MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN plasmid pL3404

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020957	T	6	6	437	442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020957	T	8	8	495	502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020957	T	7	7	608	614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020957	A	7	7	641	647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020957	A	6	6	1032	1037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020957	T	8	8	1527	1534	0 %	100 %	0 %	0 %	478463056
7	NC_020957	A	6	6	1603	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	478463056
8	NC_020957	T	6	6	1753	1758	0 %	100 %	0 %	0 %	478463056
9	NC_020957	A	6	6	1847	1852	100 %	0 %	0 %	0 %	478463056
10	NC_020957	T	7	7	2124	2130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020957	A	8	8	2687	2694	100 %	0 %	0 %	0 %	478463057
12	NC_020957	A	6	6	3480	3485	100 %	0 %	0 %	0 %	478463057
13	NC_020957	A	7	7	4349	4355	100 %	0 %	0 %	0 %	478463058
14	NC_020957	A	6	6	4454	4459	100 %	0 %	0 %	0 %	478463058
15	NC_020957	A	6	6	4598	4603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020957	T	6	6	5375	5380	0 %	100 %	0 %	0 %	478463059
17	NC_020957	A	6	6	5451	5456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020957	A	6	6	5532	5537	100 %	0 %	0 %	0 %	478463060
19	NC_020957	A	6	6	5726	5731	100 %	0 %	0 %	0 %	478463060
20	NC_020957	T	6	6	5827	5832	0 %	100 %	0 %	0 %	478463061
21	NC_020957	A	6	6	5907	5912	100 %	0 %	0 %	0 %	478463061
22	NC_020957	A	7	7	6044	6050	100 %	0 %	0 %	0 %	478463061
23	NC_020957	T	6	6	6430	6435	0 %	100 %	0 %	0 %	478463061
24	NC_020957	A	7	7	6616	6622	100 %	0 %	0 %	0 %	478463062
25	NC_020957	T	6	6	6635	6640	0 %	100 %	0 %	0 %	478463062
26	NC_020957	A	8	8	6641	6648	100 %	0 %	0 %	0 %	478463062
27	NC_020957	A	6	6	6870	6875	100 %	0 %	0 %	0 %	478463062

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.