MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 complete genome

Total Repeats: 22939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020943	GCTA	2	8	136324	136331	25 %	25 %	25 %	25 %	478455047
3003	NC_020943	CGC	2	6	136357	136362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478455047
3004	NC_020943	TG	3	6	136383	136388	0 %	50 %	50 %	0 %	478455047
3005	NC_020943	TG	3	6	136409	136414	0 %	50 %	50 %	0 %	478455047
3006	NC_020943	TAG	2	6	136446	136451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455047
3007	NC_020943	ACA	2	6	136454	136459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455047
3008	NC_020943	CTT	2	6	136468	136473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455047
3009	NC_020943	TGTTT	2	10	136486	136495	0 %	80 %	20 %	0 %	478455047
3010	NC_020943	GCT	2	6	136499	136504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455047
3011	NC_020943	GGAT	2	8	136514	136521	25 %	25 %	50 %	0 %	478455047
3012	NC_020943	CTG	2	6	136635	136640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455048
3013	NC_020943	CAAT	2	8	136663	136670	50 %	25 %	0 %	25 %	478455048
3014	NC_020943	AAGC	2	8	136717	136724	50 %	0 %	25 %	25 %	478455048
3015	NC_020943	TTTG	2	8	136743	136750	0 %	75 %	25 %	0 %	478455048
3016	NC_020943	GCG	2	6	136786	136791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478455048
3017	NC_020943	CTG	3	9	136808	136816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455048
3018	NC_020943	TTC	2	6	136817	136822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455048
3019	NC_020943	CTG	2	6	136828	136833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455048
3020	NC_020943	AAC	2	6	136839	136844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455048
3021	NC_020943	TTTG	2	8	136858	136865	0 %	75 %	25 %	0 %	478455048
3022	NC_020943	CAG	2	6	136895	136900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455048
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3024	NC_020943	GCT	2	6	136945	136950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455048
3025	NC_020943	CAG	2	6	136963	136968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455048
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3029	NC_020943	GAT	2	6	137086	137091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455048
3030	NC_020943	ATAA	2	8	137092	137099	75 %	25 %	0 %	0 %	478455048
3031	NC_020943	ACA	2	6	137102	137107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455048
3032	NC_020943	AGG	2	6	137163	137168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_020943	CCT	2	6	137173	137178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_020943	T	9	9	137180	137188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_020943	TTGCA	2	10	137275	137284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3036	NC_020943	GAG	2	6	137339	137344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455049
3037	NC_020943	TC	3	6	137349	137354	0 %	50 %	0 %	50 %	478455049
3038	NC_020943	CT	3	6	137378	137383	0 %	50 %	0 %	50 %	478455049
3039	NC_020943	TTC	2	6	137476	137481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455049
3040	NC_020943	CTT	2	6	137526	137531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455049
3041	NC_020943	CT	3	6	137560	137565	0 %	50 %	0 %	50 %	478455049
3042	NC_020943	A	6	6	137610	137615	100 %	0 %	0 %	0 %	478455049
3043	NC_020943	TCT	2	6	137627	137632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455049
3044	NC_020943	CAG	2	6	137721	137726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455049
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3047	NC_020943	TTCT	2	8	137773	137780	0 %	75 %	0 %	25 %	478455049
3048	NC_020943	AATT	2	8	137799	137806	50 %	50 %	0 %	0 %	478455049
3049	NC_020943	AAG	2	6	137911	137916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455049
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3052	NC_020943	AAG	2	6	138039	138044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455049
3053	NC_020943	TTG	2	6	138229	138234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455050
3054	NC_020943	ATGT	2	8	138379	138386	25 %	50 %	25 %	0 %	478455050
3055	NC_020943	AGG	2	6	138396	138401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455050
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3057	NC_020943	CTT	2	6	138452	138457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_020943	GA	3	6	138526	138531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_020943	A	6	6	138542	138547	100 %	0 %	0 %	0 %	478455051
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3062	NC_020943	ATGG	2	8	138656	138663	25 %	25 %	50 %	0 %	478455051
3063	NC_020943	GTT	2	6	138698	138703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455051
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3067	NC_020943	GAAG	2	8	139052	139059	50 %	0 %	50 %	0 %	478455051
3068	NC_020943	TTGA	2	8	139064	139071	25 %	50 %	25 %	0 %	478455051
3069	NC_020943	GGT	2	6	139079	139084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455051
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3071	NC_020943	T	7	7	139150	139156	0 %	100 %	0 %	0 %	478455051
3072	NC_020943	GAAA	2	8	139177	139184	75 %	0 %	25 %	0 %	478455051
3073	NC_020943	GAA	2	6	139205	139210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455051
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3081	NC_020943	TTA	2	6	139723	139728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455052
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3092	NC_020943	ATTG	2	8	140291	140298	25 %	50 %	25 %	0 %	478455054
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3098	NC_020943	GCT	2	6	140478	140483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455054
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3101	NC_020943	GTACA	2	10	140962	140971	40 %	20 %	20 %	20 %	478455054
3102	NC_020943	AGA	2	6	140993	140998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455054
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3104	NC_020943	TAA	2	6	141311	141316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455054
3105	NC_020943	TAGAT	2	10	141335	141344	40 %	40 %	20 %	0 %	478455054
3106	NC_020943	TAT	2	6	141345	141350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455054
3107	NC_020943	CTCC	2	8	141351	141358	0 %	25 %	0 %	75 %	478455054
3108	NC_020943	CTG	2	6	141367	141372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455054
3109	NC_020943	CCT	2	6	141411	141416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455054
3110	NC_020943	TAT	2	6	141417	141422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455054
3111	NC_020943	TGG	2	6	141512	141517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455054
3112	NC_020943	TCA	2	6	141539	141544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455054
3113	NC_020943	TCT	2	6	141569	141574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455054
3114	NC_020943	ATTA	2	8	141588	141595	50 %	50 %	0 %	0 %	478455054
3115	NC_020943	T	8	8	141657	141664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_020943	T	6	6	141702	141707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_020943	AAG	2	6	141711	141716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_020943	AAAAG	2	10	141747	141756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_020943	T	6	6	141771	141776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_020943	GCT	2	6	141807	141812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_020943	A	6	6	141823	141828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_020943	ATC	2	6	141831	141836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_020943	A	6	6	141880	141885	100 %	0 %	0 %	0 %	478455055
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3125	NC_020943	AAAAC	2	10	142227	142236	80 %	0 %	0 %	20 %	478455055
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3373	NC_020943	TTG	2	6	153156	153161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455065
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