MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 2359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020965	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478457651
2	NC_020965	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	478457651
3	NC_020965	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	478457651
4	NC_020965	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020965	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	478457654
6	NC_020965	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	478457654
7	NC_020965	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	478457655
8	NC_020965	TC	3	6	5864	5869	0 %	50 %	0 %	50 %	478457656
9	NC_020965	GA	3	6	5875	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	478457656
10	NC_020965	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	478457656
11	NC_020965	TG	3	6	6132	6137	0 %	50 %	50 %	0 %	478457656
12	NC_020965	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	478457656
13	NC_020965	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020965	AC	3	6	8248	8253	50 %	0 %	0 %	50 %	478457658
15	NC_020965	AG	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	478457659
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18	NC_020965	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478457661
19	NC_020965	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478457661
20	NC_020965	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020965	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478457662
22	NC_020965	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478457662
23	NC_020965	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478457663
24	NC_020965	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478457663
25	NC_020965	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478457663
26	NC_020965	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020965	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020965	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478457664
29	NC_020965	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478457665
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32	NC_020965	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478457666
33	NC_020965	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478457666
34	NC_020965	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020965	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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40	NC_020965	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478457668
41	NC_020965	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478457668
42	NC_020965	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478457668
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47	NC_020965	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_020965	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_020965	AG	3	6	47071	47076	50 %	0 %	50 %	0 %	478457692
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