MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD5 complete genome

Total Repeats: 22939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020943	CTG	3	9	274224	274232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455174
6003	NC_020943	GCA	2	6	274254	274259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455174
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6005	NC_020943	TG	3	6	274315	274320	0 %	50 %	50 %	0 %	478455174
6006	NC_020943	TGG	2	6	274352	274357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455174
6007	NC_020943	GCA	2	6	274380	274385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455174
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6011	NC_020943	ATGG	2	8	274525	274532	25 %	25 %	50 %	0 %	478455174
6012	NC_020943	TCTT	2	8	274604	274611	0 %	75 %	0 %	25 %	478455174
6013	NC_020943	ATTT	2	8	274633	274640	25 %	75 %	0 %	0 %	478455174
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6017	NC_020943	TCT	2	6	274784	274789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455174
6018	NC_020943	ATCCT	2	10	274798	274807	20 %	40 %	0 %	40 %	478455174
6019	NC_020943	GAT	2	6	274851	274856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455174
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6021	NC_020943	TGA	2	6	275010	275015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455175
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6024	NC_020943	TGGAAT	2	12	275160	275171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455175
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6030	NC_020943	TAT	2	6	275272	275277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455175
6031	NC_020943	GCT	2	6	275329	275334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455175
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6042	NC_020943	TTGTC	2	10	275736	275745	0 %	60 %	20 %	20 %	478455175
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6071	NC_020943	ATTGT	2	10	276726	276735	20 %	60 %	20 %	0 %	478455176
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6121	NC_020943	TCT	2	6	279246	279251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455177
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6123	NC_020943	CAT	2	6	279369	279374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455177
6124	NC_020943	CTT	2	6	279423	279428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455177
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6229	NC_020943	A	7	7	284149	284155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6231	NC_020943	C	6	6	284310	284315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6232	NC_020943	AT	4	8	284369	284376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_020943	CAT	2	6	284389	284394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455181
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6235	NC_020943	ATC	2	6	284437	284442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455181
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6241	NC_020943	CCT	2	6	284908	284913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455181
6242	NC_020943	CTCC	2	8	284956	284963	0 %	25 %	0 %	75 %	478455181
6243	NC_020943	AAGC	2	8	284978	284985	50 %	0 %	25 %	25 %	478455181
6244	NC_020943	ATG	2	6	284995	285000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455181
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6496	NC_020943	GCA	2	6	295911	295916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455193
6497	NC_020943	TCA	2	6	295941	295946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455193
6498	NC_020943	TACT	2	8	295959	295966	25 %	50 %	0 %	25 %	478455193
6499	NC_020943	CTTT	2	8	296083	296090	0 %	75 %	0 %	25 %	478455193
6500	NC_020943	AAAATA	2	12	296109	296120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478455193

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