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458769
5507	NC_020966	GTATT	2	10	250960	250969	20 %	60 %	20 %	0 %	478458769
5508	NC_020966	CAT	2	6	251007	251012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458769
5509	NC_020966	TCA	2	6	251020	251025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458769
5510	NC_020966	A	6	6	251041	251046	100 %	0 %	0 %	0 %	478458769
5511	NC_020966	TAT	2	6	251052	251057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458769
5512	NC_020966	T	6	6	251075	251080	0 %	100 %	0 %	0 %	478458769
5513	NC_020966	TTC	2	6	251116	251121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458769
5514	NC_020966	AT	3	6	251125	251130	50 %	50 %	0 %	0 %	478458769
5515	NC_020966	ATC	2	6	251150	251155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458769
5516	NC_020966	TAT	2	6	251180	251185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458769
5517	NC_020966	GCA	2	6	251211	251216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458769
5518	NC_020966	AAG	2	6	251246	251251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458769
5519	NC_020966	GAAA	2	8	251270	251277	75 %	0 %	25 %	0 %	478458769
5520	NC_020966	A	6	6	251275	251280	100 %	0 %	0 %	0 %	478458769
5521	NC_020966	CTC	2	6	251308	251313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458769
5522	NC_020966	CTCC	2	8	251370	251377	0 %	25 %	0 %	75 %	478458769
5523	NC_020966	AGA	2	6	251411	251416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458769
5524	NC_020966	TCT	2	6	251565	251570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458770
5525	NC_020966	AGA	2	6	251625	251630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458770
5526	NC_020966	ACC	2	6	251651	251656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458770
5527	NC_020966	TGCA	2	8	251660	251667	25 %	25 %	25 %	25 %	478458770
5528	NC_020966	GCC	2	6	251849	251854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478458770
5529	NC_020966	GAA	2	6	251867	251872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458770
5530	NC_020966	CT	3	6	251908	251913	0 %	50 %	0 %	50 %	478458770
5531	NC_020966	GAT	2	6	251924	251929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458770
5532	NC_020966	TCCGT	2	10	251940	251949	0 %	40 %	20 %	40 %	478458770
5533	NC_020966	CTC	2	6	251956	251961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458770
5534	NC_020966	AAT	2	6	251969	251974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458770
5535	NC_020966	CCA	2	6	252003	252008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458770
5536	NC_020966	ATA	2	6	252105	252110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458770
5537	NC_020966	ATC	2	6	252120	252125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458770
5538	NC_020966	ATG	2	6	252165	252170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458770
5539	NC_020966	ACA	2	6	252184	252189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458770
5540	NC_020966	GGAA	2	8	252201	252208	50 %	0 %	50 %	0 %	478458770
5541	NC_020966	GCT	2	6	252228	252233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458770
5542	NC_020966	CCA	2	6	252255	252260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458770
5543	NC_020966	GA	3	6	252421	252426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_020966	GCG	2	6	252461	252466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_020966	ACT	2	6	252481	252486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_020966	TG	3	6	252531	252536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_020966	AATA	2	8	252598	252605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020966	T	6	6	252620	252625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020966	T	7	7	252639	252645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020966	A	6	6	252647	252652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020966	ACA	2	6	252747	252752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_020966	CTT	2	6	252754	252759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_020966	AAG	2	6	252785	252790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020966	GCA	2	6	252804	252809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_020966	TTG	2	6	252824	252829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020966	CAAA	2	8	252988	252995	75 %	0 %	0 %	25 %	478458771
5557	NC_020966	ATA	2	6	253011	253016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458771
5558	NC_020966	CAAT	2	8	253098	253105	50 %	25 %	0 %	25 %	478458771
5559	NC_020966	CTTT	3	12	253150	253161	0 %	75 %	0 %	25 %	478458771
5560	NC_020966	CGA	2	6	253192	253197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458771
5561	NC_020966	CTT	2	6	253203	253208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458771
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5563	NC_020966	CTC	2	6	253244	253249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_020966	CAA	2	6	253288	253293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_020966	AG	3	6	253333	253338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_020966	A	8	8	253339	253346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_020966	AAG	2	6	253357	253362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_020966	CAT	4	12	253407	253418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458772
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5573	NC_020966	TCTT	2	8	253672	253679	0 %	75 %	0 %	25 %	478458772
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5582	NC_020966	CAA	2	6	253910	253915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458772
5583	NC_020966	AGA	3	9	253983	253991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458772
5584	NC_020966	GGC	2	6	253994	253999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478458772
5585	NC_020966	ACA	2	6	254024	254029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458772
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5588	NC_020966	ACA	2	6	254072	254077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458772
5589	NC_020966	T	8	8	254106	254113	0 %	100 %	0 %	0 %	478458772
5590	NC_020966	TCC	2	6	254197	254202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_020966	T	7	7	254239	254245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020966	TAT	2	6	254365	254370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020966	ACA	2	6	254406	254411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_020966	A	6	6	254455	254460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_020966	TTG	2	6	254635	254640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458773
5596	NC_020966	TCT	2	6	254657	254662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458773
5597	NC_020966	T	7	7	254740	254746	0 %	100 %	0 %	0 %	478458773
5598	NC_020966	CCA	2	6	254753	254758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458773
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5601	NC_020966	GCT	2	6	254870	254875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458773
5602	NC_020966	ACA	2	6	254935	254940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458773
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5605	NC_020966	CCCA	2	8	255123	255130	25 %	0 %	0 %	75 %	478458774
5606	NC_020966	CA	3	6	255163	255168	50 %	0 %	0 %	50 %	478458774
5607	NC_020966	CTT	2	6	255252	255257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458774
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5612	NC_020966	CTC	2	6	255399	255404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458774
5613	NC_020966	GCAA	2	8	255413	255420	50 %	0 %	25 %	25 %	478458774
5614	NC_020966	AAC	2	6	255430	255435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458774
5615	NC_020966	GTT	2	6	255475	255480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458774
5616	NC_020966	AAC	2	6	255514	255519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_020966	A	6	6	255528	255533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_020966	TAA	2	6	255579	255584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_020966	TTC	2	6	255597	255602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458775
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5621	NC_020966	T	7	7	255638	255644	0 %	100 %	0 %	0 %	478458775
5622	NC_020966	AGCA	2	8	255675	255682	50 %	0 %	25 %	25 %	478458775
5623	NC_020966	CTT	2	6	255692	255697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458775
5624	NC_020966	TCT	3	9	255703	255711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458775
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