MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 plasmid pSotonD5

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020958	ATTG	2	8	631	638	25 %	50 %	25 %	0 %	478455824
2	NC_020958	TCTG	2	8	1469	1476	0 %	50 %	25 %	25 %	478455825
3	NC_020958	GAAA	2	8	1495	1502	75 %	0 %	25 %	0 %	478455825
4	NC_020958	AGGA	2	8	1628	1635	50 %	0 %	50 %	0 %	478455825
5	NC_020958	TGTT	2	8	1961	1968	0 %	75 %	25 %	0 %	478455825
6	NC_020958	TTCT	2	8	2807	2814	0 %	75 %	0 %	25 %	478455826
7	NC_020958	GTTT	2	8	3333	3340	0 %	75 %	25 %	0 %	478455826
8	NC_020958	AGGA	2	8	3453	3460	50 %	0 %	50 %	0 %	478455826
9	NC_020958	TTTC	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	478455827
10	NC_020958	GGAT	2	8	3833	3840	25 %	25 %	50 %	0 %	478455827
11	NC_020958	TAAA	2	8	4557	4564	75 %	25 %	0 %	0 %	478455827
12	NC_020958	ATTA	2	8	4619	4626	50 %	50 %	0 %	0 %	478455827
13	NC_020958	ATTT	2	8	4653	4660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020958	CAAA	2	8	5469	5476	75 %	0 %	0 %	25 %	478455828
15	NC_020958	ATCA	2	8	6101	6108	50 %	25 %	0 %	25 %	478455830
16	NC_020958	AATT	2	8	6316	6323	50 %	50 %	0 %	0 %	478455830
17	NC_020958	TCGG	2	8	6387	6394	0 %	25 %	50 %	25 %	478455830
18	NC_020958	CTTC	2	8	6758	6765	0 %	50 %	0 %	50 %	478455831
19	NC_020958	AGTT	2	8	7017	7024	25 %	50 %	25 %	0 %	478455831
20	NC_020958	CCAA	2	8	7086	7093	50 %	0 %	0 %	50 %	478455831
21	NC_020958	CTTC	2	8	7241	7248	0 %	50 %	0 %	50 %	478455831
22	NC_020958	GATA	2	8	7276	7283	50 %	25 %	25 %	0 %	478455831
23	NC_020958	TTTA	2	8	7462	7469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.