MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2505	NC_020942	TC	4	8	114130	114137	0 %	50 %	0 %	50 %	478455937
2506	NC_020942	GCA	2	6	114172	114177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455937
2507	NC_020942	GCA	2	6	114181	114186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455937
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2515	NC_020942	A	8	8	114534	114541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2563	NC_020942	A	7	7	116439	116445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2606	NC_020942	TAA	2	6	118520	118525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2623	NC_020942	CTT	2	6	119077	119082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_020942	TTA	2	6	119099	119104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455943
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2626	NC_020942	TTC	2	6	119290	119295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455943
2627	NC_020942	TCC	2	6	119303	119308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455943
2628	NC_020942	TTTA	2	8	119321	119328	25 %	75 %	0 %	0 %	478455943
2629	NC_020942	CTG	2	6	119519	119524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455943
2630	NC_020942	AGA	2	6	119548	119553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455943
2631	NC_020942	TTGCCA	2	12	119571	119582	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478455943
2632	NC_020942	GA	4	8	119594	119601	50 %	0 %	50 %	0 %	478455943
2633	NC_020942	GAA	2	6	119608	119613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455943
2634	NC_020942	TTC	2	6	119647	119652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455943
2635	NC_020942	TACT	2	8	119709	119716	25 %	50 %	0 %	25 %	478455943
2636	NC_020942	GTT	2	6	119753	119758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455943
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2638	NC_020942	GAT	2	6	119804	119809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455943
2639	NC_020942	GAG	2	6	119835	119840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455943
2640	NC_020942	TC	3	6	119926	119931	0 %	50 %	0 %	50 %	478455943
2641	NC_020942	AG	3	6	120029	120034	50 %	0 %	50 %	0 %	478455944
2642	NC_020942	GCTA	2	8	120051	120058	25 %	25 %	25 %	25 %	478455944
2643	NC_020942	GA	3	6	120062	120067	50 %	0 %	50 %	0 %	478455944
2644	NC_020942	AAG	2	6	120070	120075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455944
2645	NC_020942	GCT	3	9	120076	120084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455944
2646	NC_020942	GTA	2	6	120135	120140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455944
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2648	NC_020942	TC	3	6	120150	120155	0 %	50 %	0 %	50 %	478455944
2649	NC_020942	GCTA	2	8	120183	120190	25 %	25 %	25 %	25 %	478455944
2650	NC_020942	CGGC	2	8	120232	120239	0 %	0 %	50 %	50 %	478455944
2651	NC_020942	AGC	2	6	120273	120278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455944
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2653	NC_020942	TCC	2	6	120294	120299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455944
2654	NC_020942	AG	3	6	120340	120345	50 %	0 %	50 %	0 %	478455944
2655	NC_020942	GA	4	8	120383	120390	50 %	0 %	50 %	0 %	478455944
2656	NC_020942	GGC	2	6	120423	120428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478455944
2657	NC_020942	T	6	6	120522	120527	0 %	100 %	0 %	0 %	478455944
2658	NC_020942	TCT	2	6	120607	120612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455944
2659	NC_020942	GA	3	6	120716	120721	50 %	0 %	50 %	0 %	478455944
2660	NC_020942	ATC	2	6	120810	120815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455944
2661	NC_020942	TCT	2	6	120884	120889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2662	NC_020942	GA	3	6	120891	120896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_020942	TAT	2	6	120915	120920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_020942	ATA	2	6	120936	120941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_020942	CTGG	2	8	120959	120966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2666	NC_020942	TAAAAA	2	12	121063	121074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_020942	TTGGTA	2	12	121111	121122	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478455945
2668	NC_020942	TG	3	6	121150	121155	0 %	50 %	50 %	0 %	478455945
2669	NC_020942	TCA	2	6	121158	121163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455945
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2672	NC_020942	TGC	2	6	121229	121234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455945
2673	NC_020942	CTG	2	6	121237	121242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455945
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2701	NC_020942	ATC	2	6	122870	122875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455945
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2703	NC_020942	GA	3	6	123017	123022	50 %	0 %	50 %	0 %	478455945
2704	NC_020942	GCTTC	2	10	123025	123034	0 %	40 %	20 %	40 %	478455945
2705	NC_020942	TCTA	2	8	123066	123073	25 %	50 %	0 %	25 %	478455945
2706	NC_020942	TA	3	6	123126	123131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2707	NC_020942	T	6	6	123172	123177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2708	NC_020942	ACT	2	6	123227	123232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455946
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2712	NC_020942	AGCT	2	8	123372	123379	25 %	25 %	25 %	25 %	478455946
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2718	NC_020942	TGA	2	6	123815	123820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455946
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2723	NC_020942	GT	3	6	124115	124120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2724	NC_020942	T	6	6	124159	124164	0 %	100 %	0 %	0 %	478455947
2725	NC_020942	GA	3	6	124237	124242	50 %	0 %	50 %	0 %	478455947
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2729	NC_020942	T	6	6	124318	124323	0 %	100 %	0 %	0 %	478455947
2730	NC_020942	TGGA	2	8	124328	124335	25 %	25 %	50 %	0 %	478455947
2731	NC_020942	GCAA	2	8	124363	124370	50 %	0 %	25 %	25 %	478455947
2732	NC_020942	TTA	2	6	124408	124413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455947
2733	NC_020942	TTA	2	6	124449	124454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455947
2734	NC_020942	GGA	2	6	124466	124471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455947
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2736	NC_020942	TTGCAT	2	12	124542	124553	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478455947
2737	NC_020942	A	7	7	124560	124566	100 %	0 %	0 %	0 %	478455947
2738	NC_020942	CTG	2	6	124569	124574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455947
2739	NC_020942	TGA	2	6	124596	124601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455947
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2741	NC_020942	ATCG	2	8	124628	124635	25 %	25 %	25 %	25 %	478455947
2742	NC_020942	AG	3	6	124649	124654	50 %	0 %	50 %	0 %	478455947
2743	NC_020942	AGC	2	6	124837	124842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455947
2744	NC_020942	TGT	2	6	124864	124869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455947
2745	NC_020942	TGA	2	6	124896	124901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455947
2746	NC_020942	AAGAGA	2	12	124911	124922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455947
2747	NC_020942	TAC	2	6	124949	124954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455947
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2998	NC_020942	CAG	2	6	135938	135943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455955
2999	NC_020942	A	6	6	136016	136021	100 %	0 %	0 %	0 %	478455955
3000	NC_020942	AGG	2	6	136090	136095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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