MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020942	GTT	2	6	136226	136231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455956
3003	NC_020942	ATT	2	6	136238	136243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455956
3004	NC_020942	ATTGG	2	10	136301	136310	20 %	40 %	40 %	0 %	478455956
3005	NC_020942	TAT	2	6	136338	136343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455956
3006	NC_020942	TGG	2	6	136383	136388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455956
3007	NC_020942	CTG	2	6	136434	136439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455956
3008	NC_020942	TCA	2	6	136556	136561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455957
3009	NC_020942	GCTA	2	8	136598	136605	25 %	25 %	25 %	25 %	478455957
3010	NC_020942	CGC	2	6	136631	136636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478455957
3011	NC_020942	TG	3	6	136657	136662	0 %	50 %	50 %	0 %	478455957
3012	NC_020942	TG	3	6	136683	136688	0 %	50 %	50 %	0 %	478455957
3013	NC_020942	TAG	2	6	136720	136725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455957
3014	NC_020942	ACA	2	6	136728	136733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455957
3015	NC_020942	CTT	2	6	136742	136747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455957
3016	NC_020942	TGTTT	2	10	136760	136769	0 %	80 %	20 %	0 %	478455957
3017	NC_020942	GCT	2	6	136773	136778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455957
3018	NC_020942	GGAT	2	8	136788	136795	25 %	25 %	50 %	0 %	478455957
3019	NC_020942	CTG	2	6	136909	136914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455958
3020	NC_020942	CAAT	2	8	136937	136944	50 %	25 %	0 %	25 %	478455958
3021	NC_020942	AAGC	2	8	136991	136998	50 %	0 %	25 %	25 %	478455958
3022	NC_020942	TTTG	2	8	137017	137024	0 %	75 %	25 %	0 %	478455958
3023	NC_020942	GCG	2	6	137060	137065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478455958
3024	NC_020942	TGC	2	6	137083	137088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455958
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3031	NC_020942	GCT	2	6	137219	137224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455958
3032	NC_020942	CAG	2	6	137237	137242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455958
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3036	NC_020942	GAT	2	6	137360	137365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455958
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3038	NC_020942	ACA	2	6	137376	137381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455958
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3040	NC_020942	CCT	2	6	137447	137452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_020942	T	9	9	137454	137462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_020942	TTGCA	2	10	137550	137559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3043	NC_020942	GAG	2	6	137614	137619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455959
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3045	NC_020942	CT	3	6	137653	137658	0 %	50 %	0 %	50 %	478455959
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3049	NC_020942	A	6	6	137885	137890	100 %	0 %	0 %	0 %	478455959
3050	NC_020942	TCT	2	6	137902	137907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455959
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3054	NC_020942	TTCT	2	8	138048	138055	0 %	75 %	0 %	25 %	478455959
3055	NC_020942	AATT	2	8	138074	138081	50 %	50 %	0 %	0 %	478455959
3056	NC_020942	AAG	2	6	138186	138191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455959
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3067	NC_020942	AG	3	6	138738	138743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_020942	GA	3	6	138801	138806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_020942	A	6	6	138817	138822	100 %	0 %	0 %	0 %	478455961
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3082	NC_020942	GAA	2	6	139480	139485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455961
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3094	NC_020942	AG	3	6	140272	140277	50 %	0 %	50 %	0 %	478455963
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3107	NC_020942	GCT	2	6	140753	140758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455964
3108	NC_020942	TCA	2	6	141018	141023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455964
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3110	NC_020942	GTACA	2	10	141237	141246	40 %	20 %	20 %	20 %	478455964
3111	NC_020942	AGA	2	6	141268	141273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455964
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3114	NC_020942	TAGAT	2	10	141610	141619	40 %	40 %	20 %	0 %	478455964
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3116	NC_020942	CTCC	2	8	141626	141633	0 %	25 %	0 %	75 %	478455964
3117	NC_020942	CTG	2	6	141642	141647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455964
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3119	NC_020942	TAT	2	6	141692	141697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455964
3120	NC_020942	TGG	2	6	141787	141792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455964
3121	NC_020942	TCA	2	6	141814	141819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455964
3122	NC_020942	TCT	2	6	141844	141849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455964
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3124	NC_020942	T	8	8	141932	141939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_020942	AG	3	6	148108	148113	50 %	0 %	50 %	0 %	478455971
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3366	NC_020942	TGC	2	6	152885	152890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455975
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3499	NC_020942	AGA	2	6	159095	159100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455981
3500	NC_020942	CAT	2	6	159104	159109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455981

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