MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 23070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2625	NC_020944	CTT	2	6	119031	119036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_020944	TTA	2	6	119053	119058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465863
2627	NC_020944	T	6	6	119158	119163	0 %	100 %	0 %	0 %	478465863
2628	NC_020944	TTC	2	6	119244	119249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465863
2629	NC_020944	TCC	2	6	119257	119262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465863
2630	NC_020944	TTTA	2	8	119275	119282	25 %	75 %	0 %	0 %	478465863
2631	NC_020944	CTG	2	6	119473	119478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465863
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2633	NC_020944	TTGCCA	2	12	119525	119536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478465863
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2635	NC_020944	GAA	2	6	119562	119567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465863
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2637	NC_020944	TACT	2	8	119663	119670	25 %	50 %	0 %	25 %	478465863
2638	NC_020944	GTT	2	6	119707	119712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465863
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2643	NC_020944	AG	3	6	119983	119988	50 %	0 %	50 %	0 %	478465864
2644	NC_020944	GCTA	2	8	120005	120012	25 %	25 %	25 %	25 %	478465864
2645	NC_020944	GA	3	6	120016	120021	50 %	0 %	50 %	0 %	478465864
2646	NC_020944	AAG	2	6	120024	120029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465864
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2651	NC_020944	GCTA	2	8	120137	120144	25 %	25 %	25 %	25 %	478465864
2652	NC_020944	CGGC	2	8	120186	120193	0 %	0 %	50 %	50 %	478465864
2653	NC_020944	AGC	2	6	120227	120232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465864
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2655	NC_020944	TCC	2	6	120248	120253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465864
2656	NC_020944	AG	3	6	120294	120299	50 %	0 %	50 %	0 %	478465864
2657	NC_020944	GA	4	8	120337	120344	50 %	0 %	50 %	0 %	478465864
2658	NC_020944	GGC	2	6	120377	120382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478465864
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2664	NC_020944	GA	3	6	120845	120850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_020944	TAT	2	6	120869	120874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2666	NC_020944	ATA	2	6	120890	120895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_020944	CTGG	2	8	120913	120920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2668	NC_020944	TAAAAA	2	12	121017	121028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2669	NC_020944	TTGGTA	2	12	121065	121076	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478465865
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2708	NC_020944	TTCC	2	8	123036	123043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2709	NC_020944	TA	3	6	123079	123084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2710	NC_020944	T	6	6	123125	123130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2711	NC_020944	ACT	2	6	123180	123185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2712	NC_020944	AAGGGT	2	12	123251	123262	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478465867
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2715	NC_020944	AGCT	2	8	123326	123333	25 %	25 %	25 %	25 %	478465867
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2720	NC_020944	TAA	2	6	123680	123685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465867
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2726	NC_020944	GT	3	6	124069	124074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2727	NC_020944	T	6	6	124113	124118	0 %	100 %	0 %	0 %	478465868
2728	NC_020944	GA	3	6	124191	124196	50 %	0 %	50 %	0 %	478465868
2729	NC_020944	GGGTTT	2	12	124214	124225	0 %	50 %	50 %	0 %	478465868
2730	NC_020944	CAA	2	6	124240	124245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465868
2731	NC_020944	GTG	2	6	124258	124263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465868
2732	NC_020944	T	6	6	124272	124277	0 %	100 %	0 %	0 %	478465868
2733	NC_020944	TGGA	2	8	124282	124289	25 %	25 %	50 %	0 %	478465868
2734	NC_020944	GCAA	2	8	124317	124324	50 %	0 %	25 %	25 %	478465868
2735	NC_020944	TTA	2	6	124362	124367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465868
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2739	NC_020944	TTGCAT	2	12	124496	124507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478465868
2740	NC_020944	A	7	7	124514	124520	100 %	0 %	0 %	0 %	478465868
2741	NC_020944	CTG	2	6	124523	124528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465868
2742	NC_020944	TGA	2	6	124550	124555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465868
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2744	NC_020944	ATCG	2	8	124582	124589	25 %	25 %	25 %	25 %	478465868
2745	NC_020944	AG	3	6	124603	124608	50 %	0 %	50 %	0 %	478465868
2746	NC_020944	AGC	2	6	124791	124796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465868
2747	NC_020944	TGT	2	6	124818	124823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465868
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2997	NC_020944	GGATA	2	10	135573	135582	40 %	20 %	40 %	0 %	478465876
2998	NC_020944	AG	3	6	135591	135596	50 %	0 %	50 %	0 %	478465876
2999	NC_020944	TGG	2	6	135638	135643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465876
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