MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 complete genome

Total Repeats: 22939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020943	T	7	7	159119	159125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_020943	ATT	2	6	159238	159243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020943	T	7	7	159268	159274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020943	A	7	7	159302	159308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020943	TAAT	2	8	159326	159333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_020943	ATT	2	6	159393	159398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455072
3507	NC_020943	CAT	2	6	159545	159550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455072
3508	NC_020943	TCAA	2	8	159606	159613	50 %	25 %	0 %	25 %	478455072
3509	NC_020943	TGA	2	6	159803	159808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455072
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3511	NC_020943	TC	3	6	159866	159871	0 %	50 %	0 %	50 %	478455072
3512	NC_020943	GT	3	6	159904	159909	0 %	50 %	50 %	0 %	478455072
3513	NC_020943	AAT	2	6	159948	159953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455072
3514	NC_020943	GGA	2	6	159960	159965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455072
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3522	NC_020943	GAA	2	6	160236	160241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455073
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3542	NC_020943	A	6	6	161666	161671	100 %	0 %	0 %	0 %	478455074
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3549	NC_020943	TCT	2	6	161889	161894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455074
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3553	NC_020943	CAAAA	2	10	161992	162001	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3554	NC_020943	TGT	2	6	162014	162019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_020943	GAG	2	6	162113	162118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3998	NC_020943	TTGAG	2	10	182736	182745	20 %	40 %	40 %	0 %	478455087
3999	NC_020943	GAATG	2	10	182761	182770	40 %	20 %	40 %	0 %	478455087
4000	NC_020943	CT	3	6	182811	182816	0 %	50 %	0 %	50 %	478455087

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