MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020964	AAAAG	2	10	69572	69581	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020964	A	6	6	69673	69678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020964	AAG	2	6	69689	69694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020964	TTC	2	6	69748	69753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020964	CTT	3	9	69757	69765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020964	AT	3	6	69770	69775	50 %	50 %	0 %	0 %	478473928
1508	NC_020964	TTCG	2	8	69790	69797	0 %	50 %	25 %	25 %	478473928
1509	NC_020964	TGT	2	6	69815	69820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473928
1510	NC_020964	TGAT	2	8	69907	69914	25 %	50 %	25 %	0 %	478473928
1511	NC_020964	T	6	6	69955	69960	0 %	100 %	0 %	0 %	478473928
1512	NC_020964	TCT	2	6	70071	70076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473928
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1514	NC_020964	TGC	2	6	70277	70282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473928
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1516	NC_020964	CT	3	6	70322	70327	0 %	50 %	0 %	50 %	478473928
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1519	NC_020964	GTT	2	6	70406	70411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473928
1520	NC_020964	GCT	2	6	70428	70433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473928
1521	NC_020964	GCA	3	9	70530	70538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473928
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1523	NC_020964	GCA	2	6	70577	70582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473928
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1535	NC_020964	TGA	2	6	71018	71023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473928
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1540	NC_020964	CT	3	6	71288	71293	0 %	50 %	0 %	50 %	478473928
1541	NC_020964	GA	3	6	71309	71314	50 %	0 %	50 %	0 %	478473928
1542	NC_020964	AGT	2	6	71351	71356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473928
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1544	NC_020964	AAGAA	2	10	71426	71435	80 %	0 %	20 %	0 %	478473928
1545	NC_020964	AGA	2	6	71498	71503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473928
1546	NC_020964	TGA	2	6	71534	71539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473928
1547	NC_020964	TAT	2	6	71545	71550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473928
1548	NC_020964	T	6	6	71634	71639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020964	T	8	8	71655	71662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020964	CAT	2	6	71720	71725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473929
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1552	NC_020964	GCTT	2	8	71779	71786	0 %	50 %	25 %	25 %	478473929
1553	NC_020964	A	6	6	71874	71879	100 %	0 %	0 %	0 %	478473929
1554	NC_020964	ATT	2	6	71924	71929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473929
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1557	NC_020964	TTCT	2	8	72117	72124	0 %	75 %	0 %	25 %	478473929
1558	NC_020964	ATG	2	6	72129	72134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473929
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1561	NC_020964	GAGC	2	8	72191	72198	25 %	0 %	50 %	25 %	478473929
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1567	NC_020964	AGA	2	6	72436	72441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1570	NC_020964	CTTGC	2	10	72515	72524	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1571	NC_020964	GATA	2	8	72539	72546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_020964	GA	3	6	73973	73978	50 %	0 %	50 %	0 %	478473931
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1615	NC_020964	A	6	6	74182	74187	100 %	0 %	0 %	0 %	478473931
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