MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020965	AG	3	6	135642	135647	50 %	0 %	50 %	0 %	478457764
3003	NC_020965	TGG	2	6	135689	135694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457764
3004	NC_020965	GTT	2	6	135733	135738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457764
3005	NC_020965	TTG	2	6	135745	135750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457764
3006	NC_020965	CTGTTT	2	12	135773	135784	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478457764
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3009	NC_020965	GGA	2	6	135841	135846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457764
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3014	NC_020965	AGG	2	6	136078	136083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_020965	AAC	2	6	136171	136176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457765
3016	NC_020965	GTT	2	6	136214	136219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457765
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3018	NC_020965	ATTGG	2	10	136289	136298	20 %	40 %	40 %	0 %	478457765
3019	NC_020965	ATTGT	2	10	136322	136331	20 %	60 %	20 %	0 %	478457765
3020	NC_020965	TGG	2	6	136371	136376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457765
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3022	NC_020965	GCTA	2	8	136586	136593	25 %	25 %	25 %	25 %	478457766
3023	NC_020965	CGC	2	6	136619	136624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478457766
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3025	NC_020965	TG	3	6	136671	136676	0 %	50 %	50 %	0 %	478457766
3026	NC_020965	TAG	2	6	136708	136713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457766
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3029	NC_020965	TGTTT	2	10	136748	136757	0 %	80 %	20 %	0 %	478457766
3030	NC_020965	GCT	2	6	136761	136766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457766
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3039	NC_020965	CTG	2	6	137090	137095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457767
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3054	NC_020965	T	9	9	137442	137450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_020965	TTGCA	2	10	137537	137546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3110	NC_020965	TCCAG	2	10	140493	140502	20 %	20 %	20 %	40 %	478457772
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3113	NC_020965	ATT	2	6	140587	140592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457773
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3122	NC_020965	AGA	2	6	141255	141260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457773
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3499	NC_020965	A	6	6	158365	158370	100 %	0 %	0 %	0 %	478457789
3500	NC_020965	T	6	6	158444	158449	0 %	100 %	0 %	0 %	478457789

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