MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 23070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020944	TATCT	2	10	226472	226481	20 %	60 %	0 %	20 %	478465965
5002	NC_020944	TAT	2	6	226549	226554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465965
5003	NC_020944	TGC	2	6	226555	226560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465965
5004	NC_020944	A	7	7	226652	226658	100 %	0 %	0 %	0 %	478465965
5005	NC_020944	TTTTC	2	10	226674	226683	0 %	80 %	0 %	20 %	478465965
5006	NC_020944	TC	3	6	226788	226793	0 %	50 %	0 %	50 %	478465965
5007	NC_020944	CATT	2	8	226836	226843	25 %	50 %	0 %	25 %	478465965
5008	NC_020944	A	7	7	226879	226885	100 %	0 %	0 %	0 %	478465965
5009	NC_020944	TTA	2	6	226895	226900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465965
5010	NC_020944	TAA	2	6	226935	226940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465965
5011	NC_020944	AAC	2	6	226996	227001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465965
5012	NC_020944	TTG	2	6	227149	227154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465965
5013	NC_020944	ATA	2	6	227218	227223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465965
5014	NC_020944	TAA	2	6	227227	227232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_020944	AAAC	2	8	227243	227250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_020944	ACAA	2	8	227295	227302	75 %	0 %	0 %	25 %	478465966
5017	NC_020944	TTC	2	6	227356	227361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465966
5018	NC_020944	CT	3	6	227490	227495	0 %	50 %	0 %	50 %	478465966
5019	NC_020944	ATT	2	6	227520	227525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465966
5020	NC_020944	ACT	2	6	227540	227545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465966
5021	NC_020944	A	7	7	227573	227579	100 %	0 %	0 %	0 %	478465966
5022	NC_020944	ATT	2	6	227640	227645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465966
5023	NC_020944	TTA	2	6	227649	227654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465966
5024	NC_020944	CTGG	2	8	227704	227711	0 %	25 %	50 %	25 %	478465966
5025	NC_020944	TAT	2	6	227726	227731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465966
5026	NC_020944	TGT	2	6	227770	227775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465966
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5030	NC_020944	CATT	2	8	227966	227973	25 %	50 %	0 %	25 %	478465966
5031	NC_020944	CTT	2	6	227996	228001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465966
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5033	NC_020944	TTA	2	6	228103	228108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465967
5034	NC_020944	GTC	2	6	228124	228129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465967
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5037	NC_020944	GAA	2	6	228354	228359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465967
5038	NC_020944	AGA	2	6	228462	228467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465967
5039	NC_020944	ATTGCT	2	12	228580	228591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478465967
5040	NC_020944	ATT	2	6	228613	228618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465967
5041	NC_020944	CTA	2	6	228709	228714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465967
5042	NC_020944	TCA	2	6	228716	228721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465967
5043	NC_020944	TG	3	6	228749	228754	0 %	50 %	50 %	0 %	478465967
5044	NC_020944	TCCTAG	2	12	228870	228881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478465967
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5047	NC_020944	GAG	2	6	229024	229029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465968
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5049	NC_020944	TCGA	2	8	229119	229126	25 %	25 %	25 %	25 %	478465968
5050	NC_020944	TCC	2	6	229136	229141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465968
5051	NC_020944	GAT	2	6	229169	229174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465968
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5053	NC_020944	CAT	2	6	229244	229249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465968
5054	NC_020944	G	6	6	229250	229255	0 %	0 %	100 %	0 %	478465968
5055	NC_020944	AAG	2	6	229276	229281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465968
5056	NC_020944	TAA	2	6	229340	229345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465968
5057	NC_020944	GCAACG	2	12	229358	229369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465968
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5059	NC_020944	AATT	2	8	229405	229412	50 %	50 %	0 %	0 %	478465968
5060	NC_020944	ATTT	2	8	229468	229475	25 %	75 %	0 %	0 %	478465968
5061	NC_020944	T	6	6	229505	229510	0 %	100 %	0 %	0 %	478465968
5062	NC_020944	TCA	2	6	229513	229518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465968
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5066	NC_020944	T	8	8	229718	229725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_020944	TCCT	2	8	229868	229875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_020944	AGA	2	6	229920	229925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_020944	ATT	2	6	229957	229962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_020944	TTC	2	6	230041	230046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465969
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5076	NC_020944	TGA	2	6	230321	230326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465969
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5082	NC_020944	GATA	2	8	230585	230592	50 %	25 %	25 %	0 %	478465969
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5088	NC_020944	TAC	2	6	230893	230898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465970
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5090	NC_020944	TCT	2	6	230962	230967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465970
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5092	NC_020944	CTT	2	6	231100	231105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465970
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5096	NC_020944	TAT	2	6	231367	231372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465970
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5102	NC_020944	TTCT	2	8	231714	231721	0 %	75 %	0 %	25 %	478465970
5103	NC_020944	ACT	2	6	231725	231730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465970
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5106	NC_020944	TTAT	2	8	231876	231883	25 %	75 %	0 %	0 %	478465970
5107	NC_020944	CTAT	2	8	231895	231902	25 %	50 %	0 %	25 %	478465970
5108	NC_020944	TCTT	2	8	231942	231949	0 %	75 %	0 %	25 %	478465970
5109	NC_020944	TGC	2	6	231985	231990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465970
5110	NC_020944	CTTAGC	2	12	231991	232002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478465970
5111	NC_020944	GGA	2	6	232022	232027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465970
5112	NC_020944	CA	3	6	232030	232035	50 %	0 %	0 %	50 %	478465970
5113	NC_020944	TGG	2	6	232094	232099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465970
5114	NC_020944	TTGG	2	8	232138	232145	0 %	50 %	50 %	0 %	478465970
5115	NC_020944	TGG	3	9	232157	232165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465970
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5119	NC_020944	CTT	2	6	232317	232322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465971
5120	NC_020944	CTA	2	6	232376	232381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465971
5121	NC_020944	ATTT	2	8	232385	232392	25 %	75 %	0 %	0 %	478465971
5122	NC_020944	TGG	2	6	232463	232468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465971
5123	NC_020944	AAT	3	9	232563	232571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465971
5124	NC_020944	GAA	2	6	232662	232667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465971
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5162	NC_020944	TCA	2	6	234634	234639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465972
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5233	NC_020944	CTT	3	9	237994	238002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465975
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5235	NC_020944	CTGT	2	8	238069	238076	0 %	50 %	25 %	25 %	478465975
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5239	NC_020944	AT	5	10	238628	238637	50 %	50 %	0 %	0 %	478465975
5240	NC_020944	TTGA	2	8	238679	238686	25 %	50 %	25 %	0 %	478465975
5241	NC_020944	CTT	2	6	238691	238696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465975
5242	NC_020944	AAGT	2	8	238760	238767	50 %	25 %	25 %	0 %	478465975
5243	NC_020944	TTCCTT	2	12	238823	238834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465975
5244	NC_020944	GAC	2	6	239062	239067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465975
5245	NC_020944	C	6	6	239104	239109	0 %	0 %	0 %	100 %	478465975
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5497	NC_020944	GCA	2	6	250570	250575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465985
5498	NC_020944	AAG	2	6	250619	250624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465985
5499	NC_020944	TAGC	2	8	250691	250698	25 %	25 %	25 %	25 %	478465985
5500	NC_020944	CTT	2	6	250711	250716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465985

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