MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020942	TGA	2	6	183091	183096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455997
4003	NC_020942	GA	4	8	183119	183126	50 %	0 %	50 %	0 %	478455997
4004	NC_020942	AAC	2	6	183174	183179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455997
4005	NC_020942	TGA	2	6	183193	183198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455997
4006	NC_020942	TGC	2	6	183229	183234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455997
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4010	NC_020942	GAT	2	6	183297	183302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455997
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4012	NC_020942	GCG	2	6	183331	183336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478455997
4013	NC_020942	ACT	2	6	183379	183384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455997
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4021	NC_020942	GA	3	6	183637	183642	50 %	0 %	50 %	0 %	478455998
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4104	NC_020942	TAG	2	6	187828	187833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456001
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4107	NC_020942	TTA	2	6	187901	187906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456001
4108	NC_020942	ATC	2	6	187908	187913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_020942	CGATA	2	10	187936	187945	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4110	NC_020942	T	6	6	187949	187954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_020942	TCC	2	6	187969	187974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_020942	ACA	3	9	187975	187983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_020942	AGT	2	6	187993	187998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4117	NC_020942	AGT	2	6	188175	188180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_020942	TAT	2	6	188263	188268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020942	T	6	6	188282	188287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020942	GCA	2	6	188335	188340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_020942	CTT	2	6	188350	188355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_020942	GGAC	2	8	188377	188384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_020942	AAG	2	6	188487	188492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4126	NC_020942	CAT	2	6	188519	188524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4246	NC_020942	AGC	2	6	193514	193519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_020942	GCG	2	6	193792	193797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478456006
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4249	NC_020942	TGA	2	6	193860	193865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456006
4250	NC_020942	TCA	2	6	193962	193967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456006
4251	NC_020942	CGA	2	6	194079	194084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456006
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4253	NC_020942	AAG	2	6	194149	194154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456006
4254	NC_020942	TGA	2	6	194163	194168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456006
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4257	NC_020942	TGA	2	6	194412	194417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456006
4258	NC_020942	A	6	6	194444	194449	100 %	0 %	0 %	0 %	478456006
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4261	NC_020942	GCT	2	6	194548	194553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456006
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4264	NC_020942	CAG	2	6	194816	194821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_020942	AGCTT	2	10	194890	194899	20 %	40 %	20 %	20 %	478456007
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4274	NC_020942	TA	3	6	195470	195475	50 %	50 %	0 %	0 %	478456008
4275	NC_020942	TC	3	6	195489	195494	0 %	50 %	0 %	50 %	478456008
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4282	NC_020942	CCATG	2	10	195832	195841	20 %	20 %	20 %	40 %	478456009
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4288	NC_020942	TAT	2	6	196109	196114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456009
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4323	NC_020942	TTA	2	6	197921	197926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456011
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4330	NC_020942	ATTTGC	2	12	198349	198360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478456011
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4340	NC_020942	TGT	2	6	198765	198770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4341	NC_020942	CTGG	2	8	198819	198826	0 %	25 %	50 %	25 %	478456013
4342	NC_020942	AAAAG	2	10	198859	198868	80 %	0 %	20 %	0 %	478456013
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4346	NC_020942	AG	3	6	198974	198979	50 %	0 %	50 %	0 %	478456013
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4349	NC_020942	GTT	2	6	199133	199138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4350	NC_020942	GCA	2	6	199186	199191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4351	NC_020942	CTTT	2	8	199266	199273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4352	NC_020942	AAG	2	6	199313	199318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_020942	T	6	6	199363	199368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4354	NC_020942	ATT	2	6	199376	199381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4355	NC_020942	T	6	6	199392	199397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4356	NC_020942	AAACAT	2	12	199439	199450	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478456014
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4358	NC_020942	GAA	2	6	199475	199480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456014
4359	NC_020942	T	6	6	199540	199545	0 %	100 %	0 %	0 %	478456014
4360	NC_020942	CTC	2	6	199590	199595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456014
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4362	NC_020942	TGCT	2	8	199710	199717	0 %	50 %	25 %	25 %	478456014
4363	NC_020942	ACA	2	6	199762	199767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456014
4364	NC_020942	AGCAAC	2	12	199774	199785	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478456014
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4367	NC_020942	T	6	6	200030	200035	0 %	100 %	0 %	0 %	478456014
4368	NC_020942	CAT	2	6	200147	200152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456014
4369	NC_020942	AATT	2	8	200175	200182	50 %	50 %	0 %	0 %	478456014
4370	NC_020942	GGA	2	6	200195	200200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456014
4371	NC_020942	TTC	2	6	200209	200214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456014
4372	NC_020942	GCA	2	6	200225	200230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456014
4373	NC_020942	TCT	2	6	200278	200283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456014
4374	NC_020942	ACTC	2	8	200312	200319	25 %	25 %	0 %	50 %	478456014
4375	NC_020942	GATTA	2	10	200331	200340	40 %	40 %	20 %	0 %	478456014
4376	NC_020942	TTC	2	6	200341	200346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456014
4377	NC_020942	T	6	6	200428	200433	0 %	100 %	0 %	0 %	478456014
4378	NC_020942	ATT	2	6	200456	200461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456014
4379	NC_020942	TCT	2	6	200569	200574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456014
4380	NC_020942	ATC	2	6	200579	200584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456014
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4382	NC_020942	GGC	2	6	200693	200698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478456015
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4385	NC_020942	TA	3	6	200884	200889	50 %	50 %	0 %	0 %	478456015
4386	NC_020942	CTA	2	6	200891	200896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456015
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4389	NC_020942	TAT	2	6	201120	201125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456015
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4393	NC_020942	A	6	6	201234	201239	100 %	0 %	0 %	0 %	478456015
4394	NC_020942	ATT	2	6	201259	201264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456015
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4398	NC_020942	TATGAA	2	12	201368	201379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_020942	AGA	2	6	201424	201429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_020942	AAC	2	6	201431	201436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4401	NC_020942	ATA	2	6	201451	201456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_020942	T	7	7	201476	201482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_020942	TGA	2	6	201586	201591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4410	NC_020942	AT	3	6	201927	201932	50 %	50 %	0 %	0 %	478456016
4411	NC_020942	ATT	2	6	201934	201939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456016
4412	NC_020942	GTT	2	6	201998	202003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456016
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4414	NC_020942	ATTC	2	8	202099	202106	25 %	50 %	0 %	25 %	478456016
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4431	NC_020942	TC	3	6	202902	202907	0 %	50 %	0 %	50 %	478456018
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4442	NC_020942	A	7	7	203506	203512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4443	NC_020942	AG	3	6	203528	203533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_020942	AAT	2	6	203538	203543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_020942	T	9	9	203558	203566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4446	NC_020942	T	6	6	203605	203610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4447	NC_020942	TAC	2	6	203649	203654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4448	NC_020942	ATT	2	6	203658	203663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4452	NC_020942	CT	3	6	203865	203870	0 %	50 %	0 %	50 %	478456019
4453	NC_020942	AAG	2	6	203892	203897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456019
4454	NC_020942	AGCT	2	8	203907	203914	25 %	25 %	25 %	25 %	478456019
4455	NC_020942	ATC	2	6	203928	203933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456019
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4473	NC_020942	CAAT	2	8	204624	204631	50 %	25 %	0 %	25 %	478456019
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4484	NC_020942	AAAG	2	8	205145	205152	75 %	0 %	25 %	0 %	478456019
4485	NC_020942	ACC	2	6	205170	205175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478456019
4486	NC_020942	CTCTT	2	10	205222	205231	0 %	60 %	0 %	40 %	478456019
4487	NC_020942	TAT	2	6	205298	205303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456020
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4490	NC_020942	TA	3	6	205506	205511	50 %	50 %	0 %	0 %	478456020
4491	NC_020942	AGA	2	6	205595	205600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456020
4492	NC_020942	TAA	2	6	205628	205633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456020
4493	NC_020942	CAAG	2	8	205667	205674	50 %	0 %	25 %	25 %	478456020
4494	NC_020942	CCT	2	6	205712	205717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456021
4495	NC_020942	CT	3	6	205754	205759	0 %	50 %	0 %	50 %	478456021
4496	NC_020942	TCA	2	6	205765	205770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456021
4497	NC_020942	CCCA	2	8	205827	205834	25 %	0 %	0 %	75 %	478456021
4498	NC_020942	T	7	7	206000	206006	0 %	100 %	0 %	0 %	478456021
4499	NC_020942	AT	3	6	206035	206040	50 %	50 %	0 %	0 %	478456021
4500	NC_020942	TCTGGA	2	12	206044	206055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478456021

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